More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1103 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1103  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 528 aa  1081    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  44.51 
 
 		 527 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  43.56 
 
 		 520 aa  426  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  42.12 
 
 		 519 aa  423  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0854  excinuclease ABC subunit C  44.13 
 
 		 526 aa  423  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  44.05 
 
 		 527 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1822  excinuclease ABC subunit C  42.12 
 
 		 521 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  41.06 
 
 		 517 aa  413  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1600  excinuclease ABC subunit C  42.53 
 
 		 527 aa  414  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0084899  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1321  excinuclease ABC subunit C  41.22 
 
 		 516 aa  396  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0107777  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  38.67 
 
 		 520 aa  380  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  40.88 
 
 		 607 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  38.17 
 
 		 616 aa  349  6e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  36.92 
 
 		 627 aa  348  2e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  37.91 
 
 		 631 aa  347  4e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 629 aa  345  1e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  38.42 
 
 		 628 aa  344  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  36.72 
 
 		 613 aa  345  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  35.91 
 
 		 619 aa  343  5e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  35.32 
 
 		 601 aa  341  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  37.06 
 
 		 610 aa  336  5.999999999999999e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  37.57 
 
 		 604 aa  335  9e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  34.76 
 
 		 620 aa  334  3e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  34.76 
 
 		 620 aa  333  6e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  37.87 
 
 		 591 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  36.38 
 
 		 610 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  37.52 
 
 		 594 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  35.56 
 
 		 641 aa  329  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  36.97 
 
 		 594 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  36.62 
 
 		 593 aa  327  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  36.62 
 
 		 593 aa  327  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  36.83 
 
 		 607 aa  325  1e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  36.57 
 
 		 594 aa  325  1e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  35.28 
 
 		 591 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  36.73 
 
 		 594 aa  325  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  37.15 
 
 		 594 aa  324  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  36.83 
 
 		 607 aa  323  3e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  36.41 
 
 		 594 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  36.41 
 
 		 594 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  36.41 
 
 		 594 aa  323  6e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  36.41 
 
 		 594 aa  323  6e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  36.41 
 
 		 594 aa  323  6e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  36.41 
 
 		 594 aa  323  7e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  34.62 
 
 		 611 aa  322  9.000000000000001e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  36.04 
 
 		 628 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  37.27 
 
 		 596 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  36.22 
 
 		 614 aa  320  5e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  36.28 
 
 		 590 aa  319  7e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  36.04 
 
 		 615 aa  318  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  35.7 
 
 		 685 aa  318  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  34.55 
 
 		 622 aa  318  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  35.78 
 
 		 602 aa  318  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  36.4 
 
 		 607 aa  317  3e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  35.77 
 
 		 598 aa  316  6e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  35.66 
 
 		 596 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  32.48 
 
 		 652 aa  313  4.999999999999999e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  37.55 
 
 		 594 aa  311  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  35.73 
 
 		 613 aa  310  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  34.81 
 
 		 593 aa  310  4e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  35.53 
 
 		 598 aa  310  4e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  34.29 
 
 		 624 aa  310  5e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  34.28 
 
 		 625 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  35.57 
 
 		 593 aa  304  3.0000000000000004e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  35.14 
 
 		 597 aa  303  4.0000000000000003e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  35.39 
 
 		 615 aa  303  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  35.64 
 
 		 603 aa  303  7.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  34.55 
 
 		 636 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0044  excinuclease ABC, C subunit  36.02 
 
 		 613 aa  299  8e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.101531  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  34.67 
 
 		 613 aa  298  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  35.35 
 
 		 596 aa  297  3e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  34.55 
 
 		 627 aa  297  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  35.38 
 
 		 613 aa  295  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  32.37 
 
 		 707 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  31.59 
 
 		 613 aa  293  4e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  32.54 
 
 		 707 aa  293  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2640  excinuclease ABC subunit C  32.77 
 
 		 579 aa  292  1e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.347112  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  32.37 
 
 		 707 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  32.01 
 
 		 656 aa  291  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  33.87 
 
 		 612 aa  290  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  35.85 
 
 		 596 aa  290  3e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0328  excinuclease ABC subunit C  34.45 
 
 		 640 aa  289  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.462253  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  34 
 
 		 625 aa  289  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2488  excinuclease ABC subunit C  35.56 
 
 		 716 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820608  normal  0.0424579 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  34.27 
 
 		 595 aa  288  1e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  33.15 
 
 		 624 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2397  excinuclease ABC subunit C  34.83 
 
 		 598 aa  288  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.866418 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  34.17 
 
 		 622 aa  286  5e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  33.21 
 
 		 628 aa  286  5e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10011  excinuclease ABC subunit C  34.27 
 
 		 640 aa  286  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.404154  normal  0.496638 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  32.98 
 
 		 615 aa  286  7e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  34.47 
 
 		 599 aa  286  8e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  32.71 
 
 		 617 aa  285  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  33.27 
 
 		 617 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  31.69 
 
 		 614 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0520  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 599 aa  283  4.0000000000000003e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.545432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  33.39 
 
 		 623 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1509  excinuclease ABC, C subunit  35.25 
 
 		 594 aa  283  5.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.94656  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  34.12 
 
 		 677 aa  283  5.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  32.8 
 
 		 616 aa  283  6.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  34.19 
 
 		 617 aa  283  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>