More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0252 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl101  repair endonuclease subunit C  60.35 
 
 		 588 aa  684    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0252  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 		 584 aa  1159    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.839249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  36.08 
 
 		 591 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  36.1 
 
 		 591 aa  337  5e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 615 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0657  excinuclease ABC subunit C  32.66 
 
 		 603 aa  324  3e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000040695  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  33.8 
 
 		 590 aa  323  8e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  34.47 
 
 		 594 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  34.92 
 
 		 594 aa  318  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  34.92 
 
 		 594 aa  318  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  34.92 
 
 		 594 aa  318  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  34.92 
 
 		 594 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  35.7 
 
 		 596 aa  318  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  34.92 
 
 		 594 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  34.97 
 
 		 594 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  34.75 
 
 		 594 aa  317  4e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  34.75 
 
 		 594 aa  317  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  34.75 
 
 		 594 aa  317  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0871  excinuclease ABC subunit C  34.58 
 
 		 600 aa  317  5e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  30.4 
 
 		 613 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  30.91 
 
 		 610 aa  309  9e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  33.01 
 
 		 658 aa  307  3e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  33.1 
 
 		 594 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  31.4 
 
 		 625 aa  302  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  29.75 
 
 		 607 aa  300  5e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  32.52 
 
 		 593 aa  298  2e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  30.72 
 
 		 609 aa  297  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  33.85 
 
 		 593 aa  296  8e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  31.69 
 
 		 613 aa  295  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0520  excinuclease ABC subunit C  32.82 
 
 		 599 aa  295  1e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.545432  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1861  excinuclease ABC subunit C  31.4 
 
 		 609 aa  293  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  33.56 
 
 		 616 aa  293  6e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  31.23 
 
 		 609 aa  291  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  32.35 
 
 		 620 aa  291  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1548  excinuclease ABC subunit C  31.23 
 
 		 609 aa  290  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1609  excinuclease ABC subunit C  30.98 
 
 		 609 aa  290  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000167064  normal  0.0818954 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  32.59 
 
 		 628 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  30.98 
 
 		 599 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1783  excinuclease ABC subunit C  31.46 
 
 		 610 aa  290  7e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0533171  hitchhiker  0.000000162173 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2561  excinuclease ABC subunit C  31.46 
 
 		 609 aa  289  8e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00257936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  28.29 
 
 		 613 aa  289  8e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2599  excinuclease ABC subunit C  31.46 
 
 		 609 aa  289  9e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00115318  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  32.09 
 
 		 610 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2676  excinuclease ABC subunit C  31.29 
 
 		 609 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  32.35 
 
 		 620 aa  289  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1615  excinuclease ABC subunit C  31.23 
 
 		 609 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000543557  normal  0.3636 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2151  excinuclease ABC subunit C  31.45 
 
 		 609 aa  288  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  32.09 
 
 		 610 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  31.92 
 
 		 610 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  31.92 
 
 		 610 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2648  excinuclease ABC subunit C  31.18 
 
 		 610 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.473447  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  31.92 
 
 		 610 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  31.92 
 
 		 610 aa  287  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  31.92 
 
 		 610 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  31.92 
 
 		 610 aa  286  7e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  31.92 
 
 		 610 aa  286  7e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  31.92 
 
 		 610 aa  286  7e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  31.9 
 
 		 593 aa  286  9e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  31.9 
 
 		 593 aa  286  9e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  31.92 
 
 		 610 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2668  excinuclease ABC subunit C  32.71 
 
 		 610 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146387  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  31.92 
 
 		 610 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1451  excinuclease ABC subunit C  32.03 
 
 		 610 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1519  excinuclease ABC subunit C  32.71 
 
 		 610 aa  284  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0983209  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  31.41 
 
 		 609 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1595  excinuclease ABC subunit C  32.21 
 
 		 610 aa  282  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.31766  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  32.03 
 
 		 595 aa  282  1e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1073  excinuclease ABC subunit C  29.9 
 
 		 607 aa  281  2e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0424  excinuclease ABC subunit C  34.58 
 
 		 584 aa  281  3e-74  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.621059  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  28.84 
 
 		 627 aa  281  3e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  28.92 
 
 		 621 aa  280  4e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  29.78 
 
 		 613 aa  280  4e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  29.62 
 
 		 626 aa  280  6e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2500  excinuclease ABC subunit C  32.6 
 
 		 607 aa  279  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000123696  normal  0.60847 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  32.2 
 
 		 599 aa  278  2e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1608  excinuclease ABC subunit C  30.32 
 
 		 606 aa  277  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00130294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2454  excinuclease ABC subunit C  31.01 
 
 		 609 aa  277  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.263996  normal  0.543932 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  30.98 
 
 		 607 aa  276  7e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01878  excinuclease ABC subunit C  31.83 
 
 		 588 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000583054  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  29.64 
 
 		 607 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  29.13 
 
 		 610 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  29.65 
 
 		 607 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1825  excinuclease ABC subunit C  29.81 
 
 		 609 aa  274  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.088783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0659  excinuclease ABC subunit C  31.94 
 
 		 609 aa  274  3e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.25379  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  29.85 
 
 		 598 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  27.78 
 
 		 605 aa  273  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  29.87 
 
 		 607 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  29.49 
 
 		 622 aa  273  5.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1177  excinuclease ABC subunit C  30.59 
 
 		 695 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.8668  normal  0.100977 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  31.36 
 
 		 610 aa  273  7e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2140  excinuclease ABC subunit C  30.66 
 
 		 608 aa  272  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.604529  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  28.97 
 
 		 607 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  28.97 
 
 		 607 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1640  excinuclease ABC subunit C  31.46 
 
 		 609 aa  271  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00105988  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  30.99 
 
 		 617 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  28.72 
 
 		 611 aa  271  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1281  excinuclease ABC subunit C  30.1 
 
 		 695 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280524  normal  0.136737 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  31.16 
 
 		 610 aa  270  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  31.16 
 
 		 617 aa  270  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00582  excinuclease ABC subunit C  27.03 
 
 		 618 aa  270  7e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>