More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1246 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1246  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 565 aa  1150    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0087  excinuclease ABC subunit C  48.94 
 
 		 576 aa  535  1e-151  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.139428  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  37.55 
 
 		 519 aa  325  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1600  excinuclease ABC subunit C  37.19 
 
 		 527 aa  313  5.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0084899  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  35.7 
 
 		 520 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0659  excinuclease ABC subunit C  35.11 
 
 		 557 aa  301  2e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  33.22 
 
 		 610 aa  300  4e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  35.73 
 
 		 527 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  33.17 
 
 		 624 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0854  excinuclease ABC subunit C  35.61 
 
 		 526 aa  296  6e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0683  excinuclease ABC subunit C  35.28 
 
 		 557 aa  296  8e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  32.78 
 
 		 613 aa  295  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  32.71 
 
 		 588 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  35.16 
 
 		 527 aa  289  1e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0044  excinuclease ABC, C subunit  33.61 
 
 		 613 aa  288  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.101531  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1854  excinuclease ABC subunit C  32.24 
 
 		 574 aa  287  4e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.971322  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  31.26 
 
 		 616 aa  287  4e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  34.21 
 
 		 607 aa  287  5e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  35.16 
 
 		 517 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  31.28 
 
 		 607 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  31.46 
 
 		 611 aa  283  5.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  31.38 
 
 		 607 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  32.61 
 
 		 599 aa  280  4e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1822  excinuclease ABC subunit C  33.98 
 
 		 521 aa  280  5e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  31.34 
 
 		 607 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  33.9 
 
 		 598 aa  280  6e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  33.22 
 
 		 607 aa  279  8e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  31.05 
 
 		 607 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  31.05 
 
 		 607 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0196  excinuclease ABC subunit C  33.39 
 
 		 563 aa  279  1e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  33.72 
 
 		 607 aa  277  3e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  31.04 
 
 		 607 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  31.4 
 
 		 608 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  31.79 
 
 		 608 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  32.19 
 
 		 605 aa  276  7e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  31.36 
 
 		 607 aa  276  8e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  32.59 
 
 		 591 aa  276  9e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  34.01 
 
 		 607 aa  276  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  33.91 
 
 		 520 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  31.12 
 
 		 614 aa  273  6e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  30.1 
 
 		 625 aa  273  9e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  31.1 
 
 		 585 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  32.2 
 
 		 631 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  32.34 
 
 		 615 aa  270  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  31.12 
 
 		 596 aa  270  7e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  31.88 
 
 		 628 aa  269  8.999999999999999e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  31.6 
 
 		 622 aa  268  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3241  excinuclease ABC, C subunit  30.82 
 
 		 607 aa  268  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0161382  hitchhiker  0.00210477 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  30.2 
 
 		 603 aa  267  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  31.36 
 
 		 628 aa  266  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  30.83 
 
 		 612 aa  266  5.999999999999999e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  30.1 
 
 		 607 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  30.82 
 
 		 618 aa  265  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  30.28 
 
 		 610 aa  265  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  32.08 
 
 		 594 aa  264  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  32.37 
 
 		 594 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  32.25 
 
 		 594 aa  264  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  32.25 
 
 		 594 aa  264  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  30.49 
 
 		 618 aa  264  3e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  32.37 
 
 		 594 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  32.25 
 
 		 594 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1736  excinuclease ABC subunit C  31.98 
 
 		 550 aa  263  4e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00115993  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  31.54 
 
 		 620 aa  264  4e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  31.3 
 
 		 619 aa  264  4e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1321  excinuclease ABC subunit C  33.53 
 
 		 516 aa  264  4e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0107777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  32.48 
 
 		 594 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  31.54 
 
 		 620 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  32.25 
 
 		 594 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  31.46 
 
 		 593 aa  263  6.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  31.46 
 
 		 593 aa  263  6.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  30.59 
 
 		 626 aa  263  8e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0205  excinuclease ABC subunit C  30.79 
 
 		 614 aa  263  8.999999999999999e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0351181  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  32.65 
 
 		 613 aa  263  8.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  30.95 
 
 		 594 aa  262  1e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 614 aa  262  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  29.97 
 
 		 607 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  31.14 
 
 		 590 aa  261  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  29.58 
 
 		 609 aa  261  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  31.58 
 
 		 593 aa  261  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  32.16 
 
 		 626 aa  261  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  30.06 
 
 		 644 aa  260  4e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0657  excinuclease ABC subunit C  31.72 
 
 		 603 aa  260  4e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000040695  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0845  excinuclease ABC, C subunit  30.53 
 
 		 620 aa  259  7e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.866518  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  33.16 
 
 		 596 aa  259  9e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  29.59 
 
 		 613 aa  259  9e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1271  excinuclease ABC subunit C  30.4 
 
 		 606 aa  259  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  30.39 
 
 		 610 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  31.86 
 
 		 594 aa  258  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  29.64 
 
 		 619 aa  258  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1001  excinuclease ABC subunit C  28.84 
 
 		 657 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  31.39 
 
 		 628 aa  257  5e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  31.63 
 
 		 594 aa  256  6e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  31.36 
 
 		 604 aa  256  8e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2151  excinuclease ABC subunit C  29.62 
 
 		 609 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4277  excinuclease ABC subunit C  30.12 
 
 		 634 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  32.31 
 
 		 594 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  30.63 
 
 		 613 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2454  excinuclease ABC subunit C  30.29 
 
 		 609 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.263996  normal  0.543932 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5405  excinuclease ABC, C subunit  28.92 
 
 		 688 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0936  excinuclease ABC subunit C  28.68 
 
 		 657 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.581594  normal  0.110547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>