More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2078 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2078  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 
604 aa  1215    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3639  excinuclease ABC, C subunit  83.25 
 
 
597 aa  1037    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2725  excinuclease ABC subunit C  68.6 
 
 
592 aa  798    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2640  excinuclease ABC subunit C  65.46 
 
 
579 aa  773    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.347112  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1072  excinuclease ABC subunit C  68.87 
 
 
575 aa  752    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353425  normal  0.0879577 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0659  excinuclease ABC subunit C  36.29 
 
 
557 aa  348  1e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0683  excinuclease ABC subunit C  35.69 
 
 
557 aa  341  2e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  36.51 
 
 
613 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  33.97 
 
 
607 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2878  excinuclease ABC, C subunit  35.62 
 
 
682 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3104  excinuclease ABC, C subunit  35.46 
 
 
682 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299342  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  36.23 
 
 
613 aa  327  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  36.59 
 
 
616 aa  327  6e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  36.45 
 
 
622 aa  326  8.000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  36.18 
 
 
617 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  36.18 
 
 
617 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3001  excinuclease ABC, C subunit  35.3 
 
 
700 aa  325  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5405  excinuclease ABC, C subunit  35.62 
 
 
688 aa  323  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  36.32 
 
 
598 aa  322  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3146  excinuclease ABC subunit C  36.04 
 
 
690 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.055346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  31.37 
 
 
615 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  33.9 
 
 
619 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  34.46 
 
 
628 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  34.99 
 
 
624 aa  319  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2589  excinuclease ABC subunit C  35.03 
 
 
691 aa  318  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0718587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  33.48 
 
 
641 aa  317  4e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  34.33 
 
 
631 aa  316  7e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  32.6 
 
 
607 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  32.92 
 
 
607 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  34.58 
 
 
588 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1975  excinuclease ABC subunit C  35.19 
 
 
653 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  32.54 
 
 
598 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  36.39 
 
 
614 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0699  excinuclease ABC subunit C  35.45 
 
 
690 aa  314  2.9999999999999996e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1362  excinuclease ABC subunit C  35.23 
 
 
704 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  34.87 
 
 
610 aa  313  4.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  35.31 
 
 
644 aa  313  4.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  34.77 
 
 
623 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  34.77 
 
 
623 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  34.38 
 
 
616 aa  313  9e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0690  excinuclease ABC subunit C  35.45 
 
 
690 aa  312  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.485523  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  33.01 
 
 
627 aa  311  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  33.12 
 
 
607 aa  310  4e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0772  excinuclease ABC subunit C  34.84 
 
 
633 aa  310  4e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00962744  normal  0.347624 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  30.19 
 
 
620 aa  310  5e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  35.04 
 
 
628 aa  309  9e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1177  excinuclease ABC subunit C  34.99 
 
 
695 aa  309  9e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.8668  normal  0.100977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0901  excinuclease ABC subunit C  34.67 
 
 
699 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.686054  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  30.03 
 
 
620 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2397  excinuclease ABC subunit C  33.17 
 
 
598 aa  308  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.866418 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  33.02 
 
 
591 aa  307  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  33.12 
 
 
601 aa  308  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2526  excinuclease ABC subunit C  35.47 
 
 
666 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  35.51 
 
 
631 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  33.8 
 
 
624 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  34.06 
 
 
520 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  31.15 
 
 
618 aa  306  6e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1509  excinuclease ABC, C subunit  35.21 
 
 
594 aa  306  8.000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.94656  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  34.5 
 
 
623 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  31.26 
 
 
618 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 
629 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  34.13 
 
 
627 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1060  excinuclease ABC subunit C  35.2 
 
 
658 aa  305  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41739  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  31.14 
 
 
685 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1193  excinuclease ABC, C subunit  31.71 
 
 
609 aa  305  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  34.19 
 
 
607 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  32.54 
 
 
612 aa  304  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1281  excinuclease ABC subunit C  34.99 
 
 
695 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280524  normal  0.136737 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  35.79 
 
 
605 aa  303  8.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  31.44 
 
 
638 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  34.61 
 
 
607 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1854  excinuclease ABC subunit C  30.5 
 
 
574 aa  301  2e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.971322  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2276  excinuclease ABC, C subunit  35.31 
 
 
644 aa  300  4e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  31.19 
 
 
613 aa  300  4e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0516  excinuclease ABC subunit C  33.49 
 
 
658 aa  300  4e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  34.75 
 
 
639 aa  300  5e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1086  excinuclease ABC subunit C  33.28 
 
 
680 aa  300  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000501867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  33.92 
 
 
607 aa  300  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1728  excinuclease ABC subunit C  34.42 
 
 
688 aa  300  7e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0415792 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0936  excinuclease ABC subunit C  33.44 
 
 
657 aa  299  8e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.581594  normal  0.110547 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  34.94 
 
 
611 aa  299  8e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 
599 aa  299  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  34.5 
 
 
627 aa  298  2e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  33.17 
 
 
635 aa  298  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  34.5 
 
 
621 aa  298  2e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0782  excinuclease ABC subunit C  34 
 
 
674 aa  298  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191761  normal  0.0714693 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4491  excinuclease ABC subunit C  34.95 
 
 
642 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.191027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4277  excinuclease ABC subunit C  34.38 
 
 
634 aa  297  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  34.53 
 
 
626 aa  297  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  31.68 
 
 
594 aa  297  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  31.68 
 
 
594 aa  297  4e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  31.68 
 
 
594 aa  297  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  35.15 
 
 
617 aa  297  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  31.76 
 
 
625 aa  297  5e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  33.6 
 
 
622 aa  297  5e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  31.68 
 
 
594 aa  296  7e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  31.68 
 
 
594 aa  296  7e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  32.19 
 
 
609 aa  296  7e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  30.88 
 
 
594 aa  296  8e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  34.13 
 
 
607 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>