More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1280 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  56.76 
 
 		 590 aa  714    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  55.97 
 
 		 594 aa  696    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  58.54 
 
 		 594 aa  717    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  78 
 
 		 593 aa  971    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  58.54 
 
 		 594 aa  721    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  58.71 
 
 		 594 aa  722    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  58.71 
 
 		 594 aa  722    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  57.87 
 
 		 594 aa  708    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  58.54 
 
 		 594 aa  721    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  58.38 
 
 		 594 aa  713    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  55.8 
 
 		 593 aa  691    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  58.88 
 
 		 594 aa  721    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  58.57 
 
 		 596 aa  714    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  59.29 
 
 		 591 aa  733    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  55.8 
 
 		 593 aa  691    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  57.87 
 
 		 594 aa  708    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  63.62 
 
 		 658 aa  825    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 595 aa  1228    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  58.71 
 
 		 594 aa  722    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  49.41 
 
 		 610 aa  615  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0657  excinuclease ABC subunit C  48.39 
 
 		 603 aa  582  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000040695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  48.03 
 
 		 591 aa  569  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0520  excinuclease ABC subunit C  48.22 
 
 		 599 aa  558  1e-158  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.545432  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0871  excinuclease ABC subunit C  46.21 
 
 		 600 aa  545  1e-154  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1073  excinuclease ABC subunit C  46.34 
 
 		 607 aa  532  1e-150  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  42.6 
 
 		 628 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  41.52 
 
 		 593 aa  442  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  39.84 
 
 		 620 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 620 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  38.98 
 
 		 607 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  39.52 
 
 		 624 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  38.78 
 
 		 625 aa  423  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  41.03 
 
 		 616 aa  422  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  40.58 
 
 		 615 aa  413  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  38.27 
 
 		 613 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  37.9 
 
 		 641 aa  406  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  38.99 
 
 		 627 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  38.92 
 
 		 588 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  38.76 
 
 		 613 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  36.63 
 
 		 622 aa  402  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  38.84 
 
 		 629 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  40.07 
 
 		 616 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  38.49 
 
 		 653 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  36.27 
 
 		 619 aa  399  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  37.99 
 
 		 631 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  37.29 
 
 		 685 aa  392  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  38.47 
 
 		 613 aa  387  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  37.19 
 
 		 628 aa  388  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  35.81 
 
 		 611 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  35.6 
 
 		 614 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  37.21 
 
 		 665 aa  382  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  36.89 
 
 		 599 aa  376  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  37.71 
 
 		 615 aa  376  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  36.7 
 
 		 669 aa  378  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  35.64 
 
 		 628 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  37.48 
 
 		 604 aa  366  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  36.09 
 
 		 610 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  36.69 
 
 		 607 aa  365  1e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  37.09 
 
 		 612 aa  365  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  36.8 
 
 		 607 aa  365  2e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  37.07 
 
 		 602 aa  362  8e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  36.78 
 
 		 607 aa  360  4e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0424  excinuclease ABC subunit C  36.62 
 
 		 584 aa  360  6e-98  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.621059  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1509  excinuclease ABC, C subunit  37.58 
 
 		 594 aa  357  1.9999999999999998e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.94656  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  36.24 
 
 		 596 aa  357  1.9999999999999998e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  35.54 
 
 		 613 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  34.26 
 
 		 677 aa  356  5e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  36.03 
 
 		 610 aa  353  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  34.78 
 
 		 614 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  36.03 
 
 		 610 aa  352  8e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  36.03 
 
 		 610 aa  352  8e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  36.03 
 
 		 610 aa  352  8e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  36.03 
 
 		 610 aa  352  8e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  36.24 
 
 		 610 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  36.03 
 
 		 610 aa  352  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  36.08 
 
 		 610 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  36.08 
 
 		 610 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  35.77 
 
 		 609 aa  352  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  36.08 
 
 		 610 aa  352  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  37.07 
 
 		 613 aa  350  4e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  36.51 
 
 		 610 aa  350  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  35.87 
 
 		 610 aa  350  4e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  34.64 
 
 		 609 aa  350  5e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  36.08 
 
 		 636 aa  349  7e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  35.47 
 
 		 649 aa  349  8e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  35.57 
 
 		 617 aa  349  9e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  35.49 
 
 		 610 aa  349  9e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1822  excinuclease ABC subunit C  38.53 
 
 		 521 aa  348  1e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  35.57 
 
 		 617 aa  348  1e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  34.63 
 
 		 598 aa  348  1e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  33.54 
 
 		 652 aa  348  2e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  36.33 
 
 		 599 aa  348  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003099  excinuclease ABC subunit C  35.65 
 
 		 588 aa  348  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000908036  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  34.21 
 
 		 616 aa  347  4e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  35.69 
 
 		 610 aa  347  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  33.93 
 
 		 617 aa  347  4e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2397  excinuclease ABC subunit C  36.45 
 
 		 598 aa  347  5e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.866418 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  35.29 
 
 		 623 aa  346  8e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2151  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 609 aa  346  8e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  35.73 
 
 		 682 aa  345  1e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.914637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>