More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1124 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2397  excinuclease ABC subunit C  54.11 
 
 		 598 aa  652    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.866418 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1509  excinuclease ABC, C subunit  53.69 
 
 		 594 aa  654    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.94656  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 616 aa  1247    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  41.45 
 
 		 588 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  41.63 
 
 		 613 aa  442  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  41.22 
 
 		 624 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  36.79 
 
 		 607 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 604 aa  429  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  36.77 
 
 		 620 aa  429  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  36.68 
 
 		 620 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  40.69 
 
 		 616 aa  422  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  38.25 
 
 		 628 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  42.03 
 
 		 611 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  35.41 
 
 		 685 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  35.85 
 
 		 613 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  38.87 
 
 		 591 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  40.73 
 
 		 614 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  37.89 
 
 		 619 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  35.75 
 
 		 625 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  34.87 
 
 		 615 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  36.91 
 
 		 631 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  37.97 
 
 		 641 aa  397  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  41.13 
 
 		 622 aa  398  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  36.68 
 
 		 627 aa  397  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  36.7 
 
 		 629 aa  390  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  35.54 
 
 		 594 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  35.38 
 
 		 594 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  35.38 
 
 		 594 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  35.38 
 
 		 594 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  35.54 
 
 		 594 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  37.08 
 
 		 610 aa  386  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  35.38 
 
 		 594 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  35.38 
 
 		 594 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  35.33 
 
 		 594 aa  385  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  36.97 
 
 		 628 aa  382  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  34.8 
 
 		 628 aa  385  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  38.37 
 
 		 590 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  34.89 
 
 		 594 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  36.94 
 
 		 627 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  36.47 
 
 		 617 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  36.47 
 
 		 617 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  34.73 
 
 		 594 aa  382  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  36.82 
 
 		 601 aa  381  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  39.04 
 
 		 607 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  34.53 
 
 		 593 aa  378  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  36.24 
 
 		 653 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  39.59 
 
 		 615 aa  378  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  35.21 
 
 		 596 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  36.38 
 
 		 598 aa  375  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  38.15 
 
 		 626 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  37.05 
 
 		 610 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  35.3 
 
 		 625 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  37.05 
 
 		 610 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  37.05 
 
 		 610 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  37.05 
 
 		 610 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  37.05 
 
 		 610 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  35.14 
 
 		 591 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2668  excinuclease ABC subunit C  37.38 
 
 		 610 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146387  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  37.58 
 
 		 624 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  34.19 
 
 		 616 aa  366  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  37.05 
 
 		 610 aa  369  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  35.99 
 
 		 622 aa  368  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  37.05 
 
 		 610 aa  369  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  35.78 
 
 		 638 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  37.33 
 
 		 610 aa  363  4e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01878  excinuclease ABC subunit C  36.96 
 
 		 588 aa  361  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000583054  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  37.21 
 
 		 610 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  37.21 
 
 		 610 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1595  excinuclease ABC subunit C  36.89 
 
 		 610 aa  360  5e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.31766  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  34.34 
 
 		 644 aa  360  6e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1519  excinuclease ABC subunit C  36.23 
 
 		 610 aa  359  7e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0983209  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  37.05 
 
 		 610 aa  359  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  33.67 
 
 		 594 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  34.1 
 
 		 593 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0683  excinuclease ABC subunit C  35.93 
 
 		 557 aa  359  9.999999999999999e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  35.74 
 
 		 610 aa  359  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  37.09 
 
 		 610 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0659  excinuclease ABC subunit C  35.89 
 
 		 557 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  32.52 
 
 		 658 aa  357  2.9999999999999997e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  34.38 
 
 		 595 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  34.65 
 
 		 613 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  33.81 
 
 		 607 aa  356  5.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  36.93 
 
 		 610 aa  356  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  37.71 
 
 		 609 aa  355  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  33.64 
 
 		 652 aa  355  2e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  38.02 
 
 		 613 aa  354  2e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  35.34 
 
 		 614 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  36.24 
 
 		 665 aa  354  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  36.82 
 
 		 617 aa  353  4e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  34.35 
 
 		 607 aa  353  7e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  35.06 
 
 		 610 aa  352  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  36.39 
 
 		 599 aa  352  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  32.84 
 
 		 593 aa  352  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  35.06 
 
 		 617 aa  352  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1193  excinuclease ABC, C subunit  33.72 
 
 		 609 aa  352  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  32.84 
 
 		 593 aa  352  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  34.81 
 
 		 613 aa  351  2e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  35.86 
 
 		 677 aa  351  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  35.06 
 
 		 617 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  36.08 
 
 		 647 aa  350  5e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>