More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2526 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  66.36 
 
 		 665 aa  852    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  64.48 
 
 		 671 aa  842    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1997  excinuclease ABC subunit C  71.05 
 
 		 644 aa  847    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.657306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  63.89 
 
 		 649 aa  827    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  60.86 
 
 		 643 aa  743    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  65.91 
 
 		 656 aa  838    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  62.22 
 
 		 708 aa  813    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  67.14 
 
 		 670 aa  843    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20070  Excinuclease ABC subunit C  66.05 
 
 		 703 aa  812    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0431256  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2550  excinuclease ABC, C subunit  62.8 
 
 		 675 aa  793    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  71.38 
 
 		 649 aa  890    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  69.22 
 
 		 684 aa  836    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13070  Excinuclease ABC subunit C  60.43 
 
 		 651 aa  725    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  57.75 
 
 		 674 aa  728    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  65.99 
 
 		 658 aa  836    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  67.16 
 
 		 692 aa  872    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  65.13 
 
 		 705 aa  848    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  55.87 
 
 		 650 aa  705    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  64.49 
 
 		 646 aa  800    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  63.05 
 
 		 676 aa  781    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  63.05 
 
 		 676 aa  781    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  63.13 
 
 		 678 aa  788    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  66.61 
 
 		 659 aa  816    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  64.44 
 
 		 675 aa  797    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  67.69 
 
 		 693 aa  857    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  66.11 
 
 		 660 aa  843    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2082  excinuclease ABC subunit C  59.79 
 
 		 669 aa  750    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649427  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  68.18 
 
 		 690 aa  835    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  64.5 
 
 		 641 aa  799    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5613  excinuclease ABC, C subunit  67.98 
 
 		 663 aa  851    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143768  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 666 aa  1350    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2935  excinuclease ABC subunit C  66.57 
 
 		 704 aa  845    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  63.05 
 
 		 676 aa  781    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  61.19 
 
 		 647 aa  773    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  63.54 
 
 		 678 aa  797    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  64.02 
 
 		 679 aa  821    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0428  excinuclease ABC subunit C  45.11 
 
 		 746 aa  621  1e-176  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  44.03 
 
 		 624 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  40.92 
 
 		 607 aa  503  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  41.54 
 
 		 588 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  37.85 
 
 		 620 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  37.85 
 
 		 620 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0845  excinuclease ABC, C subunit  42.13 
 
 		 620 aa  458  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.866518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  42.15 
 
 		 613 aa  451  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  38.24 
 
 		 625 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  41.33 
 
 		 653 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  37.75 
 
 		 685 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  39.84 
 
 		 641 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  40.09 
 
 		 611 aa  443  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  41.03 
 
 		 647 aa  435  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  39.45 
 
 		 669 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  39.11 
 
 		 644 aa  434  1e-120  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  38.59 
 
 		 613 aa  433  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  41.08 
 
 		 614 aa  431  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  40.62 
 
 		 665 aa  427  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  38.35 
 
 		 604 aa  427  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  38.83 
 
 		 601 aa  426  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  39.55 
 
 		 624 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  41.97 
 
 		 622 aa  423  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  36.01 
 
 		 613 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  39.37 
 
 		 619 aa  422  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  37.28 
 
 		 607 aa  421  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  37.28 
 
 		 607 aa  419  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1784  excinuclease ABC, C subunit  38.94 
 
 		 737 aa  419  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  39.37 
 
 		 666 aa  419  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  41.4 
 
 		 607 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  39.53 
 
 		 599 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  38.5 
 
 		 616 aa  416  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  40.45 
 
 		 607 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  36.57 
 
 		 615 aa  413  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  40.61 
 
 		 607 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  39.35 
 
 		 610 aa  413  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  38.1 
 
 		 628 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  36.71 
 
 		 628 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  39.71 
 
 		 607 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  40.22 
 
 		 623 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  39.49 
 
 		 607 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  39.19 
 
 		 644 aa  410  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3001  excinuclease ABC, C subunit  36.42 
 
 		 700 aa  411  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  40.22 
 
 		 623 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  38.08 
 
 		 682 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  39.9 
 
 		 623 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  38.34 
 
 		 613 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1945  excinuclease ABC subunit C  38.85 
 
 		 643 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  38.85 
 
 		 608 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  36.38 
 
 		 607 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3104  excinuclease ABC, C subunit  36.28 
 
 		 682 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299342  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  38.54 
 
 		 608 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 585 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  39.55 
 
 		 609 aa  405  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  36.76 
 
 		 617 aa  402  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2878  excinuclease ABC, C subunit  36.44 
 
 		 682 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5405  excinuclease ABC, C subunit  36.87 
 
 		 688 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4491  excinuclease ABC subunit C  38.95 
 
 		 642 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.191027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  38.45 
 
 		 607 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2488  excinuclease ABC subunit C  36.8 
 
 		 716 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820608  normal  0.0424579 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  37.52 
 
 		 627 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  39.9 
 
 		 607 aa  399  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  37.34 
 
 		 603 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  36.7 
 
 		 631 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>