More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1544 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  65.6 
 
 
660 aa  824    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  69.55 
 
 
647 aa  917    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  65.17 
 
 
665 aa  833    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  66.26 
 
 
674 aa  850    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  65.54 
 
 
692 aa  842    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  65.36 
 
 
643 aa  835    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  61.3 
 
 
708 aa  797    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  66.41 
 
 
656 aa  856    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  68.29 
 
 
649 aa  852    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  64.08 
 
 
690 aa  795    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  61.26 
 
 
679 aa  787    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2550  excinuclease ABC, C subunit  62.33 
 
 
675 aa  780    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295738  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  62.9 
 
 
671 aa  822    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  78.09 
 
 
670 aa  1003    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2935  excinuclease ABC subunit C  70.18 
 
 
704 aa  853    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  62.42 
 
 
678 aa  797    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  62.31 
 
 
649 aa  789    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  63.65 
 
 
705 aa  827    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  65.55 
 
 
675 aa  832    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  70.83 
 
 
693 aa  917    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0428  excinuclease ABC subunit C  47.21 
 
 
746 aa  667    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  67.48 
 
 
684 aa  831    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  63.3 
 
 
658 aa  800    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  61.82 
 
 
676 aa  800    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5613  excinuclease ABC, C subunit  67.08 
 
 
663 aa  842    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143768  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13070  Excinuclease ABC subunit C  62.9 
 
 
651 aa  753    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20070  Excinuclease ABC subunit C  77.86 
 
 
703 aa  1023    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0431256  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  62.3 
 
 
676 aa  799    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1997  excinuclease ABC subunit C  67.7 
 
 
644 aa  832    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.657306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2082  excinuclease ABC subunit C  64.67 
 
 
669 aa  819    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649427  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  63.69 
 
 
646 aa  796    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  61.93 
 
 
641 aa  771    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 
659 aa  1339    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  66.46 
 
 
666 aa  825    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  61.82 
 
 
676 aa  800    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  63.09 
 
 
678 aa  796    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  61.78 
 
 
650 aa  771    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0815  excinuclease ABC, C subunit  43.94 
 
 
780 aa  632  1e-180  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  40.38 
 
 
624 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  37.82 
 
 
607 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  38.91 
 
 
644 aa  444  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  36.84 
 
 
625 aa  438  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0845  excinuclease ABC, C subunit  40.41 
 
 
620 aa  426  1e-118  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.866518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 
613 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  38.78 
 
 
601 aa  428  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1784  excinuclease ABC, C subunit  37.31 
 
 
737 aa  422  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  37.87 
 
 
666 aa  419  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  38.7 
 
 
653 aa  420  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  36.38 
 
 
685 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  36.32 
 
 
588 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  37.94 
 
 
682 aa  413  1e-114  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  38.72 
 
 
611 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  34.13 
 
 
620 aa  415  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  34.13 
 
 
620 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  36.09 
 
 
641 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 
624 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  36.33 
 
 
604 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  38.75 
 
 
647 aa  405  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1945  excinuclease ABC subunit C  38.45 
 
 
643 aa  403  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892148  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  38.13 
 
 
619 aa  403  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  37.07 
 
 
638 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  36.54 
 
 
616 aa  399  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  35.26 
 
 
615 aa  398  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  36.75 
 
 
622 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  39.97 
 
 
622 aa  392  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  34.63 
 
 
607 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  35.11 
 
 
607 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  35.57 
 
 
613 aa  395  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 
623 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  34.85 
 
 
607 aa  391  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4491  excinuclease ABC subunit C  38.76 
 
 
642 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.191027 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3001  excinuclease ABC, C subunit  37.64 
 
 
700 aa  392  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  34.29 
 
 
613 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1060  excinuclease ABC subunit C  38.24 
 
 
658 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41739  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  38.15 
 
 
599 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  36.41 
 
 
610 aa  391  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  38.68 
 
 
614 aa  392  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5405  excinuclease ABC, C subunit  37.97 
 
 
688 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  36.56 
 
 
627 aa  385  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09641  excinuclease ABC subunit C  33.55 
 
 
644 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  37.74 
 
 
644 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  36.75 
 
 
617 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0046  excinuclease ABC subunit C  38.28 
 
 
629 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.714841  hitchhiker  0.00962006 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09791  excinuclease ABC subunit C  33.23 
 
 
652 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  38.79 
 
 
607 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  38.78 
 
 
623 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  37.09 
 
 
628 aa  383  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  38.66 
 
 
639 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  35.7 
 
 
665 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  34.63 
 
 
669 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  38.78 
 
 
623 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  35.29 
 
 
625 aa  382  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09771  excinuclease ABC subunit C  33.07 
 
 
652 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  34.98 
 
 
628 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  36.78 
 
 
617 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3104  excinuclease ABC, C subunit  37.38 
 
 
682 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299342  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  38.59 
 
 
609 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0918  excinuclease ABC subunit C  32.91 
 
 
652 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.312337  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  36.78 
 
 
617 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2878  excinuclease ABC, C subunit  37.34 
 
 
682 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>