More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3117 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
610 aa  1263    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  40.16 
 
 
624 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  42.93 
 
 
613 aa  459  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  39.47 
 
 
607 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  42.05 
 
 
615 aa  436  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  40.87 
 
 
588 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  39.31 
 
 
613 aa  427  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  38.84 
 
 
607 aa  421  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  38.51 
 
 
607 aa  419  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  39.74 
 
 
604 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  39.34 
 
 
631 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  38.54 
 
 
641 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  37.24 
 
 
620 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  37.08 
 
 
620 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  38.86 
 
 
616 aa  411  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  38.18 
 
 
607 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  39.35 
 
 
628 aa  411  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  38.42 
 
 
610 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  37.54 
 
 
653 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  37.54 
 
 
665 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  37.16 
 
 
669 aa  409  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  38.96 
 
 
598 aa  405  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  38.17 
 
 
649 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  39.46 
 
 
629 aa  402  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  37.69 
 
 
623 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  36.75 
 
 
615 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  38.89 
 
 
611 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  39.61 
 
 
591 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  37.38 
 
 
616 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  37.79 
 
 
596 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  37.5 
 
 
613 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  37.58 
 
 
614 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  39.35 
 
 
666 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  35.9 
 
 
685 aa  401  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  36.32 
 
 
636 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  37.03 
 
 
597 aa  398  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  37.19 
 
 
649 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  36.8 
 
 
617 aa  398  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  35.99 
 
 
604 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  39.02 
 
 
594 aa  395  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  38.76 
 
 
594 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  37.58 
 
 
596 aa  395  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  38.21 
 
 
619 aa  395  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  39.3 
 
 
641 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  38.6 
 
 
594 aa  392  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  41.13 
 
 
598 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  38.21 
 
 
612 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  35.91 
 
 
625 aa  391  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  37.81 
 
 
614 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  38.76 
 
 
594 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  38.83 
 
 
596 aa  392  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  36.96 
 
 
708 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  37.54 
 
 
613 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  38.44 
 
 
594 aa  389  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  38.44 
 
 
594 aa  389  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  38.44 
 
 
594 aa  389  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  36.9 
 
 
656 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  37.38 
 
 
671 aa  389  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  38.44 
 
 
594 aa  389  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  38.44 
 
 
594 aa  389  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  36.5 
 
 
613 aa  388  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  36.44 
 
 
635 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  38.76 
 
 
594 aa  388  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  37.19 
 
 
627 aa  385  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  38.17 
 
 
599 aa  382  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  38.34 
 
 
643 aa  383  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  37.91 
 
 
590 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1086  excinuclease ABC subunit C  36.58 
 
 
680 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000501867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 
591 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  35.99 
 
 
628 aa  383  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  37.81 
 
 
676 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  38.36 
 
 
601 aa  383  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2082  excinuclease ABC subunit C  38.32 
 
 
669 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649427  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  37.81 
 
 
676 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  37.81 
 
 
676 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5066  excinuclease ABC, C subunit  38.43 
 
 
689 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  37.52 
 
 
617 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  37.12 
 
 
675 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  37.52 
 
 
617 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  39.09 
 
 
599 aa  382  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1997  excinuclease ABC subunit C  38.6 
 
 
644 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.657306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  38.2 
 
 
607 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  37.72 
 
 
615 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  37.97 
 
 
690 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  37.83 
 
 
613 aa  381  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2589  excinuclease ABC subunit C  35.96 
 
 
691 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0718587  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  36.55 
 
 
658 aa  379  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  37.32 
 
 
622 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  37.11 
 
 
603 aa  378  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  35.91 
 
 
627 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  38.32 
 
 
599 aa  378  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  36.88 
 
 
674 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  35.7 
 
 
628 aa  378  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  36.68 
 
 
692 aa  379  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  37.08 
 
 
616 aa  376  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  35.95 
 
 
631 aa  378  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  37.48 
 
 
609 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  37.68 
 
 
622 aa  378  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  36.04 
 
 
649 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  37.54 
 
 
624 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>