More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1321 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1321  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 516 aa  1049    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0107777  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  59.69 
 
 		 519 aa  670    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1822  excinuclease ABC subunit C  63.11 
 
 		 521 aa  669    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  59.69 
 
 		 517 aa  631  1e-180  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  53.61 
 
 		 527 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0854  excinuclease ABC subunit C  53.14 
 
 		 526 aa  597  1e-169  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  55.43 
 
 		 520 aa  594  1e-168  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1600  excinuclease ABC subunit C  51.33 
 
 		 527 aa  590  1e-167  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0084899  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  52.66 
 
 		 527 aa  589  1e-167  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  53.79 
 
 		 520 aa  588  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1103  excinuclease ABC subunit C  41.22 
 
 		 528 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  43.49 
 
 		 607 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  40.19 
 
 		 601 aa  395  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  40.51 
 
 		 619 aa  379  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  41.33 
 
 		 616 aa  381  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  39.44 
 
 		 604 aa  377  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  41.61 
 
 		 611 aa  379  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  41.76 
 
 		 629 aa  372  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  39.43 
 
 		 593 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 		 596 aa  375  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  41.93 
 
 		 613 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  42 
 
 		 591 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  39.19 
 
 		 631 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  37.62 
 
 		 591 aa  365  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  39.47 
 
 		 594 aa  363  3e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  39.47 
 
 		 594 aa  363  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  39.21 
 
 		 624 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  39.66 
 
 		 594 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  39.47 
 
 		 594 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  39.47 
 
 		 594 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  39.47 
 
 		 594 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  39.38 
 
 		 627 aa  362  8e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  38.5 
 
 		 598 aa  362  1e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  42.07 
 
 		 615 aa  362  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  39.51 
 
 		 594 aa  360  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  39.96 
 
 		 628 aa  360  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  39.29 
 
 		 594 aa  360  4e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  36.84 
 
 		 685 aa  360  4e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  43.48 
 
 		 614 aa  359  6e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  38.91 
 
 		 596 aa  359  7e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  39.37 
 
 		 607 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  39.29 
 
 		 594 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  39.59 
 
 		 607 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  40.71 
 
 		 590 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  38.65 
 
 		 594 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  40.82 
 
 		 610 aa  356  5e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  38.87 
 
 		 603 aa  356  5e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  38.99 
 
 		 628 aa  350  4e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  37.89 
 
 		 599 aa  349  7e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  41.44 
 
 		 613 aa  349  8e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  36.67 
 
 		 593 aa  348  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  36.67 
 
 		 593 aa  348  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  38.68 
 
 		 595 aa  347  2e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  37.32 
 
 		 602 aa  346  6e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 		 607 aa  346  7e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0044  excinuclease ABC, C subunit  37.25 
 
 		 613 aa  345  1e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.101531  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  35.25 
 
 		 652 aa  345  2e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  39.42 
 
 		 622 aa  344  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  38.38 
 
 		 636 aa  342  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  39.16 
 
 		 656 aa  341  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  36.29 
 
 		 594 aa  340  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  36.01 
 
 		 620 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  37.02 
 
 		 596 aa  340  4e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  38.94 
 
 		 614 aa  339  7e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  35.83 
 
 		 620 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  40.37 
 
 		 612 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  38.94 
 
 		 588 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  39.29 
 
 		 593 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  36.36 
 
 		 596 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  38.13 
 
 		 708 aa  336  7e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  35.53 
 
 		 598 aa  336  7e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  37.38 
 
 		 624 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0387  excinuclease ABC, C subunit  36.21 
 
 		 598 aa  335  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.971851 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  36.52 
 
 		 613 aa  335  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  35.99 
 
 		 638 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  39.7 
 
 		 626 aa  335  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  39.6 
 
 		 604 aa  334  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  36.63 
 
 		 597 aa  334  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  36.6 
 
 		 641 aa  333  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  36.99 
 
 		 617 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  36.99 
 
 		 617 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  36.11 
 
 		 625 aa  331  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  38.36 
 
 		 607 aa  331  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  38.19 
 
 		 610 aa  330  4e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  38.66 
 
 		 623 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  38.03 
 
 		 613 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  37.61 
 
 		 649 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09791  excinuclease ABC subunit C  35.71 
 
 		 652 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09771  excinuclease ABC subunit C  35.36 
 
 		 652 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0520  excinuclease ABC subunit C  37.48 
 
 		 599 aa  327  3e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.545432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  38.29 
 
 		 649 aa  326  6e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  37.32 
 
 		 615 aa  326  6e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  37.02 
 
 		 658 aa  326  7e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  37.91 
 
 		 617 aa  325  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  36.92 
 
 		 678 aa  324  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10011  excinuclease ABC subunit C  34.75 
 
 		 640 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.404154  normal  0.496638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  35.9 
 
 		 671 aa  325  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0328  excinuclease ABC subunit C  34.75 
 
 		 640 aa  323  5e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.462253  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  35.48 
 
 		 628 aa  323  5e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  38.59 
 
 		 613 aa  323  7e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>