More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2709 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  59.51 
 
 		 527 aa  656    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1321  excinuclease ABC subunit C  59.69 
 
 		 516 aa  647    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0107777  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  59.7 
 
 		 527 aa  653    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 519 aa  1060    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0854  excinuclease ABC subunit C  60.38 
 
 		 526 aa  663    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1600  excinuclease ABC subunit C  57.22 
 
 		 527 aa  634  1e-180  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0084899  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  58.64 
 
 		 520 aa  634  1e-180  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1822  excinuclease ABC subunit C  55.92 
 
 		 521 aa  633  1e-180  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  58.53 
 
 		 517 aa  628  1e-179  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  55.15 
 
 		 520 aa  595  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1103  excinuclease ABC subunit C  42.12 
 
 		 528 aa  423  1e-117  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  42.04 
 
 		 607 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  40.04 
 
 		 611 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  39.71 
 
 		 616 aa  375  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  38.13 
 
 		 604 aa  370  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  39.82 
 
 		 602 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  38.16 
 
 		 598 aa  361  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  39.7 
 
 		 601 aa  358  9e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  38 
 
 		 596 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  39.09 
 
 		 596 aa  356  6.999999999999999e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  37.48 
 
 		 624 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  39.21 
 
 		 591 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  38.98 
 
 		 628 aa  353  5e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  38.52 
 
 		 610 aa  351  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 590 aa  350  5e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0044  excinuclease ABC, C subunit  37.04 
 
 		 613 aa  349  9e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.101531  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  37.79 
 
 		 627 aa  349  9e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  38.81 
 
 		 596 aa  348  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  37.59 
 
 		 597 aa  347  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  38.62 
 
 		 594 aa  346  5e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  38.1 
 
 		 631 aa  345  8e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  36.63 
 
 		 652 aa  344  2e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0387  excinuclease ABC, C subunit  37.11 
 
 		 598 aa  344  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.971851 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  38.62 
 
 		 594 aa  345  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  37.07 
 
 		 619 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  38.43 
 
 		 594 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  38.13 
 
 		 594 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  38.13 
 
 		 594 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  38.43 
 
 		 594 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  38.13 
 
 		 594 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  36.12 
 
 		 599 aa  343  4e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  38.08 
 
 		 613 aa  343  5e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  37.59 
 
 		 593 aa  341  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  38.36 
 
 		 594 aa  341  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  36.04 
 
 		 591 aa  341  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  37.76 
 
 		 594 aa  339  7e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  37.94 
 
 		 594 aa  339  9e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  37.84 
 
 		 603 aa  339  9e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  36.09 
 
 		 593 aa  339  9e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  36.09 
 
 		 593 aa  339  9e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  40.11 
 
 		 615 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  36.12 
 
 		 622 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  36.56 
 
 		 615 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  35.98 
 
 		 607 aa  335  1e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  37.88 
 
 		 636 aa  334  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  35.98 
 
 		 607 aa  333  5e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  36.65 
 
 		 596 aa  333  5e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  38.84 
 
 		 614 aa  333  6e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  38.3 
 
 		 588 aa  333  6e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  37.85 
 
 		 603 aa  332  7.000000000000001e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  35.71 
 
 		 594 aa  332  8e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  35.47 
 
 		 598 aa  332  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  36.95 
 
 		 613 aa  332  1e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1854  excinuclease ABC subunit C  38.61 
 
 		 574 aa  330  4e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.971322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  35.48 
 
 		 620 aa  329  8e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  35.6 
 
 		 707 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  37.29 
 
 		 626 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  35.3 
 
 		 620 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  36.98 
 
 		 604 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  37.45 
 
 		 629 aa  327  3e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  35.43 
 
 		 707 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  35.9 
 
 		 595 aa  327  3e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  37.41 
 
 		 615 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  35.43 
 
 		 707 aa  326  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1246  excinuclease ABC subunit C  37.55 
 
 		 565 aa  325  1e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  37.55 
 
 		 612 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  34.68 
 
 		 641 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  36.02 
 
 		 628 aa  324  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  35.79 
 
 		 607 aa  324  2e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  35.66 
 
 		 610 aa  325  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  35.19 
 
 		 685 aa  323  4e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  35.35 
 
 		 614 aa  323  6e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  35.42 
 
 		 625 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  36.11 
 
 		 608 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  36.11 
 
 		 623 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  36.51 
 
 		 626 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  35.35 
 
 		 682 aa  318  1e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  36.7 
 
 		 631 aa  318  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  36.63 
 
 		 617 aa  318  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0464  excinuclease ABC subunit C  35.48 
 
 		 603 aa  317  3e-85  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.646786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  36.36 
 
 		 677 aa  317  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2488  excinuclease ABC subunit C  35.8 
 
 		 716 aa  316  6e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820608  normal  0.0424579 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  35.51 
 
 		 616 aa  316  6e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  36.85 
 
 		 617 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  36.85 
 
 		 617 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  36.97 
 
 		 594 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  36.56 
 
 		 623 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  36.5 
 
 		 649 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  34.82 
 
 		 613 aa  313  5.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  37.32 
 
 		 613 aa  312  9e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>