More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1072 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3639  excinuclease ABC, C subunit  70.85 
 
 		 597 aa  816    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2640  excinuclease ABC subunit C  67.93 
 
 		 579 aa  762    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.347112  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2725  excinuclease ABC subunit C  71.11 
 
 		 592 aa  790    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1072  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 575 aa  1143    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353425  normal  0.0879577 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2078  excinuclease ABC, C subunit  68.54 
 
 		 604 aa  776    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  37.33 
 
 		 607 aa  348  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  35.08 
 
 		 598 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  37.87 
 
 		 622 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  37.31 
 
 		 613 aa  335  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  33.11 
 
 		 615 aa  333  8e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  36.2 
 
 		 624 aa  329  6e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  34.99 
 
 		 641 aa  326  6e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  36.5 
 
 		 613 aa  325  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  34.37 
 
 		 607 aa  325  2e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  36.96 
 
 		 617 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  36.96 
 
 		 617 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  35.27 
 
 		 607 aa  324  3e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1060  excinuclease ABC subunit C  37.48 
 
 		 658 aa  323  6e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41739  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  36.35 
 
 		 588 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  39.17 
 
 		 614 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  37.81 
 
 		 623 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  35.25 
 
 		 601 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  37.81 
 
 		 623 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  36.82 
 
 		 624 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  32.48 
 
 		 620 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  34.62 
 
 		 631 aa  320  5e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  33.72 
 
 		 607 aa  320  6e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  35.73 
 
 		 635 aa  320  6e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  32.32 
 
 		 620 aa  320  6e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  35.89 
 
 		 610 aa  319  9e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  38.17 
 
 		 631 aa  317  4e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  34.21 
 
 		 628 aa  317  5e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  36.93 
 
 		 603 aa  316  6e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0657  excinuclease ABC subunit C  32.33 
 
 		 603 aa  316  9e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000040695  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2878  excinuclease ABC, C subunit  36.72 
 
 		 682 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  35.46 
 
 		 627 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  36.92 
 
 		 639 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3001  excinuclease ABC, C subunit  37.07 
 
 		 700 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  34.13 
 
 		 638 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  38.08 
 
 		 631 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3104  excinuclease ABC, C subunit  36.57 
 
 		 682 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299342  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  34.56 
 
 		 613 aa  312  7.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  38.54 
 
 		 615 aa  312  9e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  37.31 
 
 		 623 aa  312  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  36.7 
 
 		 607 aa  312  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5405  excinuclease ABC, C subunit  37 
 
 		 688 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2589  excinuclease ABC subunit C  36.9 
 
 		 691 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0718587  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1975  excinuclease ABC subunit C  36.74 
 
 		 653 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2397  excinuclease ABC subunit C  34.69 
 
 		 598 aa  310  5e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.866418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3146  excinuclease ABC subunit C  37.09 
 
 		 690 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.055346  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  35.88 
 
 		 520 aa  310  6.999999999999999e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  31.6 
 
 		 625 aa  309  9e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  32.63 
 
 		 628 aa  309  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  36.39 
 
 		 616 aa  309  1.0000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  34.99 
 
 		 622 aa  309  1.0000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  35.81 
 
 		 598 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  35.05 
 
 		 591 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  35.26 
 
 		 609 aa  306  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  33.72 
 
 		 604 aa  306  9.000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  35.25 
 
 		 707 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  31.91 
 
 		 685 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  35.76 
 
 		 644 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  34.62 
 
 		 610 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0516  excinuclease ABC subunit C  33.12 
 
 		 658 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10011  excinuclease ABC subunit C  33.01 
 
 		 640 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.404154  normal  0.496638 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0659  excinuclease ABC subunit C  34.91 
 
 		 557 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  38.64 
 
 		 611 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  37.17 
 
 		 605 aa  303  6.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  31.36 
 
 		 613 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1509  excinuclease ABC, C subunit  34.8 
 
 		 594 aa  303  6.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.94656  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 594 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 594 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1193  excinuclease ABC, C subunit  33.05 
 
 		 609 aa  303  7.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  34.95 
 
 		 707 aa  302  9e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  33.17 
 
 		 594 aa  302  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  33.17 
 
 		 594 aa  302  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  34.4 
 
 		 653 aa  302  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0328  excinuclease ABC subunit C  33.01 
 
 		 640 aa  302  1e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.462253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  33.17 
 
 		 594 aa  302  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  34.45 
 
 		 610 aa  302  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  36.82 
 
 		 611 aa  302  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  34.45 
 
 		 610 aa  302  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  34.45 
 
 		 610 aa  302  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  34.45 
 
 		 610 aa  302  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  34.45 
 
 		 610 aa  301  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  35.48 
 
 		 627 aa  301  2e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  33.66 
 
 		 628 aa  301  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  35.48 
 
 		 621 aa  301  2e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2316  excinuclease ABC subunit C  34.77 
 
 		 645 aa  301  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.682688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1362  excinuclease ABC subunit C  35.54 
 
 		 704 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  33.55 
 
 		 619 aa  301  2e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4277  excinuclease ABC subunit C  35.52 
 
 		 634 aa  301  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  35.27 
 
 		 625 aa  300  4e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  33 
 
 		 594 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  34.29 
 
 		 610 aa  300  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  36 
 
 		 590 aa  300  5e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  32.83 
 
 		 594 aa  300  5e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  32.67 
 
 		 594 aa  300  6e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0699  excinuclease ABC subunit C  36.86 
 
 		 690 aa  299  7e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0690  excinuclease ABC subunit C  36.86 
 
 		 690 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.485523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>