More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0683 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0683  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
557 aa  1122    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0659  excinuclease ABC subunit C  96.59 
 
 
557 aa  1094    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0196  excinuclease ABC subunit C  51.77 
 
 
563 aa  526  1e-148  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1854  excinuclease ABC subunit C  46.74 
 
 
574 aa  499  1e-140  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.971322  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1736  excinuclease ABC subunit C  47.44 
 
 
550 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00115993  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  39.09 
 
 
607 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  40.63 
 
 
622 aa  365  1e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  37.66 
 
 
625 aa  350  5e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2397  excinuclease ABC subunit C  36.16 
 
 
598 aa  347  3e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.866418 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  35.93 
 
 
616 aa  347  3e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  37.11 
 
 
624 aa  346  5e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  37.35 
 
 
591 aa  346  6e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  37.44 
 
 
641 aa  338  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  36.71 
 
 
614 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  36.58 
 
 
708 aa  338  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  35.39 
 
 
613 aa  336  7.999999999999999e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3639  excinuclease ABC, C subunit  36.67 
 
 
597 aa  335  9e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  36.3 
 
 
613 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  36.61 
 
 
604 aa  334  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  36.11 
 
 
644 aa  335  2e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  38.71 
 
 
598 aa  333  4e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  36.46 
 
 
588 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  37.03 
 
 
601 aa  333  5e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  35.27 
 
 
685 aa  332  7.000000000000001e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  35.61 
 
 
590 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  35.48 
 
 
610 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1509  excinuclease ABC, C subunit  36.56 
 
 
594 aa  331  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.94656  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  34.79 
 
 
607 aa  329  9e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  35.88 
 
 
620 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  34.86 
 
 
607 aa  327  3e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  35.18 
 
 
671 aa  327  4.0000000000000003e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  35.71 
 
 
620 aa  326  5e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2078  excinuclease ABC, C subunit  35.69 
 
 
604 aa  326  7e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  35.44 
 
 
626 aa  325  9e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  34.45 
 
 
607 aa  325  1e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  36.44 
 
 
613 aa  324  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  33.56 
 
 
594 aa  323  7e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  36.54 
 
 
594 aa  322  9.999999999999999e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  35.7 
 
 
647 aa  322  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  34.4 
 
 
666 aa  322  9.999999999999999e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  35.16 
 
 
676 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  34.69 
 
 
679 aa  321  3e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  35.16 
 
 
676 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  35.16 
 
 
676 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  34.54 
 
 
678 aa  320  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  35.09 
 
 
666 aa  319  6e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  34.24 
 
 
628 aa  319  9e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  34.75 
 
 
593 aa  318  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  34.75 
 
 
593 aa  318  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  34.6 
 
 
596 aa  318  2e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  35.71 
 
 
682 aa  318  2e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  34.35 
 
 
658 aa  317  4e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  35.02 
 
 
594 aa  317  5e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  35.02 
 
 
594 aa  317  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  35.02 
 
 
594 aa  317  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  35.02 
 
 
594 aa  316  6e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  34.44 
 
 
653 aa  316  7e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  34.85 
 
 
594 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  34.85 
 
 
594 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  35.34 
 
 
596 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  34.48 
 
 
646 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  34.47 
 
 
652 aa  315  1.9999999999999998e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  35.02 
 
 
594 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  33.89 
 
 
627 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  36.23 
 
 
613 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  33.64 
 
 
678 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  36.71 
 
 
607 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  34.84 
 
 
628 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  36.52 
 
 
593 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  34.85 
 
 
594 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  33.11 
 
 
610 aa  313  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  35.33 
 
 
631 aa  313  5.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  35.33 
 
 
627 aa  313  6.999999999999999e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  36.03 
 
 
615 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  35.45 
 
 
599 aa  312  9e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  35.67 
 
 
624 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2725  excinuclease ABC subunit C  35.78 
 
 
592 aa  312  1e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  35.87 
 
 
609 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  34.85 
 
 
594 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2640  excinuclease ABC subunit C  34.97 
 
 
579 aa  311  2e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.347112  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  35.45 
 
 
619 aa  311  2e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0205  excinuclease ABC subunit C  36.11 
 
 
614 aa  311  2e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0351181  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  34.75 
 
 
615 aa  310  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  34.08 
 
 
649 aa  310  4e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  34.14 
 
 
656 aa  310  4e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  35.06 
 
 
594 aa  310  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  35.69 
 
 
616 aa  309  8e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  35.7 
 
 
593 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  34.3 
 
 
610 aa  309  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  33.28 
 
 
625 aa  308  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  34.81 
 
 
599 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  34.63 
 
 
617 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  36.09 
 
 
603 aa  307  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  34.63 
 
 
617 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  35.97 
 
 
677 aa  307  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  34.56 
 
 
690 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0087  excinuclease ABC subunit C  35.49 
 
 
576 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.139428  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  35.43 
 
 
619 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  35.97 
 
 
608 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0834  excinuclease ABC subunit C  35.1 
 
 
610 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000370037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>