More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1093 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 517 aa  1059    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  58.53 
 
 		 519 aa  628  1e-179  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1822  excinuclease ABC subunit C  57.09 
 
 		 521 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  57.64 
 
 		 520 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1321  excinuclease ABC subunit C  59.69 
 
 		 516 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0107777  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  53.79 
 
 		 527 aa  585  1e-166  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1600  excinuclease ABC subunit C  53.31 
 
 		 527 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0084899  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0854  excinuclease ABC subunit C  53.99 
 
 		 526 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  55.04 
 
 		 520 aa  581  1e-164  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  53.6 
 
 		 527 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1103  excinuclease ABC subunit C  41.06 
 
 		 528 aa  413  1e-114  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  41.23 
 
 		 607 aa  411  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  41.36 
 
 		 607 aa  396  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  41.73 
 
 		 607 aa  398  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  40.44 
 
 		 607 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  40.9 
 
 		 604 aa  389  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  39.66 
 
 		 598 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  40.33 
 
 		 624 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  39.03 
 
 		 613 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  42.64 
 
 		 615 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  39.48 
 
 		 599 aa  367  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  40.49 
 
 		 588 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  39.24 
 
 		 619 aa  368  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  38.38 
 
 		 628 aa  364  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 		 593 aa  364  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  40.64 
 
 		 610 aa  363  6e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  37.82 
 
 		 596 aa  359  8e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  38.4 
 
 		 597 aa  358  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  39.49 
 
 		 611 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  42.11 
 
 		 591 aa  355  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  36.66 
 
 		 627 aa  353  4e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  37.24 
 
 		 652 aa  352  1e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  37.41 
 
 		 628 aa  350  3e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  37.41 
 
 		 631 aa  349  6e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  36.89 
 
 		 685 aa  349  7e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  38.21 
 
 		 653 aa  349  8e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  39.27 
 
 		 616 aa  348  2e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  38.05 
 
 		 603 aa  347  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  40.07 
 
 		 594 aa  347  4e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  37.15 
 
 		 591 aa  347  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  40.07 
 
 		 594 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  39.89 
 
 		 594 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  39.89 
 
 		 594 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0044  excinuclease ABC, C subunit  36.77 
 
 		 613 aa  345  8.999999999999999e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.101531  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  39.89 
 
 		 594 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  39.89 
 
 		 594 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  39.89 
 
 		 594 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  36.47 
 
 		 601 aa  345  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  38.93 
 
 		 602 aa  345  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  39.7 
 
 		 594 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  37.2 
 
 		 613 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  39.14 
 
 		 596 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  37.28 
 
 		 625 aa  343  5e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  38.34 
 
 		 622 aa  342  5.999999999999999e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  39.25 
 
 		 607 aa  343  5.999999999999999e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  39.7 
 
 		 594 aa  342  9e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  39.63 
 
 		 590 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  39.33 
 
 		 594 aa  341  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  39.45 
 
 		 626 aa  340  5e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  36.45 
 
 		 620 aa  340  5e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  37.1 
 
 		 641 aa  339  5.9999999999999996e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  37.57 
 
 		 613 aa  339  9e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  38.5 
 
 		 594 aa  338  9.999999999999999e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  40.98 
 
 		 614 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  39.77 
 
 		 608 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  36.3 
 
 		 598 aa  337  1.9999999999999998e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  37.25 
 
 		 613 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  37.86 
 
 		 629 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  40.22 
 
 		 649 aa  336  5e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  39.59 
 
 		 608 aa  336  5e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  36.09 
 
 		 620 aa  336  5e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  37 
 
 		 596 aa  336  7.999999999999999e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  39.19 
 
 		 604 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  39.36 
 
 		 599 aa  334  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  37.64 
 
 		 615 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  40.41 
 
 		 623 aa  335  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  37.66 
 
 		 614 aa  333  4e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  38.7 
 
 		 626 aa  333  6e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  39.17 
 
 		 607 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  37.14 
 
 		 666 aa  332  1e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  37.1 
 
 		 595 aa  331  2e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  38.01 
 
 		 631 aa  330  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  37.98 
 
 		 631 aa  330  4e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  36.86 
 
 		 615 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  38.61 
 
 		 607 aa  329  6e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  39.02 
 
 		 610 aa  329  8e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  39.05 
 
 		 636 aa  329  9e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  37.13 
 
 		 635 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0387  excinuclease ABC, C subunit  34.33 
 
 		 598 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.971851 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  37.74 
 
 		 593 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1784  excinuclease ABC, C subunit  37.88 
 
 		 737 aa  327  3e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  38.84 
 
 		 607 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  37.45 
 
 		 623 aa  326  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  38.2 
 
 		 613 aa  326  7e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  35.98 
 
 		 593 aa  325  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  35.98 
 
 		 593 aa  325  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  38.04 
 
 		 607 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  36.85 
 
 		 682 aa  324  2e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  38.42 
 
 		 607 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  37.02 
 
 		 612 aa  323  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>