More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0854 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  60.38 
 
 		 519 aa  663    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0854  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 526 aa  1047    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  91.84 
 
 		 527 aa  967    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  92.98 
 
 		 527 aa  976    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1600  excinuclease ABC subunit C  76.28 
 
 		 527 aa  810    Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0084899  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  57.41 
 
 		 520 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1822  excinuclease ABC subunit C  51.34 
 
 		 521 aa  586  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  53.99 
 
 		 517 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1321  excinuclease ABC subunit C  53.14 
 
 		 516 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0107777  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  52.76 
 
 		 520 aa  558  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1103  excinuclease ABC subunit C  44.13 
 
 		 528 aa  423  1e-117  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  41.65 
 
 		 607 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  39.35 
 
 		 616 aa  370  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  37.48 
 
 		 624 aa  369  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  37.77 
 
 		 604 aa  365  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  39.75 
 
 		 631 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  37.73 
 
 		 615 aa  364  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  38.95 
 
 		 599 aa  361  2e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  38.93 
 
 		 628 aa  361  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  36.85 
 
 		 601 aa  361  2e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  36.28 
 
 		 619 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  36.74 
 
 		 685 aa  355  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0044  excinuclease ABC, C subunit  38.7 
 
 		 613 aa  354  2e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.101531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  35.33 
 
 		 611 aa  353  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  34.62 
 
 		 613 aa  350  5e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  37.16 
 
 		 627 aa  350  5e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  38.73 
 
 		 596 aa  348  1e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  37.87 
 
 		 610 aa  348  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  36.6 
 
 		 588 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  37.77 
 
 		 602 aa  347  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  32.85 
 
 		 614 aa  347  4e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  39.31 
 
 		 593 aa  346  5e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  36.73 
 
 		 607 aa  346  5e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  35.05 
 
 		 628 aa  346  7e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  36.73 
 
 		 607 aa  345  8.999999999999999e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  38.02 
 
 		 596 aa  345  1e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  38.22 
 
 		 597 aa  344  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  37.48 
 
 		 598 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  35.06 
 
 		 607 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  37.9 
 
 		 620 aa  342  8e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  37.9 
 
 		 620 aa  342  9e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  34.95 
 
 		 641 aa  342  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  36.74 
 
 		 652 aa  340  5e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  37.68 
 
 		 607 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  35.49 
 
 		 607 aa  339  9e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  34.55 
 
 		 626 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  38.5 
 
 		 596 aa  338  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  37.93 
 
 		 603 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  34 
 
 		 612 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  35.87 
 
 		 613 aa  336  5e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  36.76 
 
 		 599 aa  336  5.999999999999999e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  34.94 
 
 		 622 aa  335  7.999999999999999e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  40.15 
 
 		 594 aa  334  3e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  35.07 
 
 		 609 aa  333  6e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  37.21 
 
 		 629 aa  332  8e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  35.19 
 
 		 614 aa  332  9e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  34.79 
 
 		 626 aa  331  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  38.63 
 
 		 594 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  35.5 
 
 		 607 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  38.05 
 
 		 591 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  35.5 
 
 		 607 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 		 594 aa  330  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  38.45 
 
 		 594 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  35.86 
 
 		 585 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  31.83 
 
 		 666 aa  329  7e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  34.19 
 
 		 613 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  36.23 
 
 		 625 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  36.09 
 
 		 615 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  38.49 
 
 		 594 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  34.06 
 
 		 591 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  33.86 
 
 		 644 aa  327  3e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  36.25 
 
 		 613 aa  327  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  36.5 
 
 		 610 aa  327  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  34.8 
 
 		 607 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  38.08 
 
 		 594 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  37.89 
 
 		 594 aa  327  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  37.89 
 
 		 594 aa  327  5e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  37.89 
 
 		 594 aa  327  5e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  37.89 
 
 		 594 aa  326  6e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  34.49 
 
 		 603 aa  326  6e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  37.89 
 
 		 594 aa  326  6e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  35.55 
 
 		 613 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  37.73 
 
 		 595 aa  326  8.000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  34.76 
 
 		 607 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  31.31 
 
 		 656 aa  325  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  34.98 
 
 		 607 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  33.45 
 
 		 653 aa  325  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  34.97 
 
 		 617 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  34.97 
 
 		 617 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  33.09 
 
 		 608 aa  324  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  33.09 
 
 		 623 aa  323  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  37.61 
 
 		 593 aa  323  4e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  36.03 
 
 		 598 aa  323  4e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  37.61 
 
 		 593 aa  323  4e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  33.62 
 
 		 666 aa  323  5e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  36.07 
 
 		 612 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  30.76 
 
 		 707 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  37.79 
 
 		 615 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  37.45 
 
 		 596 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  30.42 
 
 		 707 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>