More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1044 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 		 616 aa  1257    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  48.53 
 
 		 628 aa  554  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  43.78 
 
 		 625 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  46.04 
 
 		 615 aa  510  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  43.68 
 
 		 613 aa  510  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  46.83 
 
 		 620 aa  509  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  47.15 
 
 		 620 aa  511  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  41.25 
 
 		 624 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  42.93 
 
 		 641 aa  472  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  42.23 
 
 		 607 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  41.06 
 
 		 593 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  40.5 
 
 		 588 aa  439  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  38.12 
 
 		 613 aa  435  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  38.52 
 
 		 653 aa  432  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  38.47 
 
 		 685 aa  429  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  37.18 
 
 		 607 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  36.9 
 
 		 614 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  40.55 
 
 		 591 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  37.02 
 
 		 607 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  36.7 
 
 		 607 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  38.42 
 
 		 591 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  39.7 
 
 		 593 aa  404  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  38.63 
 
 		 590 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  36.98 
 
 		 619 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  39.19 
 
 		 594 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  39.19 
 
 		 594 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  39.19 
 
 		 594 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  39.19 
 
 		 594 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  39.19 
 
 		 594 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  39.19 
 
 		 594 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  36.73 
 
 		 613 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  37.38 
 
 		 610 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  39.35 
 
 		 594 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  39.03 
 
 		 594 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  40.07 
 
 		 595 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  38.2 
 
 		 594 aa  397  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  39.03 
 
 		 594 aa  398  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  37.87 
 
 		 604 aa  398  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  35.73 
 
 		 669 aa  396  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  38.07 
 
 		 611 aa  395  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  36.12 
 
 		 622 aa  395  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  39.84 
 
 		 596 aa  398  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  36.71 
 
 		 665 aa  398  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  37.73 
 
 		 658 aa  399  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  38.87 
 
 		 594 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  37.38 
 
 		 609 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  38.79 
 
 		 610 aa  395  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  36.83 
 
 		 627 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  35.93 
 
 		 601 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  36.93 
 
 		 629 aa  378  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  37.67 
 
 		 593 aa  378  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  37.67 
 
 		 593 aa  378  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  34.58 
 
 		 613 aa  372  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  35.6 
 
 		 628 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  36.5 
 
 		 631 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  34.59 
 
 		 708 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  35.74 
 
 		 647 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  34.05 
 
 		 621 aa  364  3e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  34.22 
 
 		 627 aa  364  3e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  34.86 
 
 		 599 aa  363  6e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  36.55 
 
 		 616 aa  363  7.0000000000000005e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  33.77 
 
 		 612 aa  362  8e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  35.62 
 
 		 607 aa  362  1e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  34.19 
 
 		 616 aa  362  1e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  35.93 
 
 		 596 aa  362  1e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  34.93 
 
 		 607 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0657  excinuclease ABC subunit C  36.92 
 
 		 603 aa  361  2e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000040695  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  36.33 
 
 		 613 aa  360  3e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  34.07 
 
 		 677 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  33.97 
 
 		 676 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0520  excinuclease ABC subunit C  37.01 
 
 		 599 aa  358  1.9999999999999998e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.545432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  33.97 
 
 		 676 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  33.97 
 
 		 676 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  31.84 
 
 		 692 aa  357  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  34.13 
 
 		 614 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  34.44 
 
 		 607 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  34.13 
 
 		 613 aa  357  5e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  34.46 
 
 		 615 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  33.49 
 
 		 646 aa  356  6.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  34.03 
 
 		 678 aa  356  7.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  34.44 
 
 		 607 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  32.83 
 
 		 707 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  35.02 
 
 		 649 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 617 aa  354  2.9999999999999997e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  33.55 
 
 		 641 aa  354  2.9999999999999997e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  34.86 
 
 		 623 aa  353  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  32.68 
 
 		 707 aa  353  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  32.83 
 
 		 707 aa  353  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  33.76 
 
 		 644 aa  352  1e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  34.2 
 
 		 604 aa  352  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  34.65 
 
 		 607 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  32.24 
 
 		 671 aa  350  3e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  33.23 
 
 		 628 aa  350  3e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  36.7 
 
 		 602 aa  351  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  34.39 
 
 		 585 aa  351  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1975  excinuclease ABC subunit C  33.92 
 
 		 653 aa  350  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  31.81 
 
 		 656 aa  349  7e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  33.6 
 
 		 599 aa  349  9e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  34.13 
 
 		 624 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1086  excinuclease ABC subunit C  34.12 
 
 		 680 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000501867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>