More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0553 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  54.35 
 
 		 613 aa  657    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 612 aa  1238    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  55.09 
 
 		 614 aa  670    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  52.9 
 
 		 636 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  51.34 
 
 		 617 aa  619  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  51.17 
 
 		 649 aa  616  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  51.16 
 
 		 623 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  50.67 
 
 		 604 aa  578  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  45.71 
 
 		 707 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2488  excinuclease ABC subunit C  44.97 
 
 		 716 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820608  normal  0.0424579 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  45.55 
 
 		 707 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  45.55 
 
 		 707 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  43.41 
 
 		 677 aa  492  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  42.04 
 
 		 607 aa  490  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5066  excinuclease ABC, C subunit  43.76 
 
 		 689 aa  478  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  42.04 
 
 		 626 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  42.45 
 
 		 588 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  42.74 
 
 		 613 aa  465  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  40.19 
 
 		 624 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  40.69 
 
 		 598 aa  458  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  43.38 
 
 		 636 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  39.84 
 
 		 607 aa  443  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  39.84 
 
 		 607 aa  445  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  38.15 
 
 		 620 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  38.15 
 
 		 620 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  38.77 
 
 		 615 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  38.66 
 
 		 641 aa  442  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  37.6 
 
 		 625 aa  434  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  41.97 
 
 		 614 aa  435  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  38.69 
 
 		 607 aa  430  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  42.1 
 
 		 607 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  36.53 
 
 		 685 aa  423  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  39.75 
 
 		 653 aa  422  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  38.34 
 
 		 613 aa  420  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  41.94 
 
 		 610 aa  420  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  41.78 
 
 		 611 aa  420  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  39.8 
 
 		 601 aa  421  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  40.29 
 
 		 609 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  36.5 
 
 		 613 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  39.15 
 
 		 669 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  40.32 
 
 		 616 aa  410  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  40.96 
 
 		 619 aa  411  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  39.78 
 
 		 628 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  39.75 
 
 		 708 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  39.44 
 
 		 646 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  37.67 
 
 		 613 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  39.24 
 
 		 665 aa  408  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  40.86 
 
 		 591 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  37.18 
 
 		 628 aa  403  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  39.58 
 
 		 622 aa  403  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  37.84 
 
 		 671 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  36.62 
 
 		 604 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  39.77 
 
 		 604 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  38.7 
 
 		 610 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  40.67 
 
 		 611 aa  402  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  39.04 
 
 		 617 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1783  excinuclease ABC subunit C  38.78 
 
 		 610 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0533171  hitchhiker  0.000000162173 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1861  excinuclease ABC subunit C  38.61 
 
 		 609 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  39.04 
 
 		 617 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1391  excinuclease ABC, C subunit  40.13 
 
 		 605 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2676  excinuclease ABC subunit C  38.94 
 
 		 609 aa  399  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2599  excinuclease ABC subunit C  38.78 
 
 		 609 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00115318  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 613 aa  397  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  39.57 
 
 		 610 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  38.4 
 
 		 658 aa  399  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  39.04 
 
 		 610 aa  398  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1548  excinuclease ABC subunit C  38.61 
 
 		 609 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1615  excinuclease ABC subunit C  38.61 
 
 		 609 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000543557  normal  0.3636 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  38.56 
 
 		 594 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  36.22 
 
 		 638 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  37.29 
 
 		 656 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  38.56 
 
 		 599 aa  395  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2175  excinuclease ABC subunit C  37.27 
 
 		 688 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5613  excinuclease ABC, C subunit  36.84 
 
 		 663 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143768  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  36.36 
 
 		 644 aa  394  1e-108  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2561  excinuclease ABC subunit C  38.61 
 
 		 609 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00257936  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  35.18 
 
 		 593 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1609  excinuclease ABC subunit C  38.45 
 
 		 609 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000167064  normal  0.0818954 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  38.8 
 
 		 666 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  38.24 
 
 		 594 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  38.4 
 
 		 594 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  38.4 
 
 		 594 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  38.44 
 
 		 617 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  38.4 
 
 		 594 aa  392  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  39.28 
 
 		 590 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  38.99 
 
 		 596 aa  391  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  38.44 
 
 		 617 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  38.03 
 
 		 635 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  38.4 
 
 		 594 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  38.31 
 
 		 631 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1608  excinuclease ABC subunit C  39.14 
 
 		 606 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00130294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  38.4 
 
 		 594 aa  389  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  38.4 
 
 		 594 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  38.45 
 
 		 623 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  38.4 
 
 		 594 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  39.2 
 
 		 608 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0659  excinuclease ABC subunit C  38.17 
 
 		 609 aa  386  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.25379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  39.37 
 
 		 608 aa  389  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2668  excinuclease ABC subunit C  37.66 
 
 		 610 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146387  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  38.94 
 
 		 623 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>