More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2640 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2640  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 579 aa  1145    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.347112  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2725  excinuclease ABC subunit C  66.95 
 
 		 592 aa  746    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3639  excinuclease ABC, C subunit  67.05 
 
 		 597 aa  780    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2078  excinuclease ABC, C subunit  65.3 
 
 		 604 aa  746    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1072  excinuclease ABC subunit C  67.93 
 
 		 575 aa  709    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353425  normal  0.0879577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  37.54 
 
 		 607 aa  365  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  38.7 
 
 		 613 aa  363  5.0000000000000005e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  34.97 
 
 		 607 aa  353  4e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  34.8 
 
 		 607 aa  353  5.9999999999999994e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  34.97 
 
 		 607 aa  349  7e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  38.58 
 
 		 607 aa  347  4e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  37.96 
 
 		 613 aa  343  2.9999999999999997e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  36.76 
 
 		 617 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  36.76 
 
 		 617 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  35.96 
 
 		 588 aa  339  7e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  35.91 
 
 		 635 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  35.45 
 
 		 628 aa  337  5e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  35.09 
 
 		 616 aa  336  5.999999999999999e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  34.86 
 
 		 641 aa  336  7e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  36.16 
 
 		 624 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  34.55 
 
 		 628 aa  335  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  35.24 
 
 		 631 aa  335  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  35.95 
 
 		 627 aa  333  7.000000000000001e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  32.34 
 
 		 615 aa  332  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  35.27 
 
 		 619 aa  332  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  37.29 
 
 		 627 aa  330  3e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  37.29 
 
 		 621 aa  330  4e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  37.85 
 
 		 622 aa  330  4e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  34.7 
 
 		 638 aa  330  6e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  35.23 
 
 		 601 aa  329  7e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  32.37 
 
 		 685 aa  329  8e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  37.12 
 
 		 609 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  34.62 
 
 		 613 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  39.19 
 
 		 615 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  37.44 
 
 		 614 aa  326  8.000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  37.21 
 
 		 598 aa  323  4e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2397  excinuclease ABC subunit C  35.48 
 
 		 598 aa  323  6e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.866418 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  31.65 
 
 		 620 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1060  excinuclease ABC subunit C  38.25 
 
 		 658 aa  321  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41739  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  31.83 
 
 		 625 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  35.18 
 
 		 627 aa  321  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  36 
 
 		 653 aa  321  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  31.48 
 
 		 620 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  34.63 
 
 		 622 aa  320  5e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  33.22 
 
 		 596 aa  320  6e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  36.98 
 
 		 631 aa  319  9e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1362  excinuclease ABC subunit C  36.01 
 
 		 704 aa  319  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  36.38 
 
 		 520 aa  318  1e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  37.31 
 
 		 611 aa  318  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  37.87 
 
 		 605 aa  318  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  38.35 
 
 		 611 aa  318  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  36 
 
 		 599 aa  317  3e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  30.77 
 
 		 613 aa  317  4e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1271  excinuclease ABC subunit C  35.11 
 
 		 606 aa  317  4e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0834  excinuclease ABC subunit C  34.44 
 
 		 610 aa  316  6e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000370037  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  37.69 
 
 		 603 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  34.32 
 
 		 591 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3146  excinuclease ABC subunit C  35.81 
 
 		 690 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.055346  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5405  excinuclease ABC, C subunit  35.33 
 
 		 688 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  33.92 
 
 		 613 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  35.83 
 
 		 607 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  35.16 
 
 		 607 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  36.11 
 
 		 607 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  36.64 
 
 		 639 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0659  excinuclease ABC subunit C  34.82 
 
 		 557 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  37.06 
 
 		 623 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  36.56 
 
 		 623 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  35.4 
 
 		 610 aa  313  5.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  36.56 
 
 		 623 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  35.67 
 
 		 607 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1975  excinuclease ABC subunit C  35.93 
 
 		 653 aa  312  9e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  35.45 
 
 		 607 aa  312  9e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  35.03 
 
 		 607 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0936  excinuclease ABC subunit C  36.58 
 
 		 657 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.581594  normal  0.110547 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2316  excinuclease ABC subunit C  36.05 
 
 		 645 aa  311  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.682688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0683  excinuclease ABC subunit C  34.97 
 
 		 557 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1509  excinuclease ABC, C subunit  35.23 
 
 		 594 aa  311  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.94656  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2878  excinuclease ABC, C subunit  34.81 
 
 		 682 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1001  excinuclease ABC subunit C  36.1 
 
 		 657 aa  309  9e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3001  excinuclease ABC, C subunit  35.03 
 
 		 700 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3104  excinuclease ABC, C subunit  34.65 
 
 		 682 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299342  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00582  excinuclease ABC subunit C  37.95 
 
 		 618 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02747  excinuclease ABC subunit C  33.39 
 
 		 588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0516  excinuclease ABC subunit C  32.91 
 
 		 658 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  34.92 
 
 		 625 aa  308  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  35.39 
 
 		 624 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0657  excinuclease ABC subunit C  31.09 
 
 		 603 aa  307  3e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000040695  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0046  excinuclease ABC subunit C  36.5 
 
 		 629 aa  308  3e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.714841  hitchhiker  0.00962006 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  36.62 
 
 		 626 aa  307  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  33 
 
 		 596 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2140  excinuclease ABC subunit C  34.23 
 
 		 608 aa  307  4.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.604529  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  35.65 
 
 		 585 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1451  excinuclease ABC subunit C  34.43 
 
 		 610 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1177  excinuclease ABC subunit C  35.31 
 
 		 695 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.8668  normal  0.100977 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1403  excinuclease ABC subunit C  38.5 
 
 		 614 aa  306  6e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.252536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  33.17 
 
 		 604 aa  306  6e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  34 
 
 		 619 aa  306  6e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2589  excinuclease ABC subunit C  35.41 
 
 		 691 aa  306  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0718587  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  35.81 
 
 		 665 aa  306  8.000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  31.22 
 
 		 598 aa  306  8.000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>