More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_07090 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  72.1 
 
 
666 aa  971    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1784  excinuclease ABC, C subunit  74.09 
 
 
737 aa  992    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 
682 aa  1402    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  59.22 
 
 
644 aa  796    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  40.38 
 
 
607 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  40.26 
 
 
611 aa  439  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  38.89 
 
 
656 aa  425  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  37.93 
 
 
624 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  35.58 
 
 
708 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  38.27 
 
 
613 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  38.36 
 
 
670 aa  404  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  38.08 
 
 
666 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  37.97 
 
 
613 aa  399  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  37.4 
 
 
601 aa  398  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  38.21 
 
 
659 aa  397  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  36.88 
 
 
693 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  36.24 
 
 
671 aa  394  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  38.15 
 
 
679 aa  395  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  35.35 
 
 
625 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  37.48 
 
 
631 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  38.03 
 
 
622 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  36.68 
 
 
641 aa  391  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20070  Excinuclease ABC subunit C  36.93 
 
 
703 aa  389  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0431256  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  34.55 
 
 
675 aa  388  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  37.41 
 
 
653 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  36.44 
 
 
619 aa  385  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  35.9 
 
 
660 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  37.32 
 
 
593 aa  385  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  35.83 
 
 
649 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  35.77 
 
 
692 aa  385  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  38.44 
 
 
591 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2082  excinuclease ABC subunit C  37.11 
 
 
669 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649427  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  37.04 
 
 
690 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  36.68 
 
 
627 aa  377  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  34.81 
 
 
674 aa  378  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  35.54 
 
 
676 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  35.54 
 
 
676 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5613  excinuclease ABC, C subunit  35.66 
 
 
663 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143768  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  35.39 
 
 
676 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  34.91 
 
 
658 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  35.42 
 
 
665 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  35.44 
 
 
604 aa  375  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  34.98 
 
 
620 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  34.84 
 
 
620 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  36.45 
 
 
646 aa  371  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  34.43 
 
 
607 aa  369  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  37.38 
 
 
650 aa  370  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  36.12 
 
 
628 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  37.64 
 
 
628 aa  371  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  34.68 
 
 
705 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2935  excinuclease ABC subunit C  37.13 
 
 
704 aa  372  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  34.77 
 
 
613 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  34.26 
 
 
607 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  35.12 
 
 
647 aa  369  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  35.98 
 
 
678 aa  371  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  35.48 
 
 
649 aa  369  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  35.57 
 
 
678 aa  369  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  36.18 
 
 
622 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  36.6 
 
 
614 aa  368  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  36.89 
 
 
647 aa  365  1e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  35.8 
 
 
616 aa  364  2e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  36.04 
 
 
629 aa  364  2e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  36.22 
 
 
643 aa  365  2e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  34.3 
 
 
641 aa  363  5.0000000000000005e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  34.1 
 
 
607 aa  361  2e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2550  excinuclease ABC, C subunit  35.69 
 
 
675 aa  361  3e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295738  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  34.86 
 
 
588 aa  360  5e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  33.84 
 
 
638 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1997  excinuclease ABC subunit C  36.58 
 
 
644 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.657306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  35.24 
 
 
665 aa  357  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  33.28 
 
 
615 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  35.53 
 
 
669 aa  357  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13070  Excinuclease ABC subunit C  37.58 
 
 
651 aa  353  4e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  33.7 
 
 
617 aa  353  5e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  33.91 
 
 
625 aa  353  5.9999999999999994e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  34.96 
 
 
612 aa  353  7e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  33.96 
 
 
591 aa  353  7e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  36.86 
 
 
610 aa  353  8.999999999999999e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  35.33 
 
 
684 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  35.8 
 
 
593 aa  352  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  34.95 
 
 
624 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  35.8 
 
 
593 aa  352  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  36.25 
 
 
594 aa  351  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  36.25 
 
 
594 aa  351  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  36.08 
 
 
594 aa  351  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  36.25 
 
 
594 aa  351  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  36.25 
 
 
594 aa  350  5e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  36.25 
 
 
594 aa  350  5e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  32.46 
 
 
685 aa  350  5e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  36.35 
 
 
590 aa  350  6e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  33.87 
 
 
617 aa  350  7e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  36.25 
 
 
594 aa  350  7e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  33.87 
 
 
617 aa  350  7e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  36.07 
 
 
613 aa  349  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  36.25 
 
 
594 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  36.09 
 
 
594 aa  348  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  36.09 
 
 
594 aa  346  7e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  35.75 
 
 
596 aa  346  8e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  35.73 
 
 
595 aa  345  1e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  32.85 
 
 
598 aa  345  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>