More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0657 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0657  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 603 aa  1253    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000040695  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1073  excinuclease ABC subunit C  58.64 
 
 		 607 aa  745    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0871  excinuclease ABC subunit C  66.5 
 
 		 600 aa  855    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0520  excinuclease ABC subunit C  61.36 
 
 		 599 aa  788    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.545432  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  51.19 
 
 		 591 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  49.91 
 
 		 594 aa  615  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  49.49 
 
 		 590 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  50.34 
 
 		 596 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  49.23 
 
 		 594 aa  609  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  49.4 
 
 		 594 aa  611  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  49.4 
 
 		 594 aa  611  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  49.4 
 
 		 594 aa  611  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  49.4 
 
 		 594 aa  611  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  49.4 
 
 		 594 aa  611  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  49.91 
 
 		 594 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  49.23 
 
 		 594 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  49.23 
 
 		 594 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  47.27 
 
 		 594 aa  598  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  47.54 
 
 		 593 aa  593  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  47.54 
 
 		 593 aa  593  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  48.39 
 
 		 595 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  47.62 
 
 		 593 aa  580  1e-164  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  46.99 
 
 		 610 aa  570  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  43.15 
 
 		 658 aa  534  1e-150  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  46.58 
 
 		 591 aa  525  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  39.64 
 
 		 620 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  39.9 
 
 		 620 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  39.64 
 
 		 624 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  38.27 
 
 		 628 aa  395  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  38.77 
 
 		 625 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  38.53 
 
 		 593 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  36.71 
 
 		 607 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  36.55 
 
 		 641 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  38.86 
 
 		 615 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  37.3 
 
 		 607 aa  382  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  37.3 
 
 		 607 aa  382  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  36.82 
 
 		 653 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  37.8 
 
 		 588 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  35.29 
 
 		 622 aa  378  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  37.52 
 
 		 616 aa  374  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  35.67 
 
 		 665 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  36.23 
 
 		 613 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  36.47 
 
 		 685 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  36.44 
 
 		 613 aa  375  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  35.9 
 
 		 614 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  36.32 
 
 		 607 aa  371  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl101  repair endonuclease subunit C  35.69 
 
 		 588 aa  368  1e-100  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  37.32 
 
 		 613 aa  368  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  34.89 
 
 		 669 aa  365  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  35.34 
 
 		 631 aa  363  4e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  36.92 
 
 		 616 aa  361  2e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  36.22 
 
 		 619 aa  360  6e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  35.26 
 
 		 610 aa  353  5e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  35.73 
 
 		 615 aa  350  6e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  35.1 
 
 		 626 aa  348  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  36.35 
 
 		 629 aa  348  1e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  35.27 
 
 		 627 aa  347  5e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  33.8 
 
 		 649 aa  344  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  35.55 
 
 		 604 aa  345  2e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  35.32 
 
 		 601 aa  343  5e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  35.13 
 
 		 612 aa  342  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  34.62 
 
 		 638 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  35.4 
 
 		 609 aa  340  4e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  35.19 
 
 		 624 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  35.2 
 
 		 617 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  35.2 
 
 		 617 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  34.54 
 
 		 610 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  34.54 
 
 		 610 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  34.54 
 
 		 610 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  34.54 
 
 		 610 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  33.17 
 
 		 613 aa  336  7e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  34.7 
 
 		 610 aa  336  7.999999999999999e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  34.54 
 
 		 610 aa  336  7.999999999999999e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  34.54 
 
 		 610 aa  336  9e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  33.93 
 
 		 628 aa  335  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  36.7 
 
 		 613 aa  333  5e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  34.1 
 
 		 610 aa  332  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  33.33 
 
 		 636 aa  332  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  35.42 
 
 		 636 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  33.33 
 
 		 644 aa  332  1e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  34.1 
 
 		 610 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  33.93 
 
 		 610 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  33.93 
 
 		 610 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  33.93 
 
 		 610 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  33.61 
 
 		 628 aa  330  3e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01878  excinuclease ABC subunit C  34.73 
 
 		 588 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000583054  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  34.05 
 
 		 610 aa  328  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  34.07 
 
 		 677 aa  329  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  33.87 
 
 		 599 aa  328  2.0000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2668  excinuclease ABC subunit C  33.72 
 
 		 610 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146387  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  34 
 
 		 607 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1177  excinuclease ABC subunit C  34.2 
 
 		 695 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.8668  normal  0.100977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1281  excinuclease ABC subunit C  33.93 
 
 		 695 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280524  normal  0.136737 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  34.63 
 
 		 622 aa  328  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2500  excinuclease ABC subunit C  34.26 
 
 		 607 aa  328  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000123696  normal  0.60847 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  34.48 
 
 		 625 aa  327  4.0000000000000003e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  32.5 
 
 		 656 aa  327  5e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  33.44 
 
 		 617 aa  327  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  33.44 
 
 		 610 aa  326  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  33.44 
 
 		 617 aa  326  7e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>