More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2395 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  99.85 
 
 
676 aa  1372    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  75.34 
 
 
671 aa  999    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  61.52 
 
 
670 aa  786    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  69.95 
 
 
649 aa  904    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  69.73 
 
 
658 aa  901    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  60.39 
 
 
675 aa  761    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  61.54 
 
 
693 aa  798    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  58.05 
 
 
647 aa  733    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  85.63 
 
 
678 aa  1162    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  56.08 
 
 
674 aa  728    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  62.44 
 
 
656 aa  789    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5613  excinuclease ABC, C subunit  60.74 
 
 
663 aa  786    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143768  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  68.5 
 
 
690 aa  871    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1997  excinuclease ABC subunit C  63.79 
 
 
644 aa  782    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.657306 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13070  Excinuclease ABC subunit C  59.59 
 
 
651 aa  734    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20070  Excinuclease ABC subunit C  59.8 
 
 
703 aa  763    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0431256  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  62.05 
 
 
705 aa  821    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  64.71 
 
 
665 aa  837    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  61.82 
 
 
659 aa  788    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2550  excinuclease ABC, C subunit  71.57 
 
 
675 aa  959    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295738  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  57.49 
 
 
643 aa  732    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  63.33 
 
 
692 aa  817    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  83.23 
 
 
646 aa  1060    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  60.23 
 
 
684 aa  760    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
676 aa  1375    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  56.34 
 
 
650 aa  679    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  65 
 
 
660 aa  838    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  62.8 
 
 
708 aa  800    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  66.57 
 
 
679 aa  881    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2935  excinuclease ABC subunit C  61.22 
 
 
704 aa  777    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2082  excinuclease ABC subunit C  58.23 
 
 
669 aa  726    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649427  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  61.63 
 
 
641 aa  764    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  63.05 
 
 
666 aa  783    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
676 aa  1375    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  63.98 
 
 
649 aa  806    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  82.8 
 
 
678 aa  1133    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0815  excinuclease ABC, C subunit  41.98 
 
 
780 aa  569  1e-161  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  42.23 
 
 
624 aa  485  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  39.25 
 
 
607 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  39.6 
 
 
641 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0428  excinuclease ABC subunit C  44.42 
 
 
746 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  37.83 
 
 
625 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0845  excinuclease ABC, C subunit  40.9 
 
 
620 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.866518  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  39.41 
 
 
588 aa  438  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  38.3 
 
 
601 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  40.13 
 
 
613 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  36.73 
 
 
685 aa  431  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  36.52 
 
 
613 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  37.91 
 
 
604 aa  428  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  36.91 
 
 
620 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  36.91 
 
 
620 aa  429  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  39.66 
 
 
653 aa  426  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  36.62 
 
 
607 aa  422  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  36.62 
 
 
607 aa  423  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  40.06 
 
 
647 aa  425  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  39.35 
 
 
611 aa  422  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  36.92 
 
 
607 aa  420  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  38.39 
 
 
624 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  37.56 
 
 
615 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  38.19 
 
 
665 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  41.48 
 
 
622 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  38.29 
 
 
617 aa  412  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  38.29 
 
 
619 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  40.82 
 
 
607 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  35.87 
 
 
669 aa  408  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  37.4 
 
 
638 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  37.95 
 
 
613 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  39.37 
 
 
623 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  38.26 
 
 
616 aa  405  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  37.85 
 
 
627 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  39.37 
 
 
623 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  37.5 
 
 
644 aa  399  9.999999999999999e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  36.97 
 
 
625 aa  402  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  38.28 
 
 
627 aa  402  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  38.74 
 
 
623 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  38.34 
 
 
628 aa  397  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  38.2 
 
 
599 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  38.96 
 
 
614 aa  399  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  37.81 
 
 
610 aa  399  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0046  excinuclease ABC subunit C  38.57 
 
 
629 aa  396  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.714841  hitchhiker  0.00962006 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  39.91 
 
 
609 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  36.22 
 
 
628 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0420  excinuclease ABC subunit C  39.41 
 
 
620 aa  391  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000882939  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  37.93 
 
 
629 aa  390  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  37.37 
 
 
677 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  37.33 
 
 
619 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  35.54 
 
 
682 aa  386  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  37.27 
 
 
613 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  35.93 
 
 
613 aa  384  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1945  excinuclease ABC subunit C  38.62 
 
 
643 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892148  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  37.55 
 
 
707 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  37.02 
 
 
628 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  35.7 
 
 
666 aa  384  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  36.66 
 
 
622 aa  385  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2488  excinuclease ABC subunit C  37.29 
 
 
716 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820608  normal  0.0424579 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  38.41 
 
 
613 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  37.19 
 
 
617 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  37.83 
 
 
614 aa  382  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  36.86 
 
 
631 aa  382  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  37.19 
 
 
617 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>