More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1822 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1822  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 521 aa  1072    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1321  excinuclease ABC subunit C  63.11 
 
 		 516 aa  646    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0107777  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  55.92 
 
 		 519 aa  633  1e-180  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  57.09 
 
 		 517 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  55.41 
 
 		 520 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  51.24 
 
 		 527 aa  585  1e-166  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0854  excinuclease ABC subunit C  51.34 
 
 		 526 aa  586  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  52 
 
 		 527 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1600  excinuclease ABC subunit C  49.9 
 
 		 527 aa  581  1e-164  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0084899  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  52.62 
 
 		 520 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1103  excinuclease ABC subunit C  42.12 
 
 		 528 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  40.37 
 
 		 607 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  42.94 
 
 		 591 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  38.88 
 
 		 593 aa  371  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  39.25 
 
 		 604 aa  368  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  38.57 
 
 		 599 aa  364  2e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  38.84 
 
 		 616 aa  363  4e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  39.06 
 
 		 628 aa  362  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  42.38 
 
 		 615 aa  362  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  41.92 
 
 		 590 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  39.12 
 
 		 624 aa  359  7e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  38.85 
 
 		 619 aa  358  9e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  39.44 
 
 		 610 aa  356  5.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  38.7 
 
 		 627 aa  355  1e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  39.63 
 
 		 613 aa  353  4e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  40.19 
 
 		 594 aa  353  5e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  40.19 
 
 		 594 aa  353  5e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 594 aa  352  7e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 594 aa  352  7e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 594 aa  352  7e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 594 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 594 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  39.43 
 
 		 629 aa  350  3e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  38.06 
 
 		 631 aa  350  3e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  37.7 
 
 		 652 aa  350  4e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  39.33 
 
 		 594 aa  349  7e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  39.33 
 
 		 594 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  37.9 
 
 		 591 aa  348  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  38.53 
 
 		 595 aa  348  1e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  39.63 
 
 		 596 aa  347  4e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  38.42 
 
 		 607 aa  347  4e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  39.25 
 
 		 594 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  38.42 
 
 		 607 aa  344  2e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  38.23 
 
 		 594 aa  345  2e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  38.23 
 
 		 593 aa  345  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  38.23 
 
 		 593 aa  345  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  37.27 
 
 		 601 aa  342  8e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  38.35 
 
 		 593 aa  342  1e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  36.98 
 
 		 628 aa  341  2e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  36.86 
 
 		 597 aa  340  4e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  35.52 
 
 		 658 aa  339  5.9999999999999996e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  38.67 
 
 		 611 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  39.15 
 
 		 603 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  36.79 
 
 		 596 aa  337  3.9999999999999995e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  40.25 
 
 		 614 aa  334  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  38.41 
 
 		 602 aa  334  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  39.21 
 
 		 588 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  35.83 
 
 		 620 aa  332  8e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  36.54 
 
 		 613 aa  331  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  35.96 
 
 		 598 aa  331  2e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  35.83 
 
 		 620 aa  331  2e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  38.84 
 
 		 610 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  38.22 
 
 		 613 aa  330  3e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  37.87 
 
 		 607 aa  330  3e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  36.65 
 
 		 615 aa  329  7e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  39 
 
 		 614 aa  327  3e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  37.64 
 
 		 626 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  38.93 
 
 		 623 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0044  excinuclease ABC, C subunit  35.95 
 
 		 613 aa  326  8.000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.101531  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  38.93 
 
 		 608 aa  325  9e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  37.66 
 
 		 594 aa  325  1e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  35.03 
 
 		 685 aa  324  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  35.97 
 
 		 598 aa  324  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  38.48 
 
 		 604 aa  323  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  39.74 
 
 		 612 aa  323  6e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  35.85 
 
 		 641 aa  323  6e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  38.4 
 
 		 607 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  37.84 
 
 		 636 aa  321  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  36.12 
 
 		 596 aa  320  5e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  34.5 
 
 		 596 aa  318  2e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  38.91 
 
 		 613 aa  317  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  37.7 
 
 		 708 aa  317  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  36.88 
 
 		 622 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  36.86 
 
 		 613 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  34.16 
 
 		 625 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  36.44 
 
 		 658 aa  312  7.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  35.78 
 
 		 649 aa  312  7.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  35.68 
 
 		 653 aa  310  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  36.5 
 
 		 603 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  37.97 
 
 		 617 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  35.76 
 
 		 707 aa  309  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  37.89 
 
 		 607 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0387  excinuclease ABC, C subunit  33.76 
 
 		 598 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.971851 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  37.84 
 
 		 649 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  36.2 
 
 		 666 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  35.76 
 
 		 707 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  35.56 
 
 		 599 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3241  excinuclease ABC, C subunit  37.87 
 
 		 607 aa  306  6e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0161382  hitchhiker  0.00210477 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  37.66 
 
 		 623 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0520  excinuclease ABC subunit C  36.98 
 
 		 599 aa  305  1.0000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.545432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>