More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1736 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1736  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 550 aa  1097    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00115993  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0196  excinuclease ABC subunit C  51.61 
 
 		 563 aa  541  9.999999999999999e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0659  excinuclease ABC subunit C  47.53 
 
 		 557 aa  498  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0683  excinuclease ABC subunit C  47.44 
 
 		 557 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1854  excinuclease ABC subunit C  43.67 
 
 		 574 aa  429  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.971322  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  33.9 
 
 		 607 aa  304  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  35.45 
 
 		 594 aa  287  4e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  35.64 
 
 		 598 aa  286  5.999999999999999e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  33.05 
 
 		 601 aa  285  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  33.16 
 
 		 593 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  33.28 
 
 		 604 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  32 
 
 		 607 aa  281  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  33.66 
 
 		 624 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  33.86 
 
 		 591 aa  280  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  32 
 
 		 607 aa  280  6e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1509  excinuclease ABC, C subunit  32.23 
 
 		 594 aa  278  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.94656  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  32.95 
 
 		 647 aa  277  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2397  excinuclease ABC subunit C  33.16 
 
 		 598 aa  278  3e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.866418 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  31.24 
 
 		 626 aa  277  5e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  32.54 
 
 		 622 aa  276  6e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  32.23 
 
 		 625 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  31.83 
 
 		 607 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  32.36 
 
 		 596 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  31.21 
 
 		 644 aa  273  4.0000000000000004e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  30.91 
 
 		 610 aa  274  4.0000000000000004e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  34.33 
 
 		 620 aa  273  7e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  30.97 
 
 		 708 aa  270  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  33.72 
 
 		 620 aa  269  8e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  32.83 
 
 		 591 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  33.28 
 
 		 590 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  30.99 
 
 		 613 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  29.65 
 
 		 614 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  31.08 
 
 		 611 aa  265  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2640  excinuclease ABC subunit C  28.55 
 
 		 579 aa  265  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.347112  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  31.37 
 
 		 626 aa  264  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  30.86 
 
 		 599 aa  264  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0871  excinuclease ABC subunit C  33.79 
 
 		 600 aa  264  4e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0659  excinuclease ABC subunit C  29.67 
 
 		 609 aa  263  6e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.25379  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  34.83 
 
 		 594 aa  263  8e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  34.83 
 
 		 594 aa  263  8e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  32.07 
 
 		 616 aa  263  8.999999999999999e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  34.66 
 
 		 594 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  34.66 
 
 		 594 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  31.8 
 
 		 619 aa  261  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  31.01 
 
 		 628 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  34.66 
 
 		 594 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  31.54 
 
 		 627 aa  261  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  34.14 
 
 		 596 aa  260  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  34.55 
 
 		 594 aa  259  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  30.63 
 
 		 618 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  30.79 
 
 		 618 aa  259  1e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0205  excinuclease ABC subunit C  31.82 
 
 		 614 aa  259  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0351181  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  31.23 
 
 		 685 aa  258  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0087  excinuclease ABC subunit C  32.82 
 
 		 576 aa  259  1e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.139428  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  30.55 
 
 		 609 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  34.31 
 
 		 594 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  34.71 
 
 		 594 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  32.19 
 
 		 593 aa  257  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  29.9 
 
 		 610 aa  257  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  30.9 
 
 		 611 aa  258  3e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3639  excinuclease ABC, C subunit  28.24 
 
 		 597 aa  257  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  32.19 
 
 		 593 aa  257  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  31 
 
 		 678 aa  257  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  34.48 
 
 		 594 aa  257  5e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  29.64 
 
 		 604 aa  256  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  34.48 
 
 		 594 aa  256  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1784  excinuclease ABC, C subunit  29.76 
 
 		 737 aa  256  8e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  30.91 
 
 		 615 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  33.04 
 
 		 594 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  31.01 
 
 		 641 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  32.08 
 
 		 599 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  30.81 
 
 		 650 aa  255  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  30.47 
 
 		 609 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  29.01 
 
 		 616 aa  254  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1600  excinuclease ABC subunit C  35.24 
 
 		 527 aa  254  3e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0084899  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0464  excinuclease ABC subunit C  33.9 
 
 		 603 aa  254  4.0000000000000004e-66  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.646786  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  30.91 
 
 		 676 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  30.91 
 
 		 676 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  31.58 
 
 		 631 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  30.91 
 
 		 676 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  31.36 
 
 		 593 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  29.85 
 
 		 607 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2316  excinuclease ABC subunit C  30.9 
 
 		 645 aa  253  8.000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.682688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  33.27 
 
 		 519 aa  253  9.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  29.79 
 
 		 607 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  29.08 
 
 		 613 aa  252  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2078  excinuclease ABC, C subunit  27.75 
 
 		 604 aa  252  1e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  34.46 
 
 		 527 aa  252  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  29.63 
 
 		 666 aa  252  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0657  excinuclease ABC subunit C  31.96 
 
 		 603 aa  252  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000040695  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  31.42 
 
 		 677 aa  252  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1246  excinuclease ABC subunit C  32.62 
 
 		 565 aa  251  2e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  31.65 
 
 		 588 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  29.88 
 
 		 605 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  31.06 
 
 		 622 aa  251  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  28.62 
 
 		 646 aa  251  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003099  excinuclease ABC subunit C  31.6 
 
 		 588 aa  251  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000908036  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  30.02 
 
 		 678 aa  251  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  29.35 
 
 		 607 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  29.08 
 
 		 679 aa  250  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>