More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10610 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  72.1 
 
 		 682 aa  971    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1784  excinuclease ABC, C subunit  78.71 
 
 		 737 aa  1056    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 		 666 aa  1376    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  60.47 
 
 		 644 aa  794    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  40.32 
 
 		 607 aa  474  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  38.25 
 
 		 656 aa  429  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  39.81 
 
 		 611 aa  428  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  36.63 
 
 		 625 aa  424  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  38.33 
 
 		 624 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  36.15 
 
 		 620 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  37.12 
 
 		 613 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  35.86 
 
 		 675 aa  411  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  39.37 
 
 		 666 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  36.85 
 
 		 708 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  37.16 
 
 		 613 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  37.83 
 
 		 670 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  36.05 
 
 		 620 aa  409  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  37.09 
 
 		 643 aa  403  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  37.95 
 
 		 659 aa  405  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  36.02 
 
 		 693 aa  402  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  37.76 
 
 		 593 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  36.55 
 
 		 679 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  37.54 
 
 		 653 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2082  excinuclease ABC subunit C  36.99 
 
 		 669 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649427  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20070  Excinuclease ABC subunit C  37.99 
 
 		 703 aa  396  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0431256  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  35.98 
 
 		 671 aa  399  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  36.88 
 
 		 617 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  36.88 
 
 		 617 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  36.63 
 
 		 649 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  37.52 
 
 		 622 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  37.83 
 
 		 601 aa  395  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  36.11 
 
 		 674 aa  395  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  34.43 
 
 		 607 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  34.18 
 
 		 607 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5613  excinuclease ABC, C subunit  36.05 
 
 		 663 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143768  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  35.94 
 
 		 641 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  34.34 
 
 		 607 aa  388  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  36.16 
 
 		 614 aa  388  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  35.75 
 
 		 660 aa  388  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  35.53 
 
 		 658 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  35.7 
 
 		 649 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  34.94 
 
 		 615 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  35.64 
 
 		 665 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  36.34 
 
 		 678 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  37 
 
 		 647 aa  385  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  36.88 
 
 		 622 aa  385  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  35.58 
 
 		 641 aa  385  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  38.01 
 
 		 628 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  36.44 
 
 		 665 aa  382  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1997  excinuclease ABC subunit C  37.12 
 
 		 644 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.657306 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  35.19 
 
 		 588 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  36.29 
 
 		 619 aa  382  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  35.99 
 
 		 678 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  36.52 
 
 		 690 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  35.71 
 
 		 614 aa  379  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  35.46 
 
 		 669 aa  379  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  35.85 
 
 		 647 aa  378  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  34.97 
 
 		 604 aa  376  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  34.76 
 
 		 692 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  36.44 
 
 		 631 aa  379  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  32.94 
 
 		 685 aa  373  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  35.7 
 
 		 676 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  35.7 
 
 		 676 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  35.7 
 
 		 676 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  35.96 
 
 		 613 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  36.2 
 
 		 684 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  35.53 
 
 		 624 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  34.95 
 
 		 612 aa  372  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  35.86 
 
 		 628 aa  372  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13070  Excinuclease ABC subunit C  36.72 
 
 		 651 aa  370  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  33.96 
 
 		 613 aa  371  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  33.74 
 
 		 638 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  35.29 
 
 		 646 aa  372  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2550  excinuclease ABC, C subunit  34.79 
 
 		 675 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295738  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  36.99 
 
 		 650 aa  368  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  38.07 
 
 		 591 aa  369  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2935  excinuclease ABC subunit C  36.56 
 
 		 704 aa  365  1e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  35.93 
 
 		 616 aa  365  1e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0845  excinuclease ABC, C subunit  36.83 
 
 		 620 aa  362  2e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.866518  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  34.84 
 
 		 617 aa  361  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0815  excinuclease ABC, C subunit  32.69 
 
 		 780 aa  361  3e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  34.98 
 
 		 613 aa  360  6e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  35.82 
 
 		 623 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  33.97 
 
 		 705 aa  356  7.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  34.46 
 
 		 627 aa  356  7.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  35.13 
 
 		 629 aa  355  1e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  35.12 
 
 		 617 aa  355  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  34.66 
 
 		 599 aa  353  5e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  35.71 
 
 		 649 aa  353  5e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  33.54 
 
 		 625 aa  353  8e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  36.02 
 
 		 593 aa  352  8.999999999999999e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  36.02 
 
 		 593 aa  352  8.999999999999999e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  34.58 
 
 		 610 aa  352  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  35.2 
 
 		 677 aa  352  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  36.39 
 
 		 594 aa  351  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  36.65 
 
 		 594 aa  350  5e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  36.65 
 
 		 594 aa  350  5e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  36.65 
 
 		 594 aa  350  5e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  34.12 
 
 		 627 aa  348  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 628 aa  349  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>