More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0158 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0854  excinuclease ABC subunit C  92.98 
 
 		 526 aa  976    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  59.7 
 
 		 519 aa  653    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  93.55 
 
 		 527 aa  990    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1600  excinuclease ABC subunit C  76.47 
 
 		 527 aa  825    Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0084899  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 527 aa  1055    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  56.93 
 
 		 520 aa  593  1e-168  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1822  excinuclease ABC subunit C  52 
 
 		 521 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  53.6 
 
 		 517 aa  575  1.0000000000000001e-163  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1321  excinuclease ABC subunit C  52.66 
 
 		 516 aa  565  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0107777  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  52.47 
 
 		 520 aa  556  1e-157  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1103  excinuclease ABC subunit C  44.05 
 
 		 528 aa  420  1e-116  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  41.47 
 
 		 607 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  38.07 
 
 		 604 aa  373  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  39.5 
 
 		 616 aa  369  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  37.59 
 
 		 624 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  40.22 
 
 		 631 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  38.15 
 
 		 619 aa  363  3e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  37.22 
 
 		 601 aa  363  5.0000000000000005e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  38.93 
 
 		 628 aa  362  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  37.84 
 
 		 615 aa  361  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  39 
 
 		 627 aa  360  3e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  38.53 
 
 		 610 aa  355  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  38.7 
 
 		 599 aa  354  2.9999999999999997e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  35.28 
 
 		 613 aa  353  4e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  35.26 
 
 		 611 aa  353  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0044  excinuclease ABC, C subunit  38.81 
 
 		 613 aa  352  1e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.101531  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  37.46 
 
 		 685 aa  351  2e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  36.13 
 
 		 628 aa  348  1e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  33.15 
 
 		 614 aa  345  8.999999999999999e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  38.87 
 
 		 596 aa  345  1e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  38.07 
 
 		 602 aa  343  4e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  39.42 
 
 		 593 aa  342  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  36.48 
 
 		 607 aa  341  2e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  36.48 
 
 		 607 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  35.75 
 
 		 641 aa  340  2.9999999999999998e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  37.85 
 
 		 596 aa  340  2.9999999999999998e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  37.25 
 
 		 596 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  37.59 
 
 		 598 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  34.99 
 
 		 607 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  35.23 
 
 		 622 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  37.48 
 
 		 620 aa  336  7e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  35.79 
 
 		 588 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  34.68 
 
 		 609 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  37.34 
 
 		 599 aa  334  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  37.07 
 
 		 597 aa  335  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  37.48 
 
 		 620 aa  335  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  36.78 
 
 		 607 aa  334  2e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  37.68 
 
 		 629 aa  333  4e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  36.21 
 
 		 613 aa  333  4e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  38.16 
 
 		 603 aa  332  8e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  34.73 
 
 		 591 aa  330  4e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  36.57 
 
 		 652 aa  330  5.0000000000000004e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  34.43 
 
 		 613 aa  329  8e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  35.21 
 
 		 626 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  35.1 
 
 		 607 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  40 
 
 		 594 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  32.18 
 
 		 666 aa  326  6e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  38.52 
 
 		 615 aa  325  9e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  37.98 
 
 		 591 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  37.83 
 
 		 610 aa  325  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  33.76 
 
 		 626 aa  324  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  34.15 
 
 		 644 aa  325  2e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  38.79 
 
 		 594 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  35.82 
 
 		 625 aa  323  4e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  37.48 
 
 		 595 aa  323  4e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  38.6 
 
 		 594 aa  323  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  38.31 
 
 		 594 aa  323  5e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  35.64 
 
 		 617 aa  322  9.000000000000001e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  35.64 
 
 		 617 aa  322  9.000000000000001e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  38.64 
 
 		 594 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  34.69 
 
 		 603 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  38.42 
 
 		 594 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  34.24 
 
 		 611 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  34.55 
 
 		 607 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  38.24 
 
 		 594 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  38.24 
 
 		 594 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  36.07 
 
 		 613 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  38.24 
 
 		 594 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  38.24 
 
 		 594 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  38.24 
 
 		 594 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  34.55 
 
 		 607 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  33.94 
 
 		 612 aa  320  5e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  33.05 
 
 		 653 aa  319  9e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  33.57 
 
 		 666 aa  318  1e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  33.94 
 
 		 607 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  36.45 
 
 		 590 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  34.73 
 
 		 607 aa  317  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  33.92 
 
 		 615 aa  317  4e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  36.08 
 
 		 598 aa  317  4e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  35.13 
 
 		 614 aa  317  5e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  35.23 
 
 		 585 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  37.57 
 
 		 596 aa  316  5e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  35.36 
 
 		 604 aa  316  6e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  34.37 
 
 		 607 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  34.41 
 
 		 617 aa  316  9e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  37.18 
 
 		 593 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  34.06 
 
 		 607 aa  315  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  37.18 
 
 		 593 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0387  excinuclease ABC, C subunit  34.98 
 
 		 598 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.971851 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  33.39 
 
 		 682 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.914637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>