More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2021 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2550  excinuclease ABC, C subunit  60.09 
 
 		 675 aa  768    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5613  excinuclease ABC, C subunit  65.89 
 
 		 663 aa  825    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143768  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  62.77 
 
 		 646 aa  780    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  62.84 
 
 		 665 aa  820    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  58.36 
 
 		 650 aa  711    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  67.94 
 
 		 659 aa  848    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  61.67 
 
 		 671 aa  799    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  69.28 
 
 		 684 aa  871    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  61.5 
 
 		 649 aa  785    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 656 aa  1325    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0428  excinuclease ABC subunit C  47.83 
 
 		 746 aa  669    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  61.01 
 
 		 643 aa  756    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  63.93 
 
 		 660 aa  815    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  62.83 
 
 		 678 aa  787    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  62.62 
 
 		 708 aa  802    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2935  excinuclease ABC subunit C  66.31 
 
 		 704 aa  801    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13070  Excinuclease ABC subunit C  61.99 
 
 		 651 aa  748    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  65.1 
 
 		 705 aa  845    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  62.44 
 
 		 676 aa  788    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20070  Excinuclease ABC subunit C  65.96 
 
 		 703 aa  847    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0431256  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  69.24 
 
 		 670 aa  871    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  64.88 
 
 		 690 aa  811    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  63.34 
 
 		 658 aa  803    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  62.44 
 
 		 676 aa  788    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  67.12 
 
 		 693 aa  865    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  74.31 
 
 		 675 aa  958    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  72.33 
 
 		 649 aa  896    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  65.92 
 
 		 692 aa  851    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  61.25 
 
 		 678 aa  781    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1997  excinuclease ABC subunit C  70.5 
 
 		 644 aa  852    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.657306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2082  excinuclease ABC subunit C  62.07 
 
 		 669 aa  771    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649427  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  62.21 
 
 		 674 aa  777    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  62.79 
 
 		 641 aa  790    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  59.76 
 
 		 679 aa  773    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  61.8 
 
 		 647 aa  780    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  65.91 
 
 		 666 aa  838    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  62.44 
 
 		 676 aa  788    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0815  excinuclease ABC, C subunit  44.4 
 
 		 780 aa  627  1e-178  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  42.2 
 
 		 624 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  41.28 
 
 		 607 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0845  excinuclease ABC, C subunit  42 
 
 		 620 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.866518  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  39.8 
 
 		 588 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  41.8 
 
 		 647 aa  464  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  37.99 
 
 		 685 aa  462  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  38.18 
 
 		 625 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1784  excinuclease ABC, C subunit  39.72 
 
 		 737 aa  459  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  39.39 
 
 		 644 aa  459  9.999999999999999e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  40.94 
 
 		 611 aa  458  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  37.24 
 
 		 620 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  37.24 
 
 		 620 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  39.18 
 
 		 607 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  39.18 
 
 		 607 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  38.67 
 
 		 601 aa  450  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  40.44 
 
 		 653 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  39.47 
 
 		 613 aa  448  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  38.86 
 
 		 607 aa  442  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  38.9 
 
 		 641 aa  445  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  41.96 
 
 		 622 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  38.49 
 
 		 604 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  42.5 
 
 		 607 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  38.25 
 
 		 666 aa  437  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 		 613 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  40.45 
 
 		 614 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  37.01 
 
 		 615 aa  432  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  38.89 
 
 		 682 aa  432  1e-119  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  39.24 
 
 		 624 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  37.8 
 
 		 613 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1945  excinuclease ABC subunit C  40.54 
 
 		 643 aa  426  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  42.08 
 
 		 609 aa  428  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  38.19 
 
 		 617 aa  426  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  38.2 
 
 		 669 aa  425  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  38.78 
 
 		 638 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  38.31 
 
 		 616 aa  425  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  39.97 
 
 		 599 aa  422  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0046  excinuclease ABC subunit C  40.13 
 
 		 629 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.714841  hitchhiker  0.00962006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  38.89 
 
 		 665 aa  421  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  40.76 
 
 		 623 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  40.73 
 
 		 623 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  38.22 
 
 		 613 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  40.73 
 
 		 623 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  39.2 
 
 		 626 aa  412  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2878  excinuclease ABC, C subunit  38.07 
 
 		 682 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  37.4 
 
 		 635 aa  413  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  40.44 
 
 		 613 aa  415  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  38.16 
 
 		 607 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3104  excinuclease ABC, C subunit  37.91 
 
 		 682 aa  412  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299342  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  38.13 
 
 		 631 aa  410  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 619 aa  410  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  38 
 
 		 608 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  37.52 
 
 		 628 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3001  excinuclease ABC, C subunit  38.07 
 
 		 700 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5405  excinuclease ABC, C subunit  38.21 
 
 		 688 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  36.96 
 
 		 628 aa  402  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  38.19 
 
 		 627 aa  405  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  38.73 
 
 		 614 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  37.6 
 
 		 604 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  41.69 
 
 		 615 aa  405  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  37.74 
 
 		 622 aa  405  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  37.52 
 
 		 608 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  36.83 
 
 		 612 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>