More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0477 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  52.63 
 
 		 598 aa  638    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 		 615 aa  1261    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  51.69 
 
 		 596 aa  632  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0387  excinuclease ABC, C subunit  53.58 
 
 		 598 aa  627  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.971851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  51.55 
 
 		 597 aa  623  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  50.42 
 
 		 603 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  48.34 
 
 		 602 aa  584  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  48.38 
 
 		 596 aa  575  1.0000000000000001e-163  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  47.4 
 
 		 599 aa  574  1.0000000000000001e-162  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  46.89 
 
 		 596 aa  548  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  37.7 
 
 		 619 aa  433  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  38.56 
 
 		 631 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  38.85 
 
 		 629 aa  428  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0859  hypothetical protein  40.72 
 
 		 598 aa  427  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  39.35 
 
 		 615 aa  422  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  39.01 
 
 		 607 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  37 
 
 		 628 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  36.73 
 
 		 616 aa  410  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  36.56 
 
 		 627 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  37.24 
 
 		 628 aa  405  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  37.72 
 
 		 610 aa  382  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  35.81 
 
 		 604 aa  371  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  35.97 
 
 		 624 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  35.86 
 
 		 613 aa  363  7.0000000000000005e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  36.81 
 
 		 613 aa  355  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  36.94 
 
 		 591 aa  349  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  35.67 
 
 		 598 aa  348  2e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  35.56 
 
 		 588 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  36.29 
 
 		 590 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  36.35 
 
 		 593 aa  347  4e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  36.58 
 
 		 594 aa  346  8.999999999999999e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  36.39 
 
 		 595 aa  345  1e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  33.89 
 
 		 675 aa  345  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  36.91 
 
 		 594 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  36.91 
 
 		 594 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  36.91 
 
 		 594 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  36.91 
 
 		 594 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  36.91 
 
 		 594 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  36.58 
 
 		 594 aa  343  5e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  36.74 
 
 		 594 aa  342  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  33.86 
 
 		 614 aa  342  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  36.58 
 
 		 594 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  36.52 
 
 		 594 aa  339  8e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  34.48 
 
 		 607 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  35.57 
 
 		 596 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  34.24 
 
 		 620 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  33.02 
 
 		 641 aa  337  3.9999999999999995e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  36.56 
 
 		 519 aa  337  5e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  35.02 
 
 		 607 aa  337  5e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  34.08 
 
 		 620 aa  336  7e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  35.71 
 
 		 594 aa  336  9e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  37.64 
 
 		 517 aa  335  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  32.92 
 
 		 638 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  33.91 
 
 		 653 aa  333  6e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  34.72 
 
 		 614 aa  332  9e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  35.43 
 
 		 593 aa  332  9e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  35.43 
 
 		 593 aa  332  9e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  35.33 
 
 		 610 aa  332  1e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  34.07 
 
 		 628 aa  332  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  37.45 
 
 		 520 aa  332  1e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  36.73 
 
 		 594 aa  330  4e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  33.07 
 
 		 652 aa  329  7e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  33.71 
 
 		 636 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  35 
 
 		 607 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0854  excinuclease ABC subunit C  36.09 
 
 		 526 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  34.15 
 
 		 599 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1600  excinuclease ABC subunit C  35.39 
 
 		 527 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0084899  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  34.18 
 
 		 624 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  33.61 
 
 		 612 aa  327  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  32 
 
 		 666 aa  327  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  32.2 
 
 		 656 aa  325  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  33.28 
 
 		 622 aa  325  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  32.85 
 
 		 627 aa  324  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 617 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  31.31 
 
 		 671 aa  325  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 617 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  33.23 
 
 		 644 aa  324  3e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  33.99 
 
 		 613 aa  324  4e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  34.53 
 
 		 527 aa  324  4e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  34.29 
 
 		 611 aa  323  8e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 650 aa  322  9.000000000000001e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  31.46 
 
 		 684 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  33.55 
 
 		 682 aa  322  9.999999999999999e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  33.6 
 
 		 617 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  31.69 
 
 		 613 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  33.08 
 
 		 669 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  33.72 
 
 		 608 aa  320  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  30.93 
 
 		 659 aa  320  7e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  33.28 
 
 		 666 aa  319  7.999999999999999e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  33.55 
 
 		 608 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  33.44 
 
 		 625 aa  318  2e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0044  excinuclease ABC, C subunit  33.61 
 
 		 613 aa  318  3e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.101531  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  33 
 
 		 619 aa  317  3e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1784  excinuclease ABC, C subunit  32.89 
 
 		 737 aa  317  4e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  33.92 
 
 		 527 aa  317  5e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  32.84 
 
 		 607 aa  317  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  33.39 
 
 		 601 aa  316  8e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  31.39 
 
 		 692 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 609 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  32.93 
 
 		 690 aa  315  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>