More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2175 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0581  excinuclease ABC subunit C  59.83 
 
 		 687 aa  793    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9728  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1014  excinuclease ABC subunit C  58.03 
 
 		 700 aa  785    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00594805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2845  excinuclease ABC subunit C  59.63 
 
 		 762 aa  809    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2175  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 688 aa  1381    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1391  excinuclease ABC, C subunit  48.42 
 
 		 605 aa  551  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  54.63 
 
 		 636 aa  359  8e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  35.78 
 
 		 604 aa  355  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  34.38 
 
 		 617 aa  353  4e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  35.14 
 
 		 649 aa  343  5e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  32.38 
 
 		 588 aa  343  5e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  34.98 
 
 		 623 aa  341  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  35.25 
 
 		 614 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  31.24 
 
 		 607 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  32.21 
 
 		 601 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  36.09 
 
 		 611 aa  322  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  31.16 
 
 		 598 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  33.43 
 
 		 604 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  31.26 
 
 		 607 aa  321  3e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  32.49 
 
 		 636 aa  318  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  30.96 
 
 		 607 aa  318  3e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  34.07 
 
 		 623 aa  318  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  34.08 
 
 		 623 aa  317  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  33.97 
 
 		 623 aa  317  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  33.28 
 
 		 599 aa  317  6e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  34.33 
 
 		 603 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  34.38 
 
 		 607 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  32.06 
 
 		 613 aa  313  5.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  31.78 
 
 		 616 aa  312  1e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  32.21 
 
 		 610 aa  311  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  32.49 
 
 		 619 aa  312  2e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  34.32 
 
 		 611 aa  311  4e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  34.35 
 
 		 708 aa  309  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  32.63 
 
 		 656 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  32.49 
 
 		 612 aa  308  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  31.05 
 
 		 596 aa  306  6e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  33.88 
 
 		 615 aa  306  7e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  31.32 
 
 		 628 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3241  excinuclease ABC, C subunit  33.03 
 
 		 607 aa  306  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0161382  hitchhiker  0.00210477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  33.48 
 
 		 631 aa  305  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  32.73 
 
 		 675 aa  305  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  33 
 
 		 653 aa  303  5.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1783  excinuclease ABC subunit C  31.33 
 
 		 610 aa  303  9e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0533171  hitchhiker  0.000000162173 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 631 aa  303  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2599  excinuclease ABC subunit C  31.33 
 
 		 609 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00115318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2676  excinuclease ABC subunit C  31.33 
 
 		 609 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  34.33 
 
 		 607 aa  300  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  32.83 
 
 		 705 aa  300  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1803  excinuclease ABC, C subunit  33.04 
 
 		 657 aa  300  6e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0340936  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2561  excinuclease ABC subunit C  31.18 
 
 		 609 aa  300  7e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00257936  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1825  excinuclease ABC subunit C  31.64 
 
 		 609 aa  299  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.088783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  32.09 
 
 		 679 aa  299  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3270  excinuclease ABC subunit C  30.27 
 
 		 639 aa  298  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150435  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1548  excinuclease ABC subunit C  30.78 
 
 		 609 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  32.44 
 
 		 647 aa  298  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  31.48 
 
 		 671 aa  298  3e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1615  excinuclease ABC subunit C  30.78 
 
 		 609 aa  297  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000543557  normal  0.3636 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  30.99 
 
 		 627 aa  297  5e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  33.38 
 
 		 678 aa  296  6e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  32.87 
 
 		 678 aa  296  8e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2151  excinuclease ABC subunit C  30.79 
 
 		 609 aa  296  9e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  30.89 
 
 		 628 aa  296  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2276  excinuclease ABC, C subunit  32.06 
 
 		 644 aa  296  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  30.8 
 
 		 658 aa  295  2e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  30.9 
 
 		 609 aa  294  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  31.53 
 
 		 625 aa  294  4e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1609  excinuclease ABC subunit C  30.63 
 
 		 609 aa  294  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000167064  normal  0.0818954 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  29.9 
 
 		 624 aa  292  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0516  excinuclease ABC subunit C  31.52 
 
 		 658 aa  292  1e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0659  excinuclease ABC subunit C  29.73 
 
 		 609 aa  293  1e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.25379  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  29.38 
 
 		 615 aa  292  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09771  excinuclease ABC subunit C  28.61 
 
 		 652 aa  292  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1861  excinuclease ABC subunit C  30.33 
 
 		 609 aa  291  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0918  excinuclease ABC subunit C  28.47 
 
 		 652 aa  291  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.312337  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  30.24 
 
 		 527 aa  291  4e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09791  excinuclease ABC subunit C  28.33 
 
 		 652 aa  290  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0782  excinuclease ABC subunit C  31.92 
 
 		 674 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191761  normal  0.0714693 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  31.52 
 
 		 629 aa  290  8e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  31.85 
 
 		 666 aa  289  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  29.23 
 
 		 685 aa  288  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  29.69 
 
 		 618 aa  287  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1640  excinuclease ABC subunit C  30.78 
 
 		 609 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00105988  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  33.57 
 
 		 676 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1281  excinuclease ABC subunit C  32.38 
 
 		 695 aa  287  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280524  normal  0.136737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  33.57 
 
 		 676 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  33.57 
 
 		 676 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  30.86 
 
 		 631 aa  286  9e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  29.6 
 
 		 618 aa  286  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  31.36 
 
 		 617 aa  286  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  32.16 
 
 		 658 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2312  excinuclease ABC subunit C  33.19 
 
 		 623 aa  285  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136814 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  32.82 
 
 		 641 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0046  excinuclease ABC subunit C  32.45 
 
 		 629 aa  284  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.714841  hitchhiker  0.00962006 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  32.05 
 
 		 609 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  45.31 
 
 		 626 aa  283  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  31.51 
 
 		 610 aa  282  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  31.51 
 
 		 617 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0663  excinuclease ABC subunit C  31.68 
 
 		 681 aa  281  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.912465  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1143  excinuclease ABC subunit C  31.68 
 
 		 681 aa  281  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1101  excinuclease ABC subunit C  31.62 
 
 		 682 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  31.77 
 
 		 674 aa  280  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.263968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>