More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1804 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1071  excinuclease ABC subunit C  54.73 
 
 
654 aa  669    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000538512  normal  0.216036 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  56.28 
 
 
605 aa  689    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  55.91 
 
 
603 aa  694    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2244  excinuclease ABC subunit C  54.28 
 
 
663 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  58.56 
 
 
598 aa  715    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  53.31 
 
 
674 aa  688    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4255  excinuclease ABC subunit C  52.17 
 
 
677 aa  677    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27889  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1271  excinuclease ABC subunit C  64.73 
 
 
606 aa  788    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  54.76 
 
 
609 aa  657    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
599 aa  1242    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1001  excinuclease ABC subunit C  55.71 
 
 
657 aa  681    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73532  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2410  excinuclease ABC subunit C  53.72 
 
 
673 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308713  hitchhiker  0.000953685 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1101  excinuclease ABC subunit C  51.79 
 
 
682 aa  677    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0936  excinuclease ABC subunit C  55.24 
 
 
657 aa  677    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.581594  normal  0.110547 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0663  excinuclease ABC subunit C  52.01 
 
 
681 aa  679    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.912465  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  53.41 
 
 
611 aa  653    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1143  excinuclease ABC subunit C  52.01 
 
 
681 aa  679    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232911  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  51.52 
 
 
613 aa  625  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1627  excinuclease ABC subunit C  51.75 
 
 
649 aa  621  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  52.55 
 
 
610 aa  619  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0415  excinuclease ABC, C subunit  53.55 
 
 
620 aa  619  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263018  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1783  excinuclease ABC subunit C  51.8 
 
 
653 aa  621  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  49.75 
 
 
599 aa  618  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  52.88 
 
 
610 aa  618  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  52.88 
 
 
610 aa  618  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  52.88 
 
 
610 aa  618  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  52.88 
 
 
610 aa  617  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1960  excinuclease ABC subunit C  51.72 
 
 
673 aa  616  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0403452  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0834  excinuclease ABC subunit C  51.4 
 
 
610 aa  616  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000370037  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  52.88 
 
 
610 aa  617  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  52.72 
 
 
610 aa  615  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1519  excinuclease ABC subunit C  52.55 
 
 
610 aa  615  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0983209  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  52.75 
 
 
607 aa  616  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  52.88 
 
 
610 aa  617  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1608  excinuclease ABC subunit C  52.81 
 
 
606 aa  615  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00130294  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2500  excinuclease ABC subunit C  53.12 
 
 
607 aa  612  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000123696  normal  0.60847 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  52.63 
 
 
610 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  52.47 
 
 
610 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0423  excinuclease ABC, C subunit  53.4 
 
 
618 aa  609  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  52.47 
 
 
610 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  52.47 
 
 
610 aa  611  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  52.47 
 
 
610 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1185  excinuclease ABC subunit C  51.09 
 
 
657 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2623  excinuclease ABC subunit C  51.09 
 
 
657 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.313972  normal  0.0935336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2877  excinuclease ABC subunit C  51.26 
 
 
650 aa  605  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.776439  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  52.14 
 
 
617 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  52.14 
 
 
610 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  49.59 
 
 
607 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  52.14 
 
 
617 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2668  excinuclease ABC subunit C  51.89 
 
 
610 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146387  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  49.67 
 
 
626 aa  598  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1932  excinuclease ABC subunit C  50.31 
 
 
692 aa  601  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0596454 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  49.5 
 
 
613 aa  598  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3071  excinuclease ABC subunit C  50.15 
 
 
666 aa  600  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  50.25 
 
 
609 aa  600  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1664  excinuclease ABC subunit C  49.24 
 
 
670 aa  600  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0659  excinuclease ABC subunit C  50.99 
 
 
609 aa  600  1e-170  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.25379  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0851  excinuclease ABC subunit C  48.94 
 
 
740 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00444649  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01878  excinuclease ABC subunit C  52.8 
 
 
588 aa  596  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000583054  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2244  excinuclease ABC subunit C  49.92 
 
 
671 aa  595  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208869  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  48.92 
 
 
607 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  49 
 
 
607 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  49.17 
 
 
607 aa  592  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  49.01 
 
 
608 aa  594  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  48.92 
 
 
607 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2140  excinuclease ABC subunit C  50.91 
 
 
608 aa  591  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.604529  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1595  excinuclease ABC subunit C  50.58 
 
 
610 aa  589  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.31766  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1825  excinuclease ABC subunit C  50.41 
 
 
609 aa  588  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.088783  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2700  excinuclease ABC subunit C  48.21 
 
 
685 aa  588  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2151  excinuclease ABC subunit C  49.26 
 
 
609 aa  590  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054241  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  49.5 
 
 
607 aa  591  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1451  excinuclease ABC subunit C  50.58 
 
 
610 aa  589  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  48.84 
 
 
608 aa  591  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1861  excinuclease ABC subunit C  49.75 
 
 
609 aa  587  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  48.34 
 
 
607 aa  586  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  48.67 
 
 
607 aa  585  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1548  excinuclease ABC subunit C  49.75 
 
 
609 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  49.58 
 
 
627 aa  587  1e-166  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  49.58 
 
 
621 aa  588  1e-166  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2599  excinuclease ABC subunit C  49.26 
 
 
609 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00115318  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003099  excinuclease ABC subunit C  50.59 
 
 
588 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000908036  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2454  excinuclease ABC subunit C  49.34 
 
 
609 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.263996  normal  0.543932 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  49.66 
 
 
585 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1783  excinuclease ABC subunit C  49.26 
 
 
610 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0533171  hitchhiker  0.000000162173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1615  excinuclease ABC subunit C  49.59 
 
 
609 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000543557  normal  0.3636 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1609  excinuclease ABC subunit C  49.59 
 
 
609 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000167064  normal  0.0818954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2676  excinuclease ABC subunit C  49.42 
 
 
609 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00512611  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  51.4 
 
 
619 aa  582  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2561  excinuclease ABC subunit C  49.09 
 
 
609 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00257936  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  48.43 
 
 
604 aa  579  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02747  excinuclease ABC subunit C  50.08 
 
 
588 aa  580  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  48.26 
 
 
612 aa  576  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  49.01 
 
 
609 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  48.51 
 
 
618 aa  573  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1276  excinuclease ABC subunit C  48.76 
 
 
609 aa  570  1e-161  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00138903  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1334  excinuclease ABC subunit C  48.76 
 
 
609 aa  567  1e-160  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000285239  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3270  excinuclease ABC subunit C  47.17 
 
 
639 aa  567  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150435  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  47.69 
 
 
618 aa  565  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1640  excinuclease ABC subunit C  49.17 
 
 
609 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00105988  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1193  excinuclease ABC, C subunit  47.62 
 
 
609 aa  559  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>