More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1161 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
520 aa  1063    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  55.15 
 
 
519 aa  595  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  55.04 
 
 
517 aa  581  1e-164  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1822  excinuclease ABC subunit C  52.62 
 
 
521 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201866  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1321  excinuclease ABC subunit C  53.79 
 
 
516 aa  569  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0107777  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  52.66 
 
 
527 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0854  excinuclease ABC subunit C  52.76 
 
 
526 aa  558  1e-158  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  52.47 
 
 
527 aa  556  1e-157  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1600  excinuclease ABC subunit C  51.9 
 
 
527 aa  555  1e-157  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0084899  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  51.92 
 
 
520 aa  551  1e-155  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  41.33 
 
 
607 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  42.65 
 
 
616 aa  391  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  39.49 
 
 
619 aa  388  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  39.78 
 
 
627 aa  385  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  37.43 
 
 
628 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1103  excinuclease ABC subunit C  38.67 
 
 
528 aa  380  1e-104  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 
631 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  38.66 
 
 
628 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  39.19 
 
 
601 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  42.04 
 
 
615 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  36.43 
 
 
624 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 
629 aa  360  3e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  38.73 
 
 
604 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  41.06 
 
 
614 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  37.36 
 
 
599 aa  355  1e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  37.82 
 
 
596 aa  352  1e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  37.59 
 
 
626 aa  350  3e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  35.99 
 
 
613 aa  345  8.999999999999999e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  39.37 
 
 
591 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  37.15 
 
 
652 aa  343  4e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  39.29 
 
 
594 aa  343  4e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  36.75 
 
 
622 aa  343  4e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  38.24 
 
 
607 aa  343  4e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  38.89 
 
 
636 aa  342  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  35.78 
 
 
591 aa  341  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  38.81 
 
 
594 aa  341  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  36.6 
 
 
598 aa  341  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  36.46 
 
 
607 aa  341  2e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  37.48 
 
 
599 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  36.91 
 
 
597 aa  340  2.9999999999999998e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  36.7 
 
 
588 aa  340  4e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  38.88 
 
 
596 aa  340  5e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  38.5 
 
 
594 aa  340  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  36.94 
 
 
620 aa  339  5.9999999999999996e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  38.62 
 
 
594 aa  339  7e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  36.1 
 
 
607 aa  339  9e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  38.88 
 
 
594 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  38.5 
 
 
594 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  38.5 
 
 
594 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  38.5 
 
 
594 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  36.1 
 
 
607 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  38.5 
 
 
594 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  38.5 
 
 
594 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  37.83 
 
 
610 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  36.94 
 
 
620 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  37.76 
 
 
590 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  36.62 
 
 
593 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  39.67 
 
 
613 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  36.31 
 
 
611 aa  336  5e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  38.06 
 
 
595 aa  335  9e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  35.53 
 
 
685 aa  335  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  36.07 
 
 
598 aa  334  2e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  37.41 
 
 
612 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  33.51 
 
 
658 aa  333  5e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  37.8 
 
 
603 aa  333  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0044  excinuclease ABC, C subunit  37.11 
 
 
613 aa  332  8e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.101531  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  36.95 
 
 
596 aa  331  2e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  38.17 
 
 
604 aa  330  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  37.06 
 
 
593 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  37.06 
 
 
593 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  37.48 
 
 
611 aa  330  3e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  32.83 
 
 
671 aa  330  3e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  34.55 
 
 
656 aa  330  4e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  36.66 
 
 
602 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  36.62 
 
 
609 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  37.04 
 
 
593 aa  327  3e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  37.7 
 
 
615 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  34.44 
 
 
613 aa  325  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  36.65 
 
 
608 aa  325  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  35.96 
 
 
599 aa  324  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  33.73 
 
 
707 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  36.65 
 
 
623 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  36.94 
 
 
605 aa  323  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  34.94 
 
 
625 aa  323  4e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  33.56 
 
 
707 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  37.7 
 
 
649 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  37.87 
 
 
603 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  32.81 
 
 
641 aa  321  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  35.11 
 
 
614 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  33.39 
 
 
707 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  36.01 
 
 
594 aa  320  6e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  35.36 
 
 
610 aa  320  6e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  37.7 
 
 
623 aa  319  6e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2640  excinuclease ABC subunit C  36.38 
 
 
579 aa  318  1e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.347112  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  33.68 
 
 
666 aa  318  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  34.05 
 
 
708 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  32.5 
 
 
679 aa  315  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  34.94 
 
 
607 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  32.92 
 
 
649 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  35.12 
 
 
607 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>