More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl101 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl101  repair endonuclease subunit C  100 
 
 
588 aa  1188    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0252  excinuclease ABC, C subunit  60.35 
 
 
584 aa  686    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.839249  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0657  excinuclease ABC subunit C  35.42 
 
 
603 aa  372  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000040695  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  36.65 
 
 
594 aa  355  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  36.82 
 
 
596 aa  354  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  38.58 
 
 
591 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  36.85 
 
 
594 aa  353  4e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  36.85 
 
 
594 aa  353  4e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  36.85 
 
 
594 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  36.68 
 
 
594 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  36.68 
 
 
594 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  36.85 
 
 
594 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  37.13 
 
 
590 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  36.15 
 
 
594 aa  350  4e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  36.48 
 
 
594 aa  350  6e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0871  excinuclease ABC subunit C  36.29 
 
 
600 aa  349  8e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  36.15 
 
 
594 aa  347  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  36.91 
 
 
591 aa  345  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0424  excinuclease ABC subunit C  36.6 
 
 
584 aa  342  1e-92  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.621059  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  32.66 
 
 
613 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  35.2 
 
 
610 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  38.23 
 
 
593 aa  334  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  34.95 
 
 
594 aa  332  1e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0520  excinuclease ABC subunit C  35.1 
 
 
599 aa  331  2e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.545432  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  34.39 
 
 
593 aa  326  8.000000000000001e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  35.81 
 
 
615 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  34.91 
 
 
593 aa  319  7.999999999999999e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  34.91 
 
 
593 aa  319  7.999999999999999e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  33.5 
 
 
613 aa  317  4e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  32.25 
 
 
607 aa  312  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  32.74 
 
 
658 aa  312  1e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  32.36 
 
 
607 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  33.11 
 
 
625 aa  311  2.9999999999999997e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  33.16 
 
 
599 aa  310  5e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  32.31 
 
 
607 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  34.65 
 
 
616 aa  309  8e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  31.48 
 
 
626 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  31.92 
 
 
613 aa  308  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  34.46 
 
 
620 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  34.56 
 
 
620 aa  307  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  32.31 
 
 
607 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  30.82 
 
 
607 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  31.51 
 
 
607 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  34.63 
 
 
596 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1073  excinuclease ABC subunit C  32.63 
 
 
607 aa  305  2.0000000000000002e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  32.42 
 
 
607 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  33.74 
 
 
595 aa  303  6.000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  31.88 
 
 
607 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  31.43 
 
 
605 aa  300  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  32.17 
 
 
624 aa  301  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  29.85 
 
 
611 aa  300  5e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  31.67 
 
 
607 aa  299  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  32.52 
 
 
585 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  32.55 
 
 
607 aa  298  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  34.04 
 
 
641 aa  297  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  30.68 
 
 
644 aa  297  4e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3241  excinuclease ABC, C subunit  31.85 
 
 
607 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0161382  hitchhiker  0.00210477 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  34.3 
 
 
610 aa  295  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2668  excinuclease ABC subunit C  34.51 
 
 
610 aa  295  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146387  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  32.48 
 
 
609 aa  294  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  30.83 
 
 
613 aa  293  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  30.94 
 
 
608 aa  294  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  34.3 
 
 
610 aa  293  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  34.3 
 
 
610 aa  293  5e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  30.94 
 
 
608 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  34.3 
 
 
610 aa  293  5e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  34.3 
 
 
610 aa  293  7e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1271  excinuclease ABC subunit C  34.29 
 
 
606 aa  293  8e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  32.03 
 
 
609 aa  293  8e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1519  excinuclease ABC subunit C  34.01 
 
 
610 aa  293  9e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0983209  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  34.3 
 
 
610 aa  293  9e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  34.63 
 
 
610 aa  292  9e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1451  excinuclease ABC subunit C  34.06 
 
 
610 aa  293  9e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  31.1 
 
 
613 aa  292  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2151  excinuclease ABC subunit C  33.67 
 
 
609 aa  292  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054241  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  34.89 
 
 
610 aa  292  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  34.94 
 
 
617 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  34.67 
 
 
610 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  32.43 
 
 
685 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1595  excinuclease ABC subunit C  33.28 
 
 
610 aa  291  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.31766  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  34.94 
 
 
617 aa  291  3e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  33.88 
 
 
628 aa  291  3e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  34.13 
 
 
610 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  34.13 
 
 
610 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  33.96 
 
 
610 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  33.96 
 
 
610 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  33.96 
 
 
610 aa  290  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  30.88 
 
 
627 aa  289  1e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  33.11 
 
 
609 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  31.25 
 
 
610 aa  289  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  31.44 
 
 
622 aa  288  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  30.88 
 
 
621 aa  288  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  29.29 
 
 
614 aa  286  5e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  30.09 
 
 
617 aa  286  5e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0834  excinuclease ABC subunit C  33.22 
 
 
610 aa  286  5.999999999999999e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000370037  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0659  excinuclease ABC subunit C  33.55 
 
 
609 aa  286  8e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.25379  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2500  excinuclease ABC subunit C  34.29 
 
 
607 aa  286  9e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000123696  normal  0.60847 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  29.56 
 
 
604 aa  286  9e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  32.33 
 
 
607 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2316  excinuclease ABC subunit C  33.5 
 
 
645 aa  285  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.682688  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>