More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0196 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0196  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 563 aa  1125    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1736  excinuclease ABC subunit C  51.61 
 
 		 550 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00115993  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0659  excinuclease ABC subunit C  51.76 
 
 		 557 aa  532  1e-150  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0683  excinuclease ABC subunit C  51.77 
 
 		 557 aa  526  1e-148  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1854  excinuclease ABC subunit C  44.77 
 
 		 574 aa  433  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.971322  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2397  excinuclease ABC subunit C  34.18 
 
 		 598 aa  319  1e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.866418 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1509  excinuclease ABC, C subunit  33.73 
 
 		 594 aa  313  6.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.94656  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  32.46 
 
 		 616 aa  306  6e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  34.47 
 
 		 617 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  34.47 
 
 		 617 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  32.08 
 
 		 626 aa  298  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  33.17 
 
 		 629 aa  296  6e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  32.95 
 
 		 624 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  32.15 
 
 		 627 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  33.01 
 
 		 624 aa  293  6e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  32.99 
 
 		 607 aa  293  6e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  33.28 
 
 		 616 aa  292  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  33.28 
 
 		 610 aa  289  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  32.61 
 
 		 622 aa  288  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  33.79 
 
 		 588 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  32.55 
 
 		 613 aa  286  7e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  32.6 
 
 		 607 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  31.81 
 
 		 625 aa  283  4.0000000000000003e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  33.82 
 
 		 620 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  33.45 
 
 		 594 aa  283  9e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  33.23 
 
 		 641 aa  282  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0464  excinuclease ABC subunit C  34.95 
 
 		 603 aa  282  1e-74  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.646786  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0087  excinuclease ABC subunit C  35.17 
 
 		 576 aa  282  1e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.139428  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  32.6 
 
 		 607 aa  281  2e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  32.13 
 
 		 628 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  33.66 
 
 		 620 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  31.09 
 
 		 638 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  32.62 
 
 		 644 aa  280  5e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  29.26 
 
 		 614 aa  280  6e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  33.28 
 
 		 601 aa  280  7e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  32.19 
 
 		 596 aa  278  1e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  32.83 
 
 		 619 aa  279  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  33.44 
 
 		 666 aa  278  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  30.44 
 
 		 611 aa  278  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  32.77 
 
 		 607 aa  278  2e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  33.5 
 
 		 627 aa  276  5e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  32.56 
 
 		 625 aa  276  7e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  32.39 
 
 		 591 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  31.89 
 
 		 622 aa  274  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  33.28 
 
 		 604 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0657  excinuclease ABC subunit C  33.56 
 
 		 603 aa  273  5.000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000040695  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10011  excinuclease ABC subunit C  31.29 
 
 		 640 aa  272  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.404154  normal  0.496638 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  32.87 
 
 		 598 aa  271  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0328  excinuclease ABC subunit C  31.17 
 
 		 640 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.462253  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  29.76 
 
 		 613 aa  271  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  32.31 
 
 		 599 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  31.9 
 
 		 652 aa  269  8.999999999999999e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3639  excinuclease ABC, C subunit  27.81 
 
 		 597 aa  269  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2316  excinuclease ABC subunit C  31.22 
 
 		 645 aa  269  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.682688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  34.27 
 
 		 593 aa  268  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  31.27 
 
 		 615 aa  269  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1608  excinuclease ABC subunit C  32.11 
 
 		 606 aa  269  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00130294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  31.59 
 
 		 685 aa  268  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  31.26 
 
 		 610 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0205  excinuclease ABC subunit C  31.39 
 
 		 614 aa  268  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0351181  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1246  excinuclease ABC subunit C  34.35 
 
 		 565 aa  268  2.9999999999999995e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  32.27 
 
 		 610 aa  268  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  32.27 
 
 		 617 aa  268  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  30.97 
 
 		 613 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  32.27 
 
 		 617 aa  266  5e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  31.77 
 
 		 626 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  31.57 
 
 		 628 aa  266  8.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  33.72 
 
 		 519 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  31.19 
 
 		 594 aa  264  3e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2013  excinuclease ABC subunit C  31.27 
 
 		 614 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.117598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09791  excinuclease ABC subunit C  32.95 
 
 		 652 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0854  excinuclease ABC subunit C  34.78 
 
 		 526 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  30.35 
 
 		 647 aa  263  8.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0918  excinuclease ABC subunit C  32.01 
 
 		 652 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.312337  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  32.45 
 
 		 631 aa  262  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  32.18 
 
 		 615 aa  262  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0834  excinuclease ABC subunit C  32.42 
 
 		 610 aa  262  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000370037  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  32.99 
 
 		 609 aa  261  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  31.13 
 
 		 677 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  31.12 
 
 		 599 aa  261  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09771  excinuclease ABC subunit C  32.01 
 
 		 652 aa  261  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  32.76 
 
 		 591 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0871  excinuclease ABC subunit C  32.03 
 
 		 600 aa  260  4e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2640  excinuclease ABC subunit C  28.24 
 
 		 579 aa  260  5.0000000000000005e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.347112  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  34.59 
 
 		 527 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  32.09 
 
 		 590 aa  259  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  31.47 
 
 		 609 aa  259  9e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2151  excinuclease ABC subunit C  31.19 
 
 		 609 aa  259  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1861  excinuclease ABC subunit C  32.21 
 
 		 609 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2599  excinuclease ABC subunit C  32.72 
 
 		 609 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00115318  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  32.2 
 
 		 613 aa  258  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2561  excinuclease ABC subunit C  32.72 
 
 		 609 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00257936  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 596 aa  258  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1783  excinuclease ABC subunit C  32.72 
 
 		 610 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0533171  hitchhiker  0.000000162173 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2676  excinuclease ABC subunit C  32.55 
 
 		 609 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  30.83 
 
 		 612 aa  256  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2454  excinuclease ABC subunit C  31.12 
 
 		 609 aa  256  8e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.263996  normal  0.543932 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2725  excinuclease ABC subunit C  28.69 
 
 		 592 aa  256  8e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  34.53 
 
 		 527 aa  256  9e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1548  excinuclease ABC subunit C  32.04 
 
 		 609 aa  256  9e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>