More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1095 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1071  excinuclease ABC subunit C  65.56 
 
 		 654 aa  918    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000538512  normal  0.216036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2244  excinuclease ABC subunit C  64.39 
 
 		 663 aa  898    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4255  excinuclease ABC subunit C  78.1 
 
 		 677 aa  1138    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1932  excinuclease ABC subunit C  56.22 
 
 		 692 aa  760    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0596454 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0936  excinuclease ABC subunit C  64.19 
 
 		 657 aa  895    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.581594  normal  0.110547 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1739  excinuclease ABC subunit C  76.79 
 
 		 742 aa  1115    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00965022  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1101  excinuclease ABC subunit C  78.78 
 
 		 682 aa  1129    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  78.5 
 
 		 674 aa  1139    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2244  excinuclease ABC subunit C  56.14 
 
 		 671 aa  726    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208869  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0851  excinuclease ABC subunit C  84.71 
 
 		 740 aa  1202    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00444649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3071  excinuclease ABC subunit C  57.38 
 
 		 666 aa  796    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1095  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 753 aa  1538    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1185  excinuclease ABC subunit C  57.75 
 
 		 657 aa  784    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2877  excinuclease ABC subunit C  55.07 
 
 		 650 aa  740    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.776439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2410  excinuclease ABC subunit C  63.99 
 
 		 673 aa  911    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308713  hitchhiker  0.000953685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0663  excinuclease ABC subunit C  78.91 
 
 		 681 aa  1129    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.912465  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2889  excinuclease ABC subunit C  92.27 
 
 		 731 aa  1318    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0288597  normal  0.314719 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1143  excinuclease ABC subunit C  78.91 
 
 		 681 aa  1129    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232911  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2623  excinuclease ABC subunit C  57.89 
 
 		 657 aa  786    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.313972  normal  0.0935336 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1019  excinuclease ABC subunit C  91.12 
 
 		 684 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114773  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1023  excinuclease ABC subunit C  91.12 
 
 		 684 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2456  excinuclease ABC subunit C  89.63 
 
 		 747 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710072  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2829  excinuclease ABC subunit C  89.63 
 
 		 747 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0552  excinuclease ABC subunit C  89.04 
 
 		 749 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344791  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2884  excinuclease ABC subunit C  89.04 
 
 		 749 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2824  excinuclease ABC subunit C  89.63 
 
 		 747 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643024  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1779  excinuclease ABC subunit C  89.63 
 
 		 747 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130591  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2769  excinuclease ABC subunit C  89.63 
 
 		 747 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179229  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1001  excinuclease ABC subunit C  68.12 
 
 		 657 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1783  excinuclease ABC subunit C  68.77 
 
 		 653 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0415  excinuclease ABC, C subunit  60.6 
 
 		 620 aa  423  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263018  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1627  excinuclease ABC subunit C  64.38 
 
 		 649 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1664  excinuclease ABC subunit C  64.27 
 
 		 670 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1960  excinuclease ABC subunit C  63.84 
 
 		 673 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0403452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0423  excinuclease ABC, C subunit  57.89 
 
 		 618 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2700  excinuclease ABC subunit C  63.61 
 
 		 685 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  58.86 
 
 		 605 aa  376  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  60.98 
 
 		 599 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  59.22 
 
 		 603 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1271  excinuclease ABC subunit C  60.96 
 
 		 606 aa  365  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  60.21 
 
 		 598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0428  excinuclease ABC subunit C  32.12 
 
 		 746 aa  327  6e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  51.19 
 
 		 611 aa  307  6e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  51.72 
 
 		 609 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  51.84 
 
 		 613 aa  303  6.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  49.31 
 
 		 612 aa  298  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  52.48 
 
 		 607 aa  298  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  51.59 
 
 		 607 aa  297  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  51.06 
 
 		 608 aa  296  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  51.59 
 
 		 607 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  52.14 
 
 		 607 aa  295  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  50.88 
 
 		 607 aa  295  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  51.42 
 
 		 608 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  51.24 
 
 		 607 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  49.66 
 
 		 607 aa  293  8e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  50.18 
 
 		 607 aa  293  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  48.81 
 
 		 626 aa  292  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  50.17 
 
 		 619 aa  292  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2151  excinuclease ABC subunit C  48.93 
 
 		 609 aa  291  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  49.82 
 
 		 607 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0659  excinuclease ABC subunit C  47.16 
 
 		 609 aa  290  5.0000000000000004e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.25379  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2140  excinuclease ABC subunit C  46.62 
 
 		 608 aa  290  6e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.604529  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  46.39 
 
 		 599 aa  290  7e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  46.64 
 
 		 609 aa  290  8e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1803  excinuclease ABC, C subunit  48.61 
 
 		 657 aa  288  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0340936  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  32.47 
 
 		 636 aa  288  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  29.27 
 
 		 624 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2454  excinuclease ABC subunit C  47.33 
 
 		 609 aa  287  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.263996  normal  0.543932 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1403  excinuclease ABC subunit C  48.75 
 
 		 614 aa  284  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.252536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  46.13 
 
 		 610 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  46.13 
 
 		 610 aa  283  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  46.13 
 
 		 610 aa  283  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1825  excinuclease ABC subunit C  47.02 
 
 		 609 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.088783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  52.87 
 
 		 585 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  46.13 
 
 		 610 aa  283  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  46.32 
 
 		 617 aa  283  8.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  46.48 
 
 		 610 aa  283  9e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  46.13 
 
 		 610 aa  283  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  45.77 
 
 		 610 aa  282  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  46.13 
 
 		 610 aa  282  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  46.13 
 
 		 610 aa  283  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  46.2 
 
 		 623 aa  282  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  46.32 
 
 		 617 aa  283  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  45.77 
 
 		 610 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  46.13 
 
 		 610 aa  283  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  46.13 
 
 		 610 aa  283  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  47.42 
 
 		 608 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1608  excinuclease ABC subunit C  46.45 
 
 		 606 aa  281  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00130294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  44.52 
 
 		 627 aa  281  4e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0834  excinuclease ABC subunit C  45.2 
 
 		 610 aa  281  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000370037  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  45.77 
 
 		 610 aa  280  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  45.36 
 
 		 609 aa  280  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3241  excinuclease ABC, C subunit  47.14 
 
 		 607 aa  280  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0161382  hitchhiker  0.00210477 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  43.89 
 
 		 621 aa  279  1e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2316  excinuclease ABC subunit C  48.75 
 
 		 645 aa  279  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.682688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2500  excinuclease ABC subunit C  46.1 
 
 		 607 aa  278  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000123696  normal  0.60847 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2013  excinuclease ABC subunit C  48.75 
 
 		 614 aa  276  8e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.117598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0581  excinuclease ABC subunit C  30.28 
 
 		 687 aa  276  8e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9728  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003099  excinuclease ABC subunit C  46.95 
 
 		 588 aa  276  9e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000908036  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0420  excinuclease ABC subunit C  49.12 
 
 		 620 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000882939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>