More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2725 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2725  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 592 aa  1169    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3639  excinuclease ABC, C subunit  70.96 
 
 		 597 aa  831    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2640  excinuclease ABC subunit C  66.95 
 
 		 579 aa  766    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.347112  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1072  excinuclease ABC subunit C  71.11 
 
 		 575 aa  770    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353425  normal  0.0879577 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2078  excinuclease ABC, C subunit  67.93 
 
 		 604 aa  790    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  37.4 
 
 		 607 aa  353  4e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  38.52 
 
 		 613 aa  353  5e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  37.9 
 
 		 622 aa  352  8e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  36.27 
 
 		 588 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  38.87 
 
 		 614 aa  341  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  37.6 
 
 		 613 aa  340  4e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  35.3 
 
 		 628 aa  339  7e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  34.5 
 
 		 607 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  36.79 
 
 		 624 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  36.18 
 
 		 619 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  36.1 
 
 		 631 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  39.87 
 
 		 615 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  34.5 
 
 		 607 aa  336  5.999999999999999e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  37.44 
 
 		 607 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  35.63 
 
 		 628 aa  332  2e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  35.43 
 
 		 619 aa  331  3e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5405  excinuclease ABC, C subunit  36.96 
 
 		 688 aa  330  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  36.5 
 
 		 617 aa  330  6e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  36.5 
 
 		 617 aa  330  6e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0659  excinuclease ABC subunit C  35.74 
 
 		 557 aa  330  6e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3001  excinuclease ABC, C subunit  36.48 
 
 		 700 aa  329  7e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  35.19 
 
 		 641 aa  329  9e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0683  excinuclease ABC subunit C  35.95 
 
 		 557 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2397  excinuclease ABC subunit C  35.38 
 
 		 598 aa  328  2.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.866418 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  34.04 
 
 		 598 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  37.56 
 
 		 623 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  33.87 
 
 		 607 aa  327  5e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  35.95 
 
 		 599 aa  327  5e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  37.56 
 
 		 623 aa  327  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  37.44 
 
 		 623 aa  326  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  35.34 
 
 		 635 aa  326  7e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2878  excinuclease ABC, C subunit  36.07 
 
 		 682 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  35.83 
 
 		 616 aa  325  1e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  34.96 
 
 		 627 aa  325  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  37.84 
 
 		 626 aa  325  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3104  excinuclease ABC, C subunit  35.76 
 
 		 682 aa  323  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299342  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  32.29 
 
 		 685 aa  322  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0690  excinuclease ABC subunit C  36.22 
 
 		 690 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.485523  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  38 
 
 		 616 aa  322  9.999999999999999e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2589  excinuclease ABC subunit C  35.48 
 
 		 691 aa  322  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0718587  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1060  excinuclease ABC subunit C  37.95 
 
 		 658 aa  320  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41739  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0772  excinuclease ABC subunit C  36.45 
 
 		 633 aa  321  3e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00962744  normal  0.347624 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  37.52 
 
 		 605 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  34.42 
 
 		 604 aa  320  5e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  35.55 
 
 		 598 aa  319  7e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  36.63 
 
 		 627 aa  319  7e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  36.63 
 
 		 621 aa  319  7.999999999999999e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0699  excinuclease ABC subunit C  36.06 
 
 		 690 aa  319  9e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  34.48 
 
 		 638 aa  319  9e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  35.38 
 
 		 609 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  34.58 
 
 		 601 aa  318  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  38.62 
 
 		 611 aa  317  5e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2623  excinuclease ABC subunit C  36.56 
 
 		 657 aa  317  5e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.313972  normal  0.0935336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1185  excinuclease ABC subunit C  36.56 
 
 		 657 aa  316  7e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  36.63 
 
 		 603 aa  316  8e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0516  excinuclease ABC subunit C  33.96 
 
 		 658 aa  316  9e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  34.88 
 
 		 629 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  36.3 
 
 		 653 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2276  excinuclease ABC, C subunit  37.22 
 
 		 644 aa  314  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1932  excinuclease ABC subunit C  37.1 
 
 		 692 aa  315  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0596454 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  37.38 
 
 		 611 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  34.94 
 
 		 591 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1177  excinuclease ABC subunit C  36.98 
 
 		 695 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.8668  normal  0.100977 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  31.64 
 
 		 615 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  38.29 
 
 		 631 aa  314  3.9999999999999997e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  33.71 
 
 		 596 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  34.99 
 
 		 613 aa  313  6.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  33.28 
 
 		 625 aa  313  6.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0782  excinuclease ABC subunit C  36.35 
 
 		 674 aa  313  7.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191761  normal  0.0714693 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  32.95 
 
 		 618 aa  312  9e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  33.06 
 
 		 594 aa  312  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  35.81 
 
 		 607 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  33.39 
 
 		 594 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  35.77 
 
 		 607 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  33.6 
 
 		 618 aa  311  2e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1509  excinuclease ABC, C subunit  34.98 
 
 		 594 aa  311  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.94656  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3146  excinuclease ABC subunit C  36.82 
 
 		 690 aa  311  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.055346  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  35.8 
 
 		 677 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  33.39 
 
 		 594 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  33.39 
 
 		 594 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  33.39 
 
 		 594 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1362  excinuclease ABC subunit C  36.39 
 
 		 704 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  35.45 
 
 		 607 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  34.38 
 
 		 627 aa  310  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  33.39 
 
 		 594 aa  310  5e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  33.39 
 
 		 594 aa  310  5e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2244  excinuclease ABC subunit C  35.89 
 
 		 663 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  33.23 
 
 		 613 aa  309  8e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0936  excinuclease ABC subunit C  36.1 
 
 		 657 aa  309  9e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.581594  normal  0.110547 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1001  excinuclease ABC subunit C  36.1 
 
 		 657 aa  309  9e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  33.23 
 
 		 594 aa  309  9e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  36.83 
 
 		 639 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  36.86 
 
 		 631 aa  308  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1281  excinuclease ABC subunit C  36.82 
 
 		 695 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280524  normal  0.136737 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  33.11 
 
 		 594 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>