More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5066 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5066  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 		 689 aa  1397    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2488  excinuclease ABC subunit C  45.08 
 
 		 716 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820608  normal  0.0424579 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  43.47 
 
 		 707 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  44.08 
 
 		 707 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  44.08 
 
 		 707 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  44.23 
 
 		 614 aa  500  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  43.64 
 
 		 612 aa  490  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  42.63 
 
 		 613 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  42.3 
 
 		 636 aa  485  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  43.68 
 
 		 617 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  43.09 
 
 		 588 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  40.97 
 
 		 613 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  41.93 
 
 		 623 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  40.65 
 
 		 624 aa  465  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  41.69 
 
 		 649 aa  464  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  42.61 
 
 		 604 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  39.25 
 
 		 607 aa  462  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  40.72 
 
 		 677 aa  445  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  41.44 
 
 		 653 aa  440  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  39.97 
 
 		 626 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  38.43 
 
 		 685 aa  435  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  42.06 
 
 		 614 aa  430  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  37.99 
 
 		 615 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  39.09 
 
 		 626 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0328  excinuclease ABC subunit C  37.13 
 
 		 640 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.462253  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  40 
 
 		 669 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10011  excinuclease ABC subunit C  36.52 
 
 		 640 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.404154  normal  0.496638 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  37.46 
 
 		 607 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  37.46 
 
 		 607 aa  419  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  36.73 
 
 		 625 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  41.93 
 
 		 622 aa  419  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  36.83 
 
 		 607 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  40.19 
 
 		 607 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  40.67 
 
 		 665 aa  412  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  38.81 
 
 		 611 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  36.98 
 
 		 641 aa  409  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  36.99 
 
 		 620 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  36.93 
 
 		 617 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  36.94 
 
 		 617 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  36.29 
 
 		 613 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  35.78 
 
 		 613 aa  401  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  38.32 
 
 		 610 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  36.94 
 
 		 617 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  36.99 
 
 		 620 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  36.93 
 
 		 617 aa  402  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  37.23 
 
 		 610 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 613 aa  397  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  39.94 
 
 		 675 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  37.46 
 
 		 610 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  36.84 
 
 		 610 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  36.65 
 
 		 610 aa  393  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  36.84 
 
 		 610 aa  393  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  36.84 
 
 		 610 aa  393  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  36.84 
 
 		 610 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  36.84 
 
 		 610 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  37.62 
 
 		 636 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  36.69 
 
 		 610 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  39.2 
 
 		 656 aa  392  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  39.85 
 
 		 649 aa  392  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1451  excinuclease ABC subunit C  36.04 
 
 		 610 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  35.78 
 
 		 638 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  37.21 
 
 		 607 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2500  excinuclease ABC subunit C  37.15 
 
 		 607 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000123696  normal  0.60847 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  36.35 
 
 		 610 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  36.56 
 
 		 627 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  36.35 
 
 		 610 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  36.65 
 
 		 612 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2449  excinuclease ABC subunit C  36.95 
 
 		 608 aa  388  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0823614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  36.85 
 
 		 608 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  36.5 
 
 		 610 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  36.5 
 
 		 610 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1391  excinuclease ABC, C subunit  37.14 
 
 		 605 aa  386  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  36.23 
 
 		 610 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  37.21 
 
 		 624 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  37.21 
 
 		 607 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  37.36 
 
 		 607 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  37.05 
 
 		 608 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  38.32 
 
 		 708 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  39.97 
 
 		 615 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  35.52 
 
 		 604 aa  385  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20070  Excinuclease ABC subunit C  38.02 
 
 		 703 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0431256  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  36.99 
 
 		 591 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2668  excinuclease ABC subunit C  36.89 
 
 		 610 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146387  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  38.24 
 
 		 671 aa  385  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01878  excinuclease ABC subunit C  36.62 
 
 		 588 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000583054  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  39.44 
 
 		 659 aa  381  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  36.03 
 
 		 607 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  36.51 
 
 		 594 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  36.35 
 
 		 594 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  36.35 
 
 		 594 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  36.03 
 
 		 607 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  35.21 
 
 		 599 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  36.42 
 
 		 607 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1519  excinuclease ABC subunit C  35.74 
 
 		 610 aa  382  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0983209  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  36.51 
 
 		 594 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0918  excinuclease ABC subunit C  35.42 
 
 		 652 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.312337  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09771  excinuclease ABC subunit C  35.74 
 
 		 652 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  39.21 
 
 		 611 aa  382  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  36.73 
 
 		 607 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  36.35 
 
 		 594 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>