More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0387 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  53.24 
 
 		 599 aa  643    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  52.17 
 
 		 615 aa  636    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  58.94 
 
 		 597 aa  730    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  51.67 
 
 		 603 aa  656    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  52.33 
 
 		 602 aa  658    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0387  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 		 598 aa  1226    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.971851 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  58.94 
 
 		 596 aa  727    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  54.61 
 
 		 598 aa  688    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  50.6 
 
 		 596 aa  609  1e-173  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  48.31 
 
 		 596 aa  566  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  42.95 
 
 		 616 aa  491  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0859  hypothetical protein  44.2 
 
 		 598 aa  484  1e-135  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  40.54 
 
 		 619 aa  475  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  41.35 
 
 		 631 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  38.66 
 
 		 628 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  40.07 
 
 		 629 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  40.27 
 
 		 627 aa  451  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  37.82 
 
 		 628 aa  442  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  38.31 
 
 		 615 aa  431  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  37.95 
 
 		 607 aa  420  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  35.37 
 
 		 624 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  39.29 
 
 		 591 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  35.02 
 
 		 610 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  38.7 
 
 		 590 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  35.3 
 
 		 641 aa  378  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  37.77 
 
 		 594 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  37.77 
 
 		 594 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  37.77 
 
 		 594 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  37.77 
 
 		 594 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  34.45 
 
 		 588 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  37.77 
 
 		 594 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  37.44 
 
 		 594 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  37.44 
 
 		 594 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  37.6 
 
 		 594 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  31.07 
 
 		 614 aa  363  5.0000000000000005e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  37.27 
 
 		 594 aa  361  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  37.54 
 
 		 594 aa  361  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  33.61 
 
 		 613 aa  360  3e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  32.51 
 
 		 604 aa  359  8e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  33.39 
 
 		 653 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  36.35 
 
 		 596 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  33.55 
 
 		 622 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  35.17 
 
 		 610 aa  352  8e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  35.28 
 
 		 620 aa  352  8e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  35.28 
 
 		 620 aa  352  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  32.42 
 
 		 666 aa  351  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  34.65 
 
 		 613 aa  350  4e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  34.88 
 
 		 595 aa  350  4e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  35.5 
 
 		 593 aa  349  9e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  37.26 
 
 		 594 aa  347  4e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  31.66 
 
 		 607 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  37.11 
 
 		 519 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  31.76 
 
 		 611 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  32.46 
 
 		 609 aa  343  5e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  36.48 
 
 		 520 aa  343  7e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  32.38 
 
 		 685 aa  341  2e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  32.55 
 
 		 647 aa  341  2e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  31.98 
 
 		 675 aa  340  5e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  36.29 
 
 		 593 aa  340  5.9999999999999996e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  36.29 
 
 		 593 aa  340  5.9999999999999996e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  32.1 
 
 		 641 aa  339  7e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  31.13 
 
 		 656 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  32.05 
 
 		 599 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  33.22 
 
 		 708 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  32.17 
 
 		 625 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  32.72 
 
 		 650 aa  337  5e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  35.68 
 
 		 594 aa  335  9e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  32.17 
 
 		 607 aa  335  1e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  32.32 
 
 		 665 aa  335  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  31.89 
 
 		 607 aa  335  1e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  30.69 
 
 		 671 aa  335  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  32.67 
 
 		 669 aa  335  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  31.74 
 
 		 628 aa  335  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  32 
 
 		 677 aa  335  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  31.56 
 
 		 624 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  33.23 
 
 		 658 aa  333  5e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  31.75 
 
 		 670 aa  333  6e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  32.17 
 
 		 607 aa  332  1e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  32.37 
 
 		 613 aa  332  1e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  33.06 
 
 		 604 aa  332  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  31.71 
 
 		 617 aa  331  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  33.28 
 
 		 612 aa  331  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  33.49 
 
 		 682 aa  331  3e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  33.44 
 
 		 615 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  30.89 
 
 		 649 aa  330  5.0000000000000004e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  33.5 
 
 		 599 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0845  excinuclease ABC, C subunit  32.05 
 
 		 620 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.866518  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  34.33 
 
 		 517 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1997  excinuclease ABC subunit C  33.28 
 
 		 644 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.657306 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  31.91 
 
 		 601 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  30.44 
 
 		 693 aa  328  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  31.43 
 
 		 649 aa  327  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  32.67 
 
 		 614 aa  327  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  32.13 
 
 		 647 aa  326  7e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  31.23 
 
 		 658 aa  326  8.000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  31.47 
 
 		 646 aa  326  8.000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  31.03 
 
 		 638 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  30.34 
 
 		 613 aa  325  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  32.23 
 
 		 612 aa  324  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  32.23 
 
 		 604 aa  324  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>