More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0936 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
520 aa  1069    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  58.64 
 
 
519 aa  634  1e-180  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0854  excinuclease ABC subunit C  57.41 
 
 
526 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  57.64 
 
 
517 aa  606  9.999999999999999e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1822  excinuclease ABC subunit C  55.41 
 
 
521 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201866  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  56.74 
 
 
527 aa  598  1e-170  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  56.93 
 
 
527 aa  593  1e-168  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1600  excinuclease ABC subunit C  53.51 
 
 
527 aa  581  1e-164  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0084899  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1321  excinuclease ABC subunit C  55.04 
 
 
516 aa  568  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0107777  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  51.92 
 
 
520 aa  551  1e-155  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1103  excinuclease ABC subunit C  43.56 
 
 
528 aa  426  1e-118  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  41.19 
 
 
607 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  38.42 
 
 
619 aa  369  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  40.37 
 
 
604 aa  370  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  38.84 
 
 
616 aa  368  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  39.14 
 
 
631 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  37.14 
 
 
599 aa  364  2e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  38.37 
 
 
652 aa  363  4e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  38.82 
 
 
624 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  39.51 
 
 
588 aa  359  6e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  38.2 
 
 
594 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  39.93 
 
 
594 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  39.71 
 
 
594 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  39.05 
 
 
603 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  38.13 
 
 
593 aa  356  5e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  40.71 
 
 
591 aa  356  5e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  38.13 
 
 
593 aa  356  5e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  37.32 
 
 
628 aa  356  5e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  39.93 
 
 
594 aa  356  5e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  36.94 
 
 
601 aa  356  6.999999999999999e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  39.74 
 
 
594 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  39.74 
 
 
594 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  39.74 
 
 
594 aa  355  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  39.74 
 
 
594 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  39.74 
 
 
594 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  37.35 
 
 
628 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  39.63 
 
 
594 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  39.55 
 
 
594 aa  353  4e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  39.42 
 
 
602 aa  352  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  39.25 
 
 
594 aa  352  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  38.93 
 
 
610 aa  350  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  38.64 
 
 
611 aa  350  4e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  37.45 
 
 
607 aa  349  7e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  37.55 
 
 
597 aa  349  9e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  39.51 
 
 
590 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  37.45 
 
 
607 aa  347  2e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  37.92 
 
 
613 aa  347  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  40.33 
 
 
615 aa  346  5e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0044  excinuclease ABC, C subunit  37.52 
 
 
613 aa  344  2e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.101531  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  36.53 
 
 
591 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  40.26 
 
 
610 aa  343  4e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  36.87 
 
 
627 aa  343  5e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  38.99 
 
 
596 aa  343  5e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  37.61 
 
 
596 aa  343  5.999999999999999e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0387  excinuclease ABC, C subunit  36.48 
 
 
598 aa  343  5.999999999999999e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.971851 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  38.3 
 
 
595 aa  342  7e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  36.9 
 
 
607 aa  342  1e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  36.18 
 
 
593 aa  341  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  38.86 
 
 
629 aa  341  2e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  36.96 
 
 
625 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  36.05 
 
 
685 aa  334  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  36.79 
 
 
596 aa  333  3e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  38.11 
 
 
593 aa  332  8e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  37.45 
 
 
615 aa  332  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  36.7 
 
 
613 aa  331  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  37.78 
 
 
598 aa  330  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  37.43 
 
 
596 aa  329  8e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  36.13 
 
 
607 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  35.47 
 
 
598 aa  328  1.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  34.97 
 
 
641 aa  328  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  36.41 
 
 
626 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  37.12 
 
 
617 aa  324  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  36.98 
 
 
623 aa  323  5e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  36.86 
 
 
624 aa  323  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  36.5 
 
 
608 aa  323  7e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  36.63 
 
 
622 aa  322  8e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  36.98 
 
 
649 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  36.5 
 
 
623 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  36.7 
 
 
613 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  35.25 
 
 
613 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  37.96 
 
 
617 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  37.96 
 
 
617 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  35 
 
 
658 aa  320  3e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  37.27 
 
 
614 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  35.42 
 
 
653 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  35.97 
 
 
620 aa  318  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  36.46 
 
 
614 aa  317  4e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  36.3 
 
 
612 aa  317  4e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  35.78 
 
 
617 aa  317  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  36.32 
 
 
666 aa  316  8e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  37.41 
 
 
603 aa  315  9e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  37.22 
 
 
613 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  35.97 
 
 
620 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  37.21 
 
 
625 aa  314  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  37.43 
 
 
609 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  35.65 
 
 
644 aa  314  2.9999999999999996e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  35.33 
 
 
615 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  34.24 
 
 
677 aa  313  4.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  36.51 
 
 
626 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  36.07 
 
 
604 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>