More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0424 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0424  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
584 aa  1173    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.621059  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  35.14 
 
 
590 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  38.14 
 
 
591 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  35.47 
 
 
591 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  33.45 
 
 
610 aa  365  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 
594 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 
594 aa  365  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 
594 aa  365  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 
594 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 
594 aa  365  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  35.71 
 
 
594 aa  364  3e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 
594 aa  363  4e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 
594 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  36.19 
 
 
594 aa  361  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  35.53 
 
 
593 aa  361  2e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  36.19 
 
 
594 aa  360  4e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  35.63 
 
 
596 aa  360  4e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  36.19 
 
 
594 aa  360  5e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  36.62 
 
 
595 aa  360  5e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  34.35 
 
 
593 aa  351  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  34.35 
 
 
593 aa  351  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  34.03 
 
 
658 aa  350  6e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl101  repair endonuclease subunit C  36.21 
 
 
588 aa  335  2e-90  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0657  excinuclease ABC subunit C  32.98 
 
 
603 aa  326  6e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000040695  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0871  excinuclease ABC subunit C  32.47 
 
 
600 aa  323  5e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1073  excinuclease ABC subunit C  31.75 
 
 
607 aa  318  2e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  34.27 
 
 
593 aa  314  3.9999999999999997e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0520  excinuclease ABC subunit C  31.75 
 
 
599 aa  304  2.0000000000000002e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.545432  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  30.73 
 
 
622 aa  301  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  31.67 
 
 
596 aa  299  1e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  28.57 
 
 
611 aa  295  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  32.21 
 
 
620 aa  292  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  32.21 
 
 
620 aa  291  3e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  30.53 
 
 
653 aa  290  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  32.56 
 
 
616 aa  290  6e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  31.28 
 
 
602 aa  289  9e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  31.97 
 
 
641 aa  288  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  29.83 
 
 
613 aa  286  8e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  30.03 
 
 
628 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  31.62 
 
 
613 aa  282  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  32.23 
 
 
615 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  32.76 
 
 
604 aa  278  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0252  excinuclease ABC, C subunit  33.96 
 
 
584 aa  276  6e-73  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.839249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  31.57 
 
 
597 aa  276  9e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  29.17 
 
 
624 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  30.1 
 
 
625 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  31.99 
 
 
616 aa  274  3e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  30.86 
 
 
599 aa  270  5e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  28.48 
 
 
669 aa  270  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  30.19 
 
 
607 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  28.21 
 
 
665 aa  270  7e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  29.67 
 
 
607 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  28.08 
 
 
616 aa  268  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0387  excinuclease ABC, C subunit  31.03 
 
 
598 aa  268  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.971851 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003099  excinuclease ABC subunit C  31.63 
 
 
588 aa  266  7e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000908036  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  33.02 
 
 
527 aa  266  8.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0834  excinuclease ABC subunit C  31.35 
 
 
610 aa  266  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000370037  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  29.75 
 
 
607 aa  266  1e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  29.75 
 
 
613 aa  264  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  27.9 
 
 
614 aa  264  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  31.42 
 
 
596 aa  263  6e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1509  excinuclease ABC, C subunit  29.85 
 
 
594 aa  263  8e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.94656  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  28.62 
 
 
619 aa  262  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  28.89 
 
 
644 aa  261  2e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  30.2 
 
 
610 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  31.21 
 
 
603 aa  261  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  30.33 
 
 
627 aa  261  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0464  excinuclease ABC subunit C  32.42 
 
 
603 aa  261  3e-68  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.646786  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  28.73 
 
 
519 aa  261  4e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  29.82 
 
 
628 aa  261  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  30.8 
 
 
685 aa  260  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  29.31 
 
 
607 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  29.76 
 
 
628 aa  260  6e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1822  excinuclease ABC subunit C  31.07 
 
 
521 aa  258  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201866  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  28.64 
 
 
601 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  27.72 
 
 
613 aa  256  6e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  28.72 
 
 
609 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  28.6 
 
 
598 aa  256  1.0000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  28.95 
 
 
517 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  29.57 
 
 
596 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1600  excinuclease ABC subunit C  31.53 
 
 
527 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0084899  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0044  excinuclease ABC, C subunit  31.34 
 
 
613 aa  254  3e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.101531  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  29.46 
 
 
631 aa  254  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  28.66 
 
 
682 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0854  excinuclease ABC subunit C  32.02 
 
 
526 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  31.9 
 
 
588 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02747  excinuclease ABC subunit C  30.74 
 
 
588 aa  253  6e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2140  excinuclease ABC subunit C  30.53 
 
 
608 aa  253  7e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.604529  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  32.33 
 
 
527 aa  253  7e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1854  excinuclease ABC subunit C  30.66 
 
 
574 aa  252  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.971322  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  29.28 
 
 
594 aa  252  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  26.27 
 
 
707 aa  252  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  26.88 
 
 
707 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  29.82 
 
 
610 aa  251  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  29.46 
 
 
677 aa  250  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  29.82 
 
 
610 aa  250  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1321  excinuclease ABC subunit C  30.68 
 
 
516 aa  250  6e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0107777  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1803  excinuclease ABC, C subunit  28.67 
 
 
657 aa  250  6e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0340936  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2668  excinuclease ABC subunit C  29.13 
 
 
610 aa  249  7e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  29.82 
 
 
610 aa  249  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>