More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2737 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  52.64 
 
 		 615 aa  662    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 625 aa  1276    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  50.87 
 
 		 624 aa  638    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  59.1 
 
 		 613 aa  781    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  50.08 
 
 		 620 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  50.08 
 
 		 620 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  50.24 
 
 		 628 aa  615  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  45.91 
 
 		 607 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  47.67 
 
 		 588 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  45.56 
 
 		 613 aa  564  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  45.9 
 
 		 653 aa  554  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  46.63 
 
 		 641 aa  551  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  45.44 
 
 		 593 aa  536  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  43.44 
 
 		 685 aa  525  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  43.18 
 
 		 607 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  42.93 
 
 		 607 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  43.78 
 
 		 616 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  42.6 
 
 		 607 aa  514  1e-144  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  42.19 
 
 		 614 aa  502  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  42.86 
 
 		 622 aa  502  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  41.73 
 
 		 665 aa  498  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  41.17 
 
 		 669 aa  492  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  41.98 
 
 		 613 aa  476  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  41.71 
 
 		 591 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  40 
 
 		 601 aa  473  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  41.19 
 
 		 604 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  43.59 
 
 		 591 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  43.04 
 
 		 590 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  41.31 
 
 		 609 aa  457  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  37.72 
 
 		 649 aa  455  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  41.53 
 
 		 594 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  41.53 
 
 		 594 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  41.53 
 
 		 594 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  41.53 
 
 		 594 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  41.53 
 
 		 594 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  42.01 
 
 		 596 aa  449  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  41.53 
 
 		 594 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  38.56 
 
 		 613 aa  451  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  39.3 
 
 		 658 aa  451  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  41.69 
 
 		 594 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  38.18 
 
 		 656 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  41.53 
 
 		 594 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  39.18 
 
 		 619 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  41.21 
 
 		 594 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  41 
 
 		 594 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  40.32 
 
 		 610 aa  444  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  38.57 
 
 		 624 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  39.1 
 
 		 611 aa  439  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  38.01 
 
 		 644 aa  438  1e-121  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  39.87 
 
 		 598 aa  438  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  37.9 
 
 		 617 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  37.9 
 
 		 617 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  38.7 
 
 		 614 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  40.7 
 
 		 615 aa  434  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  38.1 
 
 		 678 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  38.24 
 
 		 666 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  38.8 
 
 		 627 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  36.46 
 
 		 675 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  38.21 
 
 		 708 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  38.98 
 
 		 607 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  37.46 
 
 		 693 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  36.82 
 
 		 671 aa  430  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  37.19 
 
 		 678 aa  432  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 		 660 aa  428  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  36.79 
 
 		 613 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  37.83 
 
 		 676 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  38.12 
 
 		 638 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1945  excinuclease ABC subunit C  38.72 
 
 		 643 aa  426  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  39.74 
 
 		 627 aa  426  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  36.39 
 
 		 665 aa  426  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  37.83 
 
 		 676 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  39.44 
 
 		 622 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  36.9 
 
 		 677 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  38.21 
 
 		 631 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  37.83 
 
 		 676 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  36.63 
 
 		 666 aa  424  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  38.21 
 
 		 643 aa  424  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  36.35 
 
 		 670 aa  425  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  39.25 
 
 		 629 aa  423  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  38.33 
 
 		 636 aa  425  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  38.79 
 
 		 616 aa  424  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  37.22 
 
 		 646 aa  424  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  38.78 
 
 		 595 aa  423  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  37.16 
 
 		 617 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  37.38 
 
 		 641 aa  424  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  38.67 
 
 		 594 aa  421  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  38.19 
 
 		 684 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  36.97 
 
 		 647 aa  421  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  37 
 
 		 659 aa  419  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  37.6 
 
 		 612 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  37.12 
 
 		 658 aa  419  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1558  excinuclease ABC subunit C  38.03 
 
 		 690 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  39.52 
 
 		 593 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  38.55 
 
 		 593 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  38.55 
 
 		 593 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  37.18 
 
 		 617 aa  419  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  35.96 
 
 		 692 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1086  excinuclease ABC subunit C  38.66 
 
 		 680 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000501867 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  36.58 
 
 		 611 aa  414  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2082  excinuclease ABC subunit C  36.52 
 
 		 669 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>