More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1993 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 599 aa  1221    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  54.55 
 
 		 596 aa  668    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  52.63 
 
 		 598 aa  662    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  56.27 
 
 		 597 aa  692    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0387  excinuclease ABC, C subunit  53.24 
 
 		 598 aa  628  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.971851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  49.32 
 
 		 603 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  47.4 
 
 		 615 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  47.18 
 
 		 602 aa  563  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  46.77 
 
 		 596 aa  546  1e-154  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  45.76 
 
 		 596 aa  533  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  42.93 
 
 		 616 aa  462  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  42.98 
 
 		 629 aa  455  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  42.17 
 
 		 619 aa  457  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  42.43 
 
 		 631 aa  451  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0859  hypothetical protein  40.31 
 
 		 598 aa  448  1.0000000000000001e-124  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  41.85 
 
 		 627 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  40.96 
 
 		 615 aa  433  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  40.59 
 
 		 628 aa  430  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  39.07 
 
 		 628 aa  420  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  40.07 
 
 		 607 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  40.43 
 
 		 591 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  39.7 
 
 		 590 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  39.57 
 
 		 594 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  39.12 
 
 		 624 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  39.24 
 
 		 594 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  39.24 
 
 		 594 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  39.24 
 
 		 594 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  39.24 
 
 		 594 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  39.24 
 
 		 594 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  39.4 
 
 		 594 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  38.64 
 
 		 594 aa  385  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  39.24 
 
 		 594 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  38.17 
 
 		 610 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  39.07 
 
 		 594 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  37.19 
 
 		 610 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  39.33 
 
 		 596 aa  382  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  39.24 
 
 		 594 aa  376  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  38.81 
 
 		 593 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  38.81 
 
 		 593 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  36.89 
 
 		 595 aa  376  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  37.35 
 
 		 593 aa  370  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  37.23 
 
 		 604 aa  372  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  38.41 
 
 		 527 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  35.92 
 
 		 641 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  39.48 
 
 		 517 aa  367  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  37.14 
 
 		 520 aa  364  2e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1822  excinuclease ABC subunit C  38.57 
 
 		 521 aa  364  3e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 		 666 aa  363  6e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  35.83 
 
 		 614 aa  363  7.0000000000000005e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0854  excinuclease ABC subunit C  38.95 
 
 		 526 aa  361  2e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  37.82 
 
 		 613 aa  361  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  36.8 
 
 		 613 aa  356  6.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  37.36 
 
 		 520 aa  355  2e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  38.7 
 
 		 527 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  35.11 
 
 		 644 aa  353  5e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  34.78 
 
 		 613 aa  352  1e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  36.35 
 
 		 588 aa  352  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  36.88 
 
 		 594 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  35.5 
 
 		 653 aa  348  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  35.59 
 
 		 647 aa  346  8.999999999999999e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  34.48 
 
 		 658 aa  345  2e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  36.12 
 
 		 519 aa  343  4e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  35.25 
 
 		 643 aa  341  2e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  33.92 
 
 		 649 aa  341  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  35.02 
 
 		 641 aa  340  4e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1600  excinuclease ABC subunit C  36.51 
 
 		 527 aa  340  4e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0084899  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  35.01 
 
 		 652 aa  340  5.9999999999999996e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  33.69 
 
 		 705 aa  339  7e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  35.35 
 
 		 650 aa  339  9e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  34.07 
 
 		 656 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  33.8 
 
 		 646 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  34.04 
 
 		 607 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  34.06 
 
 		 599 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  35.68 
 
 		 628 aa  337  5e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  33.38 
 
 		 671 aa  336  7e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  36.71 
 
 		 591 aa  336  7e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1321  excinuclease ABC subunit C  37.52 
 
 		 516 aa  336  7.999999999999999e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0107777  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  34.99 
 
 		 622 aa  336  9e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0520  excinuclease ABC subunit C  36.38 
 
 		 599 aa  335  2e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.545432  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  34.98 
 
 		 617 aa  335  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  34.49 
 
 		 625 aa  334  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  34.29 
 
 		 659 aa  334  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  33.88 
 
 		 607 aa  333  4e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  34.8 
 
 		 609 aa  333  4e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  34.3 
 
 		 649 aa  333  4e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  36.39 
 
 		 593 aa  333  6e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  34.3 
 
 		 623 aa  333  8e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  35.82 
 
 		 708 aa  332  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  35.25 
 
 		 620 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  34.87 
 
 		 607 aa  331  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  34.53 
 
 		 678 aa  331  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  35.41 
 
 		 620 aa  332  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  34.4 
 
 		 676 aa  330  4e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  34.4 
 
 		 676 aa  330  4e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  34.4 
 
 		 676 aa  330  4e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  34 
 
 		 613 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  33.64 
 
 		 658 aa  330  5.0000000000000004e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  32.75 
 
 		 684 aa  330  6e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  34.05 
 
 		 678 aa  330  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  33.88 
 
 		 607 aa  329  7e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>