More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1391 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1391  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 		 605 aa  1230    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  55.02 
 
 		 636 aa  663    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2175  excinuclease ABC subunit C  48.42 
 
 		 688 aa  552  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  40.89 
 
 		 626 aa  427  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  41.65 
 
 		 677 aa  422  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  39.61 
 
 		 612 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  38.59 
 
 		 588 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  39.71 
 
 		 604 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  39.36 
 
 		 613 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  38.2 
 
 		 649 aa  382  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  37.7 
 
 		 623 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  39.35 
 
 		 614 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  37.5 
 
 		 607 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5066  excinuclease ABC, C subunit  37.15 
 
 		 689 aa  372  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2500  excinuclease ABC subunit C  38.01 
 
 		 607 aa  371  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000123696  normal  0.60847 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  37.83 
 
 		 613 aa  372  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  34.3 
 
 		 624 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  37.09 
 
 		 617 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  37.85 
 
 		 610 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  35.08 
 
 		 607 aa  367  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  38.66 
 
 		 610 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  37.01 
 
 		 616 aa  369  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  37.85 
 
 		 610 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  37.85 
 
 		 610 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  37.85 
 
 		 610 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  38.01 
 
 		 610 aa  369  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  37.85 
 
 		 610 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  37.85 
 
 		 610 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  35.19 
 
 		 607 aa  369  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  35.87 
 
 		 628 aa  364  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  39.25 
 
 		 617 aa  364  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  38.45 
 
 		 607 aa  363  6e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  37.6 
 
 		 604 aa  363  6e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  35.3 
 
 		 613 aa  362  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  36.79 
 
 		 614 aa  361  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  38.47 
 
 		 611 aa  361  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1519  excinuclease ABC subunit C  37.79 
 
 		 610 aa  360  3e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0983209  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  37.99 
 
 		 610 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  38.69 
 
 		 608 aa  360  4e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  38.49 
 
 		 607 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  37.99 
 
 		 610 aa  360  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  38.28 
 
 		 607 aa  360  6e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  37.99 
 
 		 610 aa  360  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  37.82 
 
 		 610 aa  359  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  38.24 
 
 		 613 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01878  excinuclease ABC subunit C  38.19 
 
 		 588 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000583054  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1451  excinuclease ABC subunit C  37.28 
 
 		 610 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  33.84 
 
 		 598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  36.17 
 
 		 601 aa  358  1.9999999999999998e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1608  excinuclease ABC subunit C  37.24 
 
 		 606 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00130294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  38.28 
 
 		 608 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  37.66 
 
 		 610 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  38.61 
 
 		 607 aa  357  5e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  35.86 
 
 		 619 aa  356  5.999999999999999e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  37.18 
 
 		 591 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  35.6 
 
 		 635 aa  356  5.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  36.23 
 
 		 636 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  34.7 
 
 		 607 aa  356  7.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 		 639 aa  355  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  36.9 
 
 		 603 aa  355  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1803  excinuclease ABC, C subunit  37.46 
 
 		 657 aa  354  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0340936  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  32.58 
 
 		 615 aa  353  4e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  37.02 
 
 		 599 aa  353  5e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  38.95 
 
 		 607 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  38.42 
 
 		 585 aa  353  7e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2668  excinuclease ABC subunit C  38.36 
 
 		 610 aa  352  8.999999999999999e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146387  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  34.55 
 
 		 641 aa  352  8.999999999999999e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  37.22 
 
 		 610 aa  352  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  37.22 
 
 		 617 aa  352  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  37.22 
 
 		 617 aa  352  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  37.14 
 
 		 622 aa  347  5e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  36.05 
 
 		 626 aa  346  6e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  36.66 
 
 		 611 aa  345  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  37.94 
 
 		 607 aa  344  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  35.43 
 
 		 599 aa  344  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  37.29 
 
 		 607 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1595  excinuclease ABC subunit C  37.54 
 
 		 610 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.31766  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  35.77 
 
 		 653 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0834  excinuclease ABC subunit C  35.99 
 
 		 610 aa  344  2.9999999999999997e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000370037  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  37.48 
 
 		 615 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  35.25 
 
 		 612 aa  342  8e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  36.87 
 
 		 619 aa  342  9e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2140  excinuclease ABC subunit C  35.35 
 
 		 608 aa  342  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.604529  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4491  excinuclease ABC subunit C  37.34 
 
 		 642 aa  342  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.191027 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  38.53 
 
 		 609 aa  342  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1334  excinuclease ABC subunit C  36.99 
 
 		 609 aa  341  2e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000285239  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2013  excinuclease ABC subunit C  36.68 
 
 		 614 aa  341  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.117598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1615  excinuclease ABC subunit C  35.02 
 
 		 609 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000543557  normal  0.3636 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  36.53 
 
 		 610 aa  340  5e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2316  excinuclease ABC subunit C  36.78 
 
 		 645 aa  340  5e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.682688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3241  excinuclease ABC, C subunit  35.87 
 
 		 607 aa  340  5.9999999999999996e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0161382  hitchhiker  0.00210477 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  36.97 
 
 		 594 aa  339  8e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  36.97 
 
 		 594 aa  339  8e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  36.97 
 
 		 594 aa  339  8e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1276  excinuclease ABC subunit C  36.82 
 
 		 609 aa  339  8e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00138903  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  36.8 
 
 		 607 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0420  excinuclease ABC subunit C  36.05 
 
 		 620 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000882939  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  34.91 
 
 		 666 aa  339  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1861  excinuclease ABC subunit C  34.85 
 
 		 609 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  36.97 
 
 		 594 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>