More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0871 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0657  excinuclease ABC subunit C  66.5 
 
 		 603 aa  855    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000040695  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1073  excinuclease ABC subunit C  56.17 
 
 		 607 aa  686    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0871  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 600 aa  1243    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0520  excinuclease ABC subunit C  58.83 
 
 		 599 aa  725    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.545432  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  50.5 
 
 		 591 aa  609  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  49.75 
 
 		 594 aa  599  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  49.92 
 
 		 594 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  49.92 
 
 		 594 aa  599  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  49.92 
 
 		 594 aa  599  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  49.92 
 
 		 594 aa  599  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  49.92 
 
 		 594 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  49.92 
 
 		 596 aa  597  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  49.75 
 
 		 594 aa  597  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  49.75 
 
 		 594 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  49.75 
 
 		 594 aa  597  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  49.24 
 
 		 594 aa  592  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  49.16 
 
 		 590 aa  589  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  47.52 
 
 		 593 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  47.52 
 
 		 593 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  46.39 
 
 		 594 aa  566  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  45.48 
 
 		 593 aa  553  1e-156  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  46.21 
 
 		 595 aa  545  1e-154  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  45.28 
 
 		 610 aa  523  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  42.48 
 
 		 658 aa  509  1e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  44.69 
 
 		 591 aa  502  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  40.63 
 
 		 593 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  39.36 
 
 		 620 aa  395  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  39.04 
 
 		 620 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  38.52 
 
 		 615 aa  389  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  36.07 
 
 		 607 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  36.88 
 
 		 625 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  37.93 
 
 		 628 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 613 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  37.66 
 
 		 624 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  35.7 
 
 		 641 aa  363  5.0000000000000005e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  36.8 
 
 		 614 aa  360  4e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  35.53 
 
 		 622 aa  360  4e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  36.77 
 
 		 588 aa  351  3e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  35.69 
 
 		 613 aa  350  5e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  35.6 
 
 		 653 aa  347  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  34.82 
 
 		 685 aa  345  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl101  repair endonuclease subunit C  36.03 
 
 		 588 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  35.95 
 
 		 665 aa  343  7e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  34.54 
 
 		 607 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  35.44 
 
 		 616 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  34.21 
 
 		 607 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  33.78 
 
 		 613 aa  338  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  34 
 
 		 607 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  34.48 
 
 		 669 aa  336  7e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  33.55 
 
 		 610 aa  336  7.999999999999999e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  36.09 
 
 		 615 aa  336  9e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  34.79 
 
 		 610 aa  334  3e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  34.79 
 
 		 610 aa  334  4e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  34.79 
 
 		 610 aa  333  4e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  34.79 
 
 		 610 aa  334  4e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  34.79 
 
 		 610 aa  334  4e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  35.06 
 
 		 619 aa  334  4e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  34.42 
 
 		 610 aa  333  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  34.42 
 
 		 610 aa  333  5e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  34.12 
 
 		 644 aa  332  1e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  36.62 
 
 		 612 aa  330  4e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  34.79 
 
 		 616 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  34.56 
 
 		 610 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  34.73 
 
 		 610 aa  326  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  34.31 
 
 		 631 aa  325  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  34.56 
 
 		 610 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  34.36 
 
 		 610 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  34.2 
 
 		 610 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  34.69 
 
 		 627 aa  324  4e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01878  excinuclease ABC subunit C  34.28 
 
 		 588 aa  323  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000583054  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0424  excinuclease ABC subunit C  32.47 
 
 		 584 aa  323  6e-87  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.621059  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  33.05 
 
 		 611 aa  323  8e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  34.03 
 
 		 708 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  33.9 
 
 		 604 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  35.01 
 
 		 629 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  35.96 
 
 		 614 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2668  excinuclease ABC subunit C  34.29 
 
 		 610 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146387  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  34.5 
 
 		 626 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  33.72 
 
 		 599 aa  319  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  34.22 
 
 		 601 aa  318  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  33.95 
 
 		 610 aa  317  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  34.93 
 
 		 677 aa  317  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  35.19 
 
 		 609 aa  316  7e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  32.66 
 
 		 617 aa  316  7e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2500  excinuclease ABC subunit C  33.77 
 
 		 607 aa  316  8e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000123696  normal  0.60847 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  32.66 
 
 		 610 aa  316  8e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  32.66 
 
 		 617 aa  316  9e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1595  excinuclease ABC subunit C  33.83 
 
 		 610 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.31766  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  32.8 
 
 		 682 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  34.41 
 
 		 624 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 628 aa  314  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  33.17 
 
 		 638 aa  312  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  33.83 
 
 		 636 aa  312  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  33.22 
 
 		 613 aa  312  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0252  excinuclease ABC, C subunit  34.58 
 
 		 584 aa  311  2e-83  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.839249  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  33.54 
 
 		 660 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  32.3 
 
 		 617 aa  310  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  34.45 
 
 		 649 aa  310  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  33.22 
 
 		 611 aa  310  5e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  31.46 
 
 		 675 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>