More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1749 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  59.51 
 
 
519 aa  656    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  93.55 
 
 
527 aa  990    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0854  excinuclease ABC subunit C  91.84 
 
 
526 aa  967    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
527 aa  1055    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1600  excinuclease ABC subunit C  77.8 
 
 
527 aa  846    Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0084899  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  56.74 
 
 
520 aa  598  1e-170  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1822  excinuclease ABC subunit C  51.24 
 
 
521 aa  585  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201866  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  53.79 
 
 
517 aa  585  1e-166  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1321  excinuclease ABC subunit C  53.61 
 
 
516 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0107777  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  52.66 
 
 
520 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1103  excinuclease ABC subunit C  44.51 
 
 
528 aa  429  1e-119  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  42.75 
 
 
607 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  38.48 
 
 
624 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  38.43 
 
 
604 aa  376  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  38.92 
 
 
616 aa  370  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  38.5 
 
 
619 aa  371  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  38.41 
 
 
599 aa  366  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  38.21 
 
 
615 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  39.2 
 
 
631 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0044  excinuclease ABC, C subunit  39.53 
 
 
613 aa  365  1e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.101531  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  36.85 
 
 
601 aa  365  1e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  38.86 
 
 
628 aa  364  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 
627 aa  363  4e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  36.17 
 
 
611 aa  361  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  37.33 
 
 
685 aa  357  2.9999999999999997e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  34.23 
 
 
614 aa  355  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  35.26 
 
 
628 aa  353  5e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  38.62 
 
 
602 aa  353  5e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  36.12 
 
 
622 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  38.41 
 
 
596 aa  352  7e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  35.1 
 
 
613 aa  352  8e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  38.17 
 
 
610 aa  352  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  36.84 
 
 
607 aa  351  2e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  35.73 
 
 
607 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  36.84 
 
 
607 aa  350  3e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  36.27 
 
 
641 aa  350  5e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  39.42 
 
 
593 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  37.97 
 
 
597 aa  345  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  37.14 
 
 
607 aa  345  1e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  37.96 
 
 
598 aa  345  1e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  38.32 
 
 
596 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  38.36 
 
 
596 aa  343  4e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  35.38 
 
 
644 aa  343  4e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  36.16 
 
 
588 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  38.77 
 
 
603 aa  341  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  37.7 
 
 
599 aa  341  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  37.14 
 
 
629 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  35.45 
 
 
607 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  35.05 
 
 
613 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  35.85 
 
 
613 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  37.17 
 
 
610 aa  335  9e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  36.57 
 
 
652 aa  335  2e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  34.55 
 
 
591 aa  334  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  38.59 
 
 
595 aa  334  2e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  35.09 
 
 
626 aa  333  4e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  33.94 
 
 
612 aa  332  9e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  34.86 
 
 
609 aa  332  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  36.94 
 
 
620 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  38.94 
 
 
594 aa  331  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  36.94 
 
 
620 aa  331  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  35.99 
 
 
625 aa  330  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  38.64 
 
 
594 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  32.05 
 
 
707 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  34.97 
 
 
607 aa  330  5.0000000000000004e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  34.12 
 
 
626 aa  329  6e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  38.09 
 
 
615 aa  329  9e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  38.94 
 
 
594 aa  329  9e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  38.57 
 
 
594 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  38.57 
 
 
594 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  38.57 
 
 
594 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  35.28 
 
 
607 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  38.76 
 
 
594 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  38.57 
 
 
594 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  35.66 
 
 
614 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  38.57 
 
 
594 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  37.25 
 
 
591 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  34.92 
 
 
607 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  34.55 
 
 
607 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  34.92 
 
 
607 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  32.29 
 
 
666 aa  327  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  31.71 
 
 
707 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  36.07 
 
 
613 aa  326  7e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  33.39 
 
 
653 aa  326  7e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  38.8 
 
 
594 aa  326  7e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  33.8 
 
 
666 aa  326  8.000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  36.26 
 
 
598 aa  326  8.000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  35.44 
 
 
603 aa  325  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  37.73 
 
 
596 aa  325  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  37.18 
 
 
593 aa  325  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  37.18 
 
 
593 aa  325  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  34.61 
 
 
611 aa  325  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  36.03 
 
 
590 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  31.54 
 
 
707 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10011  excinuclease ABC subunit C  35.08 
 
 
640 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.404154  normal  0.496638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  35.24 
 
 
617 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  34.53 
 
 
615 aa  324  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  33.03 
 
 
608 aa  323  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0328  excinuclease ABC subunit C  35.08 
 
 
640 aa  323  4e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.462253  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  33.57 
 
 
682 aa  323  4e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  38.01 
 
 
593 aa  323  5e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>