More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0581 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1014  excinuclease ABC subunit C  53.5 
 
 		 700 aa  707    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00594805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2845  excinuclease ABC subunit C  53.57 
 
 		 762 aa  706    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2175  excinuclease ABC subunit C  60.89 
 
 		 688 aa  793    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0581  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 687 aa  1393    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9728  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  53.66 
 
 		 636 aa  336  7.999999999999999e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  33.72 
 
 		 613 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  31.69 
 
 		 675 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1391  excinuclease ABC, C subunit  51.7 
 
 		 605 aa  308  3e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  32.12 
 
 		 619 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  30.96 
 
 		 652 aa  303  6.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  31.27 
 
 		 676 aa  303  9e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  31.27 
 
 		 676 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  31.27 
 
 		 676 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2550  excinuclease ABC, C subunit  31.61 
 
 		 675 aa  288  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295738  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  31.03 
 
 		 643 aa  288  2.9999999999999996e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  29.51 
 
 		 658 aa  283  1e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0851  excinuclease ABC subunit C  30.25 
 
 		 740 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00444649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3241  excinuclease ABC, C subunit  30.97 
 
 		 607 aa  280  6e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0161382  hitchhiker  0.00210477 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0815  excinuclease ABC, C subunit  27.2 
 
 		 780 aa  280  6e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  30.87 
 
 		 599 aa  277  4e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  43.53 
 
 		 612 aa  276  6e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  29.44 
 
 		 693 aa  276  9e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20070  Excinuclease ABC subunit C  29.99 
 
 		 703 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0431256  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  30.35 
 
 		 674 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0663  excinuclease ABC subunit C  29.54 
 
 		 681 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.912465  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1143  excinuclease ABC subunit C  29.54 
 
 		 681 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1101  excinuclease ABC subunit C  29.59 
 
 		 682 aa  271  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  46.8 
 
 		 677 aa  271  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2488  excinuclease ABC subunit C  42.3 
 
 		 716 aa  270  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820608  normal  0.0424579 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1932  excinuclease ABC subunit C  30.63 
 
 		 692 aa  269  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0596454 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2700  excinuclease ABC subunit C  29.85 
 
 		 685 aa  269  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4255  excinuclease ABC subunit C  29.67 
 
 		 677 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3071  excinuclease ABC subunit C  30.88 
 
 		 666 aa  266  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  41.29 
 
 		 707 aa  261  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1095  excinuclease ABC subunit C  29.44 
 
 		 753 aa  260  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  42.68 
 
 		 641 aa  259  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  45.05 
 
 		 613 aa  259  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  40.5 
 
 		 707 aa  258  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  43.46 
 
 		 604 aa  257  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2623  excinuclease ABC subunit C  30.01 
 
 		 657 aa  257  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.313972  normal  0.0935336 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  40.11 
 
 		 707 aa  256  8e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  40.43 
 
 		 624 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1185  excinuclease ABC subunit C  29.6 
 
 		 657 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003099  excinuclease ABC subunit C  29.39 
 
 		 588 aa  252  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000908036  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  42.81 
 
 		 614 aa  253  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  42.76 
 
 		 626 aa  252  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2244  excinuclease ABC subunit C  29.12 
 
 		 671 aa  249  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  36.63 
 
 		 615 aa  248  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0423  excinuclease ABC, C subunit  30.14 
 
 		 618 aa  246  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  35.82 
 
 		 625 aa  243  9e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  39.01 
 
 		 617 aa  243  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  42.02 
 
 		 609 aa  240  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  40.82 
 
 		 598 aa  239  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  39.08 
 
 		 601 aa  239  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  42.71 
 
 		 608 aa  238  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  43.97 
 
 		 617 aa  237  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  42.18 
 
 		 608 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  39.12 
 
 		 639 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  41.32 
 
 		 607 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5066  excinuclease ABC, C subunit  42.72 
 
 		 689 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  42.26 
 
 		 649 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1276  excinuclease ABC subunit C  41.89 
 
 		 609 aa  234  4.0000000000000004e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00138903  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1334  excinuclease ABC subunit C  41.89 
 
 		 609 aa  234  4.0000000000000004e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000285239  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  40.58 
 
 		 653 aa  234  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  39.29 
 
 		 609 aa  234  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  38.85 
 
 		 613 aa  234  6e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  38.76 
 
 		 679 aa  233  9e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  42.28 
 
 		 607 aa  233  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  39.51 
 
 		 644 aa  233  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  37.19 
 
 		 620 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  42.71 
 
 		 607 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  33.91 
 
 		 613 aa  231  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  43.75 
 
 		 607 aa  231  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  36.88 
 
 		 620 aa  231  3e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  41.75 
 
 		 623 aa  231  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  40.89 
 
 		 614 aa  230  6e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  43.06 
 
 		 607 aa  230  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0845  excinuclease ABC, C subunit  42.77 
 
 		 620 aa  230  7e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.866518  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  43.06 
 
 		 607 aa  230  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  37.74 
 
 		 607 aa  230  8e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  41.97 
 
 		 610 aa  229  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  38.58 
 
 		 609 aa  228  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  40.93 
 
 		 588 aa  226  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  39.68 
 
 		 636 aa  226  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  42.18 
 
 		 607 aa  226  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  39.49 
 
 		 591 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  40.66 
 
 		 626 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  37.89 
 
 		 611 aa  224  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  41.67 
 
 		 607 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1803  excinuclease ABC, C subunit  38.94 
 
 		 657 aa  223  8e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0340936  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  38.99 
 
 		 658 aa  223  8e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0428  excinuclease ABC subunit C  29.7 
 
 		 746 aa  223  9e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  41.18 
 
 		 619 aa  223  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0046  excinuclease ABC subunit C  39.67 
 
 		 629 aa  223  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.714841  hitchhiker  0.00962006 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  36.84 
 
 		 671 aa  222  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  39.61 
 
 		 585 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  37.99 
 
 		 660 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  37.27 
 
 		 608 aa  221  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  38.08 
 
 		 623 aa  221  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2454  excinuclease ABC subunit C  39.16 
 
 		 609 aa  221  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.263996  normal  0.543932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>