More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2975 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  63.4 
 
 		 658 aa  795    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2550  excinuclease ABC, C subunit  62.26 
 
 		 675 aa  767    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  59.06 
 
 		 675 aa  753    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  66.82 
 
 		 660 aa  851    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  62.52 
 
 		 671 aa  801    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  59.6 
 
 		 674 aa  754    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1997  excinuclease ABC subunit C  64.32 
 
 		 644 aa  763    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.657306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  59.74 
 
 		 693 aa  772    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 		 708 aa  1440    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  65.09 
 
 		 646 aa  781    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  62.62 
 
 		 656 aa  782    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  62.63 
 
 		 690 aa  785    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  65.92 
 
 		 665 aa  851    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  61.17 
 
 		 705 aa  788    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  62.17 
 
 		 692 aa  783    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  61.26 
 
 		 684 aa  769    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  63.07 
 
 		 676 aa  774    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  60.13 
 
 		 643 aa  749    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2935  excinuclease ABC subunit C  61.18 
 
 		 704 aa  741    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  58.31 
 
 		 647 aa  719    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5613  excinuclease ABC, C subunit  63.29 
 
 		 663 aa  763    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143768  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  61.3 
 
 		 659 aa  764    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  61.87 
 
 		 670 aa  775    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  62.65 
 
 		 676 aa  775    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  64.04 
 
 		 649 aa  800    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  62.46 
 
 		 679 aa  786    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  63.45 
 
 		 678 aa  774    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13070  Excinuclease ABC subunit C  59.32 
 
 		 651 aa  704    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  56.6 
 
 		 650 aa  661    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2082  excinuclease ABC subunit C  58.84 
 
 		 669 aa  742    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649427  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  61.17 
 
 		 641 aa  754    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20070  Excinuclease ABC subunit C  60 
 
 		 703 aa  757    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0431256  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  62.22 
 
 		 666 aa  791    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  62.65 
 
 		 676 aa  775    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  63.01 
 
 		 649 aa  786    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  62.14 
 
 		 678 aa  771    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0815  excinuclease ABC, C subunit  41.43 
 
 		 780 aa  578  1.0000000000000001e-163  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  42.93 
 
 		 607 aa  507  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0845  excinuclease ABC, C subunit  44.22 
 
 		 620 aa  473  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.866518  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  41.55 
 
 		 624 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  39.51 
 
 		 607 aa  456  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  39.51 
 
 		 607 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  41.8 
 
 		 613 aa  448  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  40.26 
 
 		 601 aa  448  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  39.3 
 
 		 588 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  42.74 
 
 		 607 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  39.02 
 
 		 607 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  38.02 
 
 		 641 aa  433  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  39.14 
 
 		 644 aa  431  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  38.21 
 
 		 625 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  37.58 
 
 		 620 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  39.55 
 
 		 653 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  42.23 
 
 		 609 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  36.6 
 
 		 685 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  40.52 
 
 		 647 aa  427  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  41.29 
 
 		 611 aa  427  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  37.42 
 
 		 620 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  37.76 
 
 		 638 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  39.02 
 
 		 624 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  40.76 
 
 		 613 aa  420  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  37.62 
 
 		 613 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  39.16 
 
 		 622 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0428  excinuclease ABC subunit C  40.11 
 
 		 746 aa  416  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  38.52 
 
 		 613 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 607 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  39.94 
 
 		 677 aa  418  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  39.25 
 
 		 617 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  39.4 
 
 		 665 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1784  excinuclease ABC, C subunit  38.96 
 
 		 737 aa  415  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  39.94 
 
 		 608 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  39.25 
 
 		 617 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  39.81 
 
 		 617 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  37.38 
 
 		 615 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  39.61 
 
 		 608 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  41.19 
 
 		 614 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  37.21 
 
 		 669 aa  411  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  38.54 
 
 		 627 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  41.89 
 
 		 622 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  35.58 
 
 		 682 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  36.85 
 
 		 666 aa  406  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  39.58 
 
 		 607 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  39.94 
 
 		 607 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  39.42 
 
 		 607 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  39.42 
 
 		 607 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  40.88 
 
 		 607 aa  405  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  39.65 
 
 		 610 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  40.13 
 
 		 610 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  39.81 
 
 		 610 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  39.45 
 
 		 607 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  39.75 
 
 		 612 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  39.65 
 
 		 610 aa  400  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  38.27 
 
 		 625 aa  401  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  36.77 
 
 		 604 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  38.72 
 
 		 619 aa  402  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  39.65 
 
 		 610 aa  399  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  39.97 
 
 		 610 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 707 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  39.65 
 
 		 610 aa  399  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  38.8 
 
 		 707 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  40.13 
 
 		 610 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>