More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2610 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  63.25 
 
 
594 aa  798    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  78.23 
 
 
594 aa  973    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  58.98 
 
 
593 aa  733    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  77.8 
 
 
594 aa  974    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  77.97 
 
 
594 aa  976    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  77.97 
 
 
594 aa  976    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  78.23 
 
 
596 aa  967    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  77.97 
 
 
594 aa  976    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  63.18 
 
 
593 aa  795    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  77.8 
 
 
594 aa  974    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  63.18 
 
 
593 aa  795    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  77.12 
 
 
594 aa  963    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  77.12 
 
 
594 aa  962    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  57.46 
 
 
610 aa  709    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  85.08 
 
 
590 aa  1056    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  76.78 
 
 
594 aa  966    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  78.4 
 
 
594 aa  974    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  54.57 
 
 
658 aa  686    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  59.29 
 
 
595 aa  733    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
591 aa  1211    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0657  excinuclease ABC subunit C  51.19 
 
 
603 aa  630  1e-179  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000040695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  51.2 
 
 
591 aa  618  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0871  excinuclease ABC subunit C  50.5 
 
 
600 aa  609  1e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0520  excinuclease ABC subunit C  50.85 
 
 
599 aa  604  1.0000000000000001e-171  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.545432  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1073  excinuclease ABC subunit C  46.56 
 
 
607 aa  556  1e-157  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  43.77 
 
 
607 aa  481  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  43.25 
 
 
613 aa  478  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  44.1 
 
 
615 aa  475  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  44.07 
 
 
620 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  44.07 
 
 
620 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  44.46 
 
 
613 aa  466  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  42.69 
 
 
628 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  43.59 
 
 
625 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  44.7 
 
 
593 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  42.83 
 
 
624 aa  455  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  41.05 
 
 
641 aa  447  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  41.65 
 
 
622 aa  444  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  43.09 
 
 
616 aa  442  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  40.54 
 
 
685 aa  433  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  40.71 
 
 
653 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  42.57 
 
 
613 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  41.65 
 
 
588 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  40.33 
 
 
619 aa  428  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  40.2 
 
 
631 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  41.04 
 
 
614 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  40.6 
 
 
627 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  40.92 
 
 
628 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  40.55 
 
 
616 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  40.61 
 
 
629 aa  413  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  42.88 
 
 
615 aa  409  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  40.35 
 
 
596 aa  409  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  39.31 
 
 
607 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  40.62 
 
 
628 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  39.77 
 
 
601 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  38.85 
 
 
669 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  39.32 
 
 
665 aa  409  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  40.92 
 
 
614 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  39.43 
 
 
607 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  39.26 
 
 
607 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  40.43 
 
 
599 aa  401  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 
613 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  40.43 
 
 
604 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  39.61 
 
 
610 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  38.87 
 
 
616 aa  399  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  38.94 
 
 
611 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  40.43 
 
 
636 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  37.54 
 
 
602 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  40.86 
 
 
612 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  40.62 
 
 
610 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  40 
 
 
610 aa  389  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  39.61 
 
 
597 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  40.46 
 
 
610 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 
610 aa  388  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  40.46 
 
 
610 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  40.46 
 
 
610 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 
610 aa  388  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  38.69 
 
 
658 aa  386  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 
610 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 
610 aa  388  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  39.18 
 
 
596 aa  387  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 
610 aa  388  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 
610 aa  389  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 
610 aa  388  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2397  excinuclease ABC subunit C  39.11 
 
 
598 aa  384  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.866418 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  39.22 
 
 
707 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  40.46 
 
 
623 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2488  excinuclease ABC subunit C  37.25 
 
 
716 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820608  normal  0.0424579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  40.29 
 
 
610 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  38.15 
 
 
677 aa  385  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  38.42 
 
 
666 aa  383  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  38.44 
 
 
682 aa  381  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  40.37 
 
 
649 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  38.87 
 
 
708 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  38.66 
 
 
707 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  39.31 
 
 
617 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  39.31 
 
 
610 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  37.39 
 
 
692 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  39.31 
 
 
617 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  38.86 
 
 
617 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1509  excinuclease ABC, C subunit  39.07 
 
 
594 aa  381  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.94656  normal  0.790129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>