More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1073 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0657  excinuclease ABC subunit C  58.64 
 
 
603 aa  745    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000040695  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1073  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
607 aa  1258    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0871  excinuclease ABC subunit C  56.17 
 
 
600 aa  686    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0520  excinuclease ABC subunit C  65.82 
 
 
599 aa  817    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.545432  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  46.56 
 
 
591 aa  556  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  46.74 
 
 
594 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  46.74 
 
 
594 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  46.91 
 
 
594 aa  551  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  46.91 
 
 
594 aa  551  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  47.08 
 
 
596 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  46.74 
 
 
594 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  46.91 
 
 
594 aa  551  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  47.08 
 
 
594 aa  550  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  46.74 
 
 
594 aa  548  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  45.58 
 
 
594 aa  544  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  46.39 
 
 
594 aa  543  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  46.1 
 
 
593 aa  542  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  46.56 
 
 
594 aa  543  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  46.1 
 
 
593 aa  542  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  45.69 
 
 
590 aa  538  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  46.34 
 
 
595 aa  532  1e-150  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  45.07 
 
 
593 aa  518  1.0000000000000001e-145  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  44.14 
 
 
610 aa  507  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  40.97 
 
 
658 aa  491  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  43.1 
 
 
591 aa  492  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  36.88 
 
 
593 aa  395  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  36.61 
 
 
628 aa  393  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  36.44 
 
 
607 aa  395  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  37.8 
 
 
624 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  37.5 
 
 
641 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  36.95 
 
 
653 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  35.7 
 
 
620 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  35.62 
 
 
615 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  35.76 
 
 
625 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  35.38 
 
 
620 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  36.82 
 
 
613 aa  365  1e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  35.56 
 
 
613 aa  359  8e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  35.47 
 
 
607 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  35.3 
 
 
607 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  35.73 
 
 
669 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  35.19 
 
 
607 aa  353  5e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  35.68 
 
 
665 aa  352  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  36.97 
 
 
616 aa  351  2e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  34.32 
 
 
685 aa  351  2e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  35.78 
 
 
588 aa  351  3e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  35.03 
 
 
613 aa  350  4e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  34.92 
 
 
622 aa  349  6e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  35 
 
 
610 aa  344  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  35 
 
 
610 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  35 
 
 
610 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  35 
 
 
610 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  35 
 
 
610 aa  343  5e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  34.83 
 
 
610 aa  343  5e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  35.11 
 
 
610 aa  343  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  35.11 
 
 
610 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  35.11 
 
 
610 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  35.11 
 
 
610 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  35.11 
 
 
610 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  35.3 
 
 
612 aa  342  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  34.83 
 
 
610 aa  341  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  35.39 
 
 
631 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  34.22 
 
 
614 aa  340  4e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  35.2 
 
 
619 aa  339  7e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  34.82 
 
 
601 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  35.12 
 
 
617 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  34.85 
 
 
629 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  35.12 
 
 
617 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  35.12 
 
 
610 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  36.74 
 
 
614 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  33.67 
 
 
604 aa  336  7e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  35.1 
 
 
615 aa  335  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  33.75 
 
 
666 aa  335  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  33.33 
 
 
616 aa  334  2e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  33.61 
 
 
610 aa  333  8e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  33.79 
 
 
707 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  34.32 
 
 
677 aa  332  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01878  excinuclease ABC subunit C  34.52 
 
 
588 aa  331  3e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000583054  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2488  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 
716 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820608  normal  0.0424579 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  34 
 
 
627 aa  329  9e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  34.26 
 
 
609 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2454  excinuclease ABC subunit C  33.5 
 
 
609 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.263996  normal  0.543932 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  33.84 
 
 
611 aa  327  5e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1519  excinuclease ABC subunit C  33.84 
 
 
610 aa  326  7e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0983209  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  33.64 
 
 
707 aa  326  7e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  33.12 
 
 
656 aa  325  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2500  excinuclease ABC subunit C  34.48 
 
 
607 aa  324  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000123696  normal  0.60847 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  34 
 
 
613 aa  323  5e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  33.05 
 
 
611 aa  323  5e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  33.49 
 
 
707 aa  323  8e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  33.96 
 
 
613 aa  322  9.000000000000001e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1451  excinuclease ABC subunit C  33.95 
 
 
610 aa  322  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  33.95 
 
 
610 aa  322  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2668  excinuclease ABC subunit C  33.61 
 
 
610 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  35.92 
 
 
613 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 
628 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  31.97 
 
 
649 aa  321  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  34.49 
 
 
626 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  33.83 
 
 
617 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  33.83 
 
 
617 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  34.06 
 
 
617 aa  320  5e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>