More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0579 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  56.3 
 
 		 613 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  52.93 
 
 		 649 aa  635    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  55.93 
 
 		 614 aa  665    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  55.59 
 
 		 636 aa  671    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 604 aa  1226    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  61.03 
 
 		 617 aa  736    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  52.93 
 
 		 623 aa  633  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  50.42 
 
 		 612 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  44.65 
 
 		 677 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  41.49 
 
 		 624 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  43.06 
 
 		 707 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  42.9 
 
 		 707 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  42.75 
 
 		 707 aa  465  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2488  excinuclease ABC subunit C  41.59 
 
 		 716 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820608  normal  0.0424579 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5066  excinuclease ABC, C subunit  42.45 
 
 		 689 aa  455  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  40.7 
 
 		 588 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  42.05 
 
 		 626 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  41 
 
 		 641 aa  447  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  39.25 
 
 		 607 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  41.37 
 
 		 613 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  40.55 
 
 		 607 aa  440  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  40.39 
 
 		 607 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  38.66 
 
 		 615 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  42.7 
 
 		 614 aa  431  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  40.23 
 
 		 607 aa  429  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  38.99 
 
 		 613 aa  423  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  36.93 
 
 		 625 aa  423  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  39.58 
 
 		 669 aa  421  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  39.54 
 
 		 653 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  36.68 
 
 		 598 aa  415  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  42.04 
 
 		 610 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  39.01 
 
 		 665 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  39.07 
 
 		 599 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  37.7 
 
 		 613 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  35.15 
 
 		 685 aa  403  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  36.26 
 
 		 610 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  39.83 
 
 		 607 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  37.85 
 
 		 626 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  37.97 
 
 		 617 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  37.97 
 
 		 617 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  40.88 
 
 		 636 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  37.64 
 
 		 625 aa  395  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  35.39 
 
 		 620 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  35.55 
 
 		 620 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1391  excinuclease ABC, C subunit  40.1 
 
 		 605 aa  393  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  37.66 
 
 		 622 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  38.22 
 
 		 617 aa  393  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  38.77 
 
 		 599 aa  391  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  39.68 
 
 		 622 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  37.79 
 
 		 611 aa  391  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  38.51 
 
 		 613 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  39.73 
 
 		 609 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  33.87 
 
 		 613 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  39.49 
 
 		 708 aa  392  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  37.77 
 
 		 594 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  37.77 
 
 		 594 aa  386  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  37.77 
 
 		 594 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  38.68 
 
 		 624 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  37.77 
 
 		 594 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  41.57 
 
 		 615 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  37.52 
 
 		 610 aa  385  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  37.52 
 
 		 610 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  37.93 
 
 		 594 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  37.77 
 
 		 594 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  37.52 
 
 		 610 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  37.52 
 
 		 610 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  37.93 
 
 		 594 aa  385  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  36.66 
 
 		 617 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  37.77 
 
 		 594 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  37.52 
 
 		 610 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  37.52 
 
 		 610 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  39.01 
 
 		 658 aa  385  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  37.52 
 
 		 610 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  37.93 
 
 		 594 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  36.14 
 
 		 638 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  37.52 
 
 		 610 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1519  excinuclease ABC subunit C  36.8 
 
 		 610 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0983209  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  37.89 
 
 		 591 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  35.89 
 
 		 644 aa  382  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  37.42 
 
 		 627 aa  382  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  37.52 
 
 		 610 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  34.69 
 
 		 604 aa  381  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  37.87 
 
 		 604 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  37.52 
 
 		 610 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  36.66 
 
 		 617 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  37.6 
 
 		 594 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  39.33 
 
 		 590 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  36.66 
 
 		 610 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  37.02 
 
 		 610 aa  379  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  38.02 
 
 		 619 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  37.74 
 
 		 619 aa  378  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  37.36 
 
 		 610 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  35.01 
 
 		 593 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  39.11 
 
 		 616 aa  376  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  36.26 
 
 		 609 aa  379  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1334  excinuclease ABC subunit C  38.81 
 
 		 609 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000285239  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  37.66 
 
 		 596 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  39.09 
 
 		 611 aa  378  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  35.76 
 
 		 601 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  37.19 
 
 		 610 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>