More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0175 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  53.52 
 
 		 603 aa  639    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  51.51 
 
 		 602 aa  640    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  100 
 
 		 596 aa  1228    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  52.16 
 
 		 596 aa  609  1e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  50.26 
 
 		 596 aa  598  1e-170  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  49.92 
 
 		 598 aa  595  1e-169  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  51.38 
 
 		 597 aa  592  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0387  excinuclease ABC, C subunit  48.31 
 
 		 598 aa  553  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.971851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  46.89 
 
 		 615 aa  548  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  45.76 
 
 		 599 aa  533  1e-150  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0859  hypothetical protein  43.81 
 
 		 598 aa  474  1e-132  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  39.87 
 
 		 619 aa  438  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  39.64 
 
 		 631 aa  435  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  38.37 
 
 		 616 aa  429  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  38.81 
 
 		 615 aa  428  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  38.22 
 
 		 628 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  38.34 
 
 		 627 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  38.61 
 
 		 629 aa  414  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  36.89 
 
 		 628 aa  404  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  38.52 
 
 		 607 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  37.58 
 
 		 610 aa  395  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  35.43 
 
 		 641 aa  365  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  35.46 
 
 		 624 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  34.4 
 
 		 604 aa  362  8e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  37.03 
 
 		 594 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  37.03 
 
 		 594 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  37.03 
 
 		 594 aa  361  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  37.03 
 
 		 594 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  37.03 
 
 		 594 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  37.67 
 
 		 591 aa  360  4e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  36.86 
 
 		 594 aa  359  9e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  35.47 
 
 		 628 aa  356  7.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  37.31 
 
 		 596 aa  356  7.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  36.69 
 
 		 594 aa  355  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  34.18 
 
 		 611 aa  354  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  37.29 
 
 		 594 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  35.56 
 
 		 613 aa  352  8.999999999999999e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  36.86 
 
 		 594 aa  352  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  37.93 
 
 		 593 aa  351  2e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  36.69 
 
 		 594 aa  351  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  31.83 
 
 		 614 aa  351  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  36.04 
 
 		 594 aa  350  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  35.28 
 
 		 644 aa  350  6e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  35.84 
 
 		 590 aa  349  9e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  33.07 
 
 		 659 aa  348  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  33.44 
 
 		 613 aa  346  6e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  34.88 
 
 		 593 aa  346  7e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  34.88 
 
 		 593 aa  346  7e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1060  excinuclease ABC subunit C  34.71 
 
 		 658 aa  345  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41739  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  34.99 
 
 		 613 aa  343  4e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  36.3 
 
 		 594 aa  343  5e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09791  excinuclease ABC subunit C  35.08 
 
 		 652 aa  343  5e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  38.36 
 
 		 527 aa  343  5e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09771  excinuclease ABC subunit C  35.08 
 
 		 652 aa  343  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  34.98 
 
 		 588 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  31.88 
 
 		 656 aa  341  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  32.89 
 
 		 622 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  32.85 
 
 		 666 aa  340  5.9999999999999996e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  37.25 
 
 		 527 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0854  excinuclease ABC subunit C  38.5 
 
 		 526 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  32.13 
 
 		 684 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  36.7 
 
 		 595 aa  337  5e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  33.06 
 
 		 601 aa  336  9e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0918  excinuclease ABC subunit C  34.82 
 
 		 652 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.312337  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  34.72 
 
 		 599 aa  335  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  34.98 
 
 		 682 aa  334  3e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  33.88 
 
 		 591 aa  333  4e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  32.29 
 
 		 675 aa  333  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  36.65 
 
 		 519 aa  333  6e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  32.27 
 
 		 638 aa  333  6e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  33.39 
 
 		 616 aa  332  9e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  35.42 
 
 		 620 aa  332  9e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  34.75 
 
 		 644 aa  332  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  32.79 
 
 		 627 aa  331  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  33.17 
 
 		 617 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  33.87 
 
 		 647 aa  330  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  33.17 
 
 		 617 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1975  excinuclease ABC subunit C  33.17 
 
 		 653 aa  330  6e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  35.26 
 
 		 620 aa  330  6e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  32.57 
 
 		 607 aa  330  6e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  33.56 
 
 		 610 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  35.49 
 
 		 603 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1321  excinuclease ABC subunit C  35.99 
 
 		 516 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0107777  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  37.43 
 
 		 520 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  33.44 
 
 		 624 aa  329  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  32.4 
 
 		 607 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  32.75 
 
 		 653 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  33.22 
 
 		 650 aa  327  4.0000000000000003e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  33.67 
 
 		 608 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  33.83 
 
 		 608 aa  327  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  32.87 
 
 		 685 aa  326  6e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  33 
 
 		 607 aa  327  6e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1600  excinuclease ABC subunit C  37.43 
 
 		 527 aa  326  7e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0084899  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  31.66 
 
 		 643 aa  326  8.000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  32.89 
 
 		 622 aa  326  9e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0044  excinuclease ABC, C subunit  34.32 
 
 		 613 aa  325  1e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.101531  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  31.82 
 
 		 671 aa  325  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  32.47 
 
 		 625 aa  325  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  32.72 
 
 		 608 aa  325  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  32.72 
 
 		 623 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0363417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>