More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1854 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1854  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 574 aa  1144    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.971322  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0683  excinuclease ABC subunit C  46.74 
 
 		 557 aa  499  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0659  excinuclease ABC subunit C  46.65 
 
 		 557 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0196  excinuclease ABC subunit C  44.77 
 
 		 563 aa  433  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1736  excinuclease ABC subunit C  43.67 
 
 		 550 aa  429  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00115993  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  39.47 
 
 		 607 aa  395  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  34.8 
 
 		 622 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  33.28 
 
 		 607 aa  345  2e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  37.31 
 
 		 593 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  35.66 
 
 		 604 aa  343  4e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  38.01 
 
 		 594 aa  343  5e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  34.96 
 
 		 596 aa  342  1e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  33.61 
 
 		 613 aa  340  2.9999999999999998e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  33.17 
 
 		 624 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  33.11 
 
 		 607 aa  340  4e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  33.06 
 
 		 607 aa  339  7e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2397  excinuclease ABC subunit C  35.17 
 
 		 598 aa  339  9e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.866418 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  35.48 
 
 		 599 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  33.83 
 
 		 617 aa  338  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  36.35 
 
 		 613 aa  336  7e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  35.18 
 
 		 588 aa  335  9e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  33.11 
 
 		 607 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  36.83 
 
 		 598 aa  335  2e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  32.1 
 
 		 614 aa  331  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  34.55 
 
 		 626 aa  331  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  38.61 
 
 		 519 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  32.78 
 
 		 607 aa  329  9e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  34.48 
 
 		 613 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  33.17 
 
 		 628 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  34.74 
 
 		 619 aa  325  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  32.78 
 
 		 609 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  32.45 
 
 		 607 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  34.25 
 
 		 601 aa  324  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  33.55 
 
 		 613 aa  324  3e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  33.99 
 
 		 616 aa  323  6e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  31.57 
 
 		 611 aa  323  7e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  33.55 
 
 		 644 aa  323  7e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  34.62 
 
 		 616 aa  322  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  33.93 
 
 		 625 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 585 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  32.72 
 
 		 599 aa  321  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  31.57 
 
 		 641 aa  321  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1271  excinuclease ABC subunit C  34.43 
 
 		 606 aa  319  9e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  34.01 
 
 		 627 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  32.61 
 
 		 612 aa  318  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  31.95 
 
 		 604 aa  318  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  32.02 
 
 		 603 aa  318  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  33.84 
 
 		 627 aa  318  2e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  33.06 
 
 		 626 aa  317  4e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  30.85 
 
 		 607 aa  317  5e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  36.28 
 
 		 517 aa  317  5e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  34.61 
 
 		 628 aa  316  6e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  31.84 
 
 		 638 aa  317  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  31.78 
 
 		 607 aa  316  9e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  32.17 
 
 		 607 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  31.4 
 
 		 607 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3241  excinuclease ABC, C subunit  33.5 
 
 		 607 aa  315  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0161382  hitchhiker  0.00210477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  31.11 
 
 		 607 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  32.28 
 
 		 610 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  34.57 
 
 		 591 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2140  excinuclease ABC subunit C  32.67 
 
 		 608 aa  313  5.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.604529  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  33.22 
 
 		 625 aa  313  5.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  38.4 
 
 		 527 aa  312  7.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  33.67 
 
 		 647 aa  312  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  32.07 
 
 		 610 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  32.78 
 
 		 628 aa  311  2e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  33.5 
 
 		 619 aa  311  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  32.27 
 
 		 603 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0044  excinuclease ABC, C subunit  34.3 
 
 		 613 aa  311  2.9999999999999997e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.101531  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  32.78 
 
 		 609 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0464  excinuclease ABC subunit C  35.38 
 
 		 603 aa  311  2.9999999999999997e-83  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.646786  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1861  excinuclease ABC subunit C  32.95 
 
 		 609 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  33.72 
 
 		 590 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  32.32 
 
 		 594 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0834  excinuclease ABC subunit C  31.84 
 
 		 610 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000370037  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1600  excinuclease ABC subunit C  37.22 
 
 		 527 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0084899  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  32.06 
 
 		 653 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  38.43 
 
 		 527 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  32.73 
 
 		 618 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  32.57 
 
 		 618 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  32.83 
 
 		 598 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  31.34 
 
 		 607 aa  308  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1548  excinuclease ABC subunit C  32.78 
 
 		 609 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  31.39 
 
 		 608 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  31.39 
 
 		 608 aa  308  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  32.94 
 
 		 611 aa  307  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  32.67 
 
 		 609 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  33.28 
 
 		 624 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  33.17 
 
 		 631 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  32.46 
 
 		 685 aa  306  6e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  33.17 
 
 		 613 aa  306  6e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1615  excinuclease ABC subunit C  32.78 
 
 		 609 aa  306  6e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000543557  normal  0.3636 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1609  excinuclease ABC subunit C  32.78 
 
 		 609 aa  306  6e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000167064  normal  0.0818954 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  32.27 
 
 		 605 aa  306  9.000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0657  excinuclease ABC subunit C  34.01 
 
 		 603 aa  306  9.000000000000001e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000040695  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  34.91 
 
 		 594 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  34.91 
 
 		 594 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  32.93 
 
 		 591 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  34.91 
 
 		 594 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  34.91 
 
 		 594 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>